More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1552 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1552  lipoyl synthase  100 
 
 
368 aa  758    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3791  lipoyl synthase  77.43 
 
 
350 aa  552  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2373  lipoyl synthase  77.58 
 
 
348 aa  550  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1586  lipoyl synthase  68.03 
 
 
331 aa  453  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.426522  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0810  lipoyl synthase  66.46 
 
 
329 aa  445  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0781  lipoyl synthase  66.46 
 
 
329 aa  444  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  66.06 
 
 
334 aa  439  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1771  lipoic acid synthetase  62 
 
 
324 aa  384  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0949549  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  61.15 
 
 
328 aa  380  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0833  lipoic acid synthetase  58.96 
 
 
335 aa  377  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1828  lipoyl synthase  55.94 
 
 
326 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2102  lipoyl synthase  55.94 
 
 
326 aa  325  5e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2032  lipoyl synthase  55.94 
 
 
326 aa  325  6e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1992  lipoyl synthase  56.01 
 
 
294 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86231  Lipoic acid synthetase, mitochondrial precursor (Lip-syn) (Lipoate synthase)  53.31 
 
 
398 aa  311  7.999999999999999e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  50.89 
 
 
299 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0672  lipoyl synthase  53.38 
 
 
308 aa  308  6.999999999999999e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.61797  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1406  lipoyl synthase  53.74 
 
 
291 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0645546 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28652  predicted protein  52.07 
 
 
314 aa  305  6e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.105937  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31232  predicted protein  54.48 
 
 
324 aa  305  9.000000000000001e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0267092  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  50.89 
 
 
297 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  51.25 
 
 
287 aa  301  1e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  54.55 
 
 
321 aa  300  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32294  predicted protein  51.39 
 
 
399 aa  299  6e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_09486  lipoic acid synthetase precursor (AFU_orthologue; AFUA_3G06560)  50.34 
 
 
413 aa  298  9e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.588005 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  51.06 
 
 
308 aa  295  6e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1184  lipoyl synthase  52.76 
 
 
296 aa  295  8e-79  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0667385  normal  0.0581993 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18029  predicted protein  47.85 
 
 
401 aa  294  1e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.187612  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2099  lipoyl synthase  52.26 
 
 
312 aa  295  1e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.350407  normal  0.100135 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04340  conserved hypothetical protein  52.2 
 
 
395 aa  293  3e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  50.71 
 
 
314 aa  292  6e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  50.71 
 
 
351 aa  291  9e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  52.71 
 
 
298 aa  290  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  49.65 
 
 
321 aa  290  3e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  53.76 
 
 
328 aa  290  3e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1669  lipoic acid synthetase  51.37 
 
 
321 aa  288  8e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  45.86 
 
 
355 aa  286  2.9999999999999996e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  49.1 
 
 
299 aa  286  4e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1029  lipoyl synthase  53.07 
 
 
314 aa  286  4e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2226  lipoyl synthase  48.76 
 
 
315 aa  285  5.999999999999999e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0487133  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  49.28 
 
 
298 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  50.54 
 
 
337 aa  285  8e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  48.67 
 
 
329 aa  284  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  51.26 
 
 
303 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  51.26 
 
 
303 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  49.28 
 
 
298 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  50.71 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  47.84 
 
 
298 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  48.38 
 
 
288 aa  283  5.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  47.84 
 
 
325 aa  281  1e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4149  lipoic acid synthetase  50 
 
 
311 aa  281  1e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2841  lipoyl synthase  45.25 
 
 
319 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176893  hitchhiker  0.000447826 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3599  lipoic acid synthetase  49.32 
 
 
320 aa  280  2e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  49.64 
 
 
305 aa  281  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  49.64 
 
 
325 aa  281  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  50 
 
 
322 aa  280  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1252  lipoyl synthase  49.3 
 
 
328 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  49.29 
 
 
325 aa  281  2e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  49.64 
 
 
305 aa  281  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  45.98 
 
 
318 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  50 
 
 
304 aa  280  3e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  50 
 
 
292 aa  280  3e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  47.12 
 
 
298 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  47.12 
 
 
298 aa  280  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  48.99 
 
 
323 aa  280  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  47.12 
 
 
298 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1092  lipoyl synthase  50.52 
 
 
312 aa  280  3e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00219878  hitchhiker  0.00000000000266656 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  47.12 
 
 
298 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  47.12 
 
 
298 aa  280  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1575  lipoyl synthase  48.56 
 
 
290 aa  280  4e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00830336  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  47.12 
 
 
298 aa  279  4e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  47.12 
 
 
298 aa  279  4e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  47.48 
 
 
298 aa  280  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  47.12 
 
 
298 aa  280  4e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  47.12 
 
 
298 aa  279  4e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  47.8 
 
 
330 aa  279  5e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  49.82 
 
 
320 aa  279  5e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0504  lipoyl synthase  49.28 
 
 
282 aa  278  7e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.354667 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0899  lipoic acid synthetase  49.09 
 
 
285 aa  278  8e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  47.29 
 
 
290 aa  278  8e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  44.81 
 
 
314 aa  278  8e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0467  lipoyl synthase  44.55 
 
 
321 aa  278  9e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00091244  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  50.9 
 
 
324 aa  278  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1921  lipoyl synthase  47.7 
 
 
310 aa  278  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0537683  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  47.57 
 
 
338 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  47.57 
 
 
338 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  47.57 
 
 
338 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  47.84 
 
 
297 aa  277  2e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  48.31 
 
 
323 aa  277  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  47.57 
 
 
338 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0899  lipoyl synthase  46.26 
 
 
347 aa  277  2e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.322339 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2644  lipoyl synthase  51.11 
 
 
276 aa  278  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00597  lipoyl synthase  45.16 
 
 
321 aa  277  3e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3017  lipoyl synthase  45.16 
 
 
321 aa  277  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0056635  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  46.57 
 
 
291 aa  276  3e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0599  lipoyl synthase  48.97 
 
 
373 aa  276  3e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0992056  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0679  lipoyl synthase  45.16 
 
 
321 aa  277  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215695  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0648  lipoyl synthase  45.16 
 
 
321 aa  277  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.017557  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00586  hypothetical protein  45.16 
 
 
321 aa  277  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3202  lipoyl synthase  47.48 
 
 
292 aa  277  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>