More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1919 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1919  lipoyl synthase  100 
 
 
320 aa  658    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0160088  decreased coverage  0.000217018 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2299  lipoyl synthase  78.14 
 
 
316 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2640  Lipoyl synthase  77.45 
 
 
309 aa  505  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0291657  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1266  lipoic acid synthetase  76.87 
 
 
308 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0917009  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3288  lipoyl synthase  74.76 
 
 
333 aa  502  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0066599 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3561  lipoyl synthase  77.7 
 
 
329 aa  501  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4266  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3099  lipoic acid synthetase  76.32 
 
 
305 aa  503  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244326  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3328  lipoyl synthase  78.03 
 
 
331 aa  500  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0213262  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1513  lipoic acid synthetase  77.4 
 
 
341 aa  495  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.647542  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4893  lipoic acid synthetase  74.43 
 
 
311 aa  496  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1340  lipoyl synthase  73.62 
 
 
334 aa  495  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3327  lipoyl synthase  74.27 
 
 
325 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0977769 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0991  lipoyl synthase  74.03 
 
 
312 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0386773  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3316  lipoyl synthase  74.27 
 
 
325 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3378  lipoyl synthase  74.27 
 
 
325 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2109  lipoic acid synthetase  73.29 
 
 
337 aa  490  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.126752  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1598  lipoyl synthase  74.58 
 
 
339 aa  488  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000295116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7406  lipoyl synthase  77 
 
 
323 aa  490  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0533  lipoyl synthase  74.58 
 
 
347 aa  488  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3077  lipoic acid synthetase  74.43 
 
 
342 aa  490  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0062  lipoyl synthase  74.25 
 
 
335 aa  488  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1858  lipoyl synthase  72.64 
 
 
332 aa  486  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1774  lipoyl synthase  73.11 
 
 
328 aa  486  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10420  lipoyl synthase  73.44 
 
 
333 aa  486  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171036  normal  0.0249814 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0939  lipoic acid synthetase  72.4 
 
 
317 aa  484  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.0375608 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2932  lipoyl synthase  72.4 
 
 
317 aa  486  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1604  lipoyl synthase  74.25 
 
 
335 aa  487  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159499  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2035  lipoic acid synthetase  71.34 
 
 
333 aa  481  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.616606  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3370  lipoic acid synthetase  72.46 
 
 
324 aa  483  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0914  lipoyl synthase  73.51 
 
 
306 aa  481  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455502  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12246  lipoyl synthase  71.38 
 
 
311 aa  480  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.401424  normal  0.699705 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3582  lipoyl synthase  72.94 
 
 
332 aa  478  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342819  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3138  lipoyl synthase  71.05 
 
 
333 aa  474  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718204  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15400  lipoate synthase  71.02 
 
 
333 aa  477  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1481  lipoyl synthase  70.03 
 
 
339 aa  464  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.527679  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0926  lipoyl synthase  69.38 
 
 
323 aa  454  1e-127  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.546117  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13370  lipoyl synthase  68.75 
 
 
335 aa  457  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.957716  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3323  lipoyl synthase  66.45 
 
 
308 aa  451  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.842671  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16470  lipoyl synthase  67.22 
 
 
340 aa  442  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.523399  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16380  lipoyl synthase  66.45 
 
 
340 aa  436  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0443181  normal  0.259676 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  47.87 
 
 
321 aa  296  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  50.18 
 
 
303 aa  296  3e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  50.18 
 
 
303 aa  296  3e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  48.91 
 
 
291 aa  292  5e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  47.57 
 
 
304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  47.32 
 
 
325 aa  286  4e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1084  lipoyl synthase  48.7 
 
 
291 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  47 
 
 
351 aa  281  7.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  48.35 
 
 
298 aa  281  7.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  47.25 
 
 
321 aa  282  7.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  48.16 
 
 
328 aa  280  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  47.31 
 
 
308 aa  280  3e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  48.42 
 
 
328 aa  278  1e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  45.49 
 
 
302 aa  275  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3202  lipoyl synthase  45.59 
 
 
292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  47.02 
 
 
318 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  48.29 
 
 
315 aa  273  3e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  46.03 
 
 
314 aa  273  3e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  48.29 
 
 
315 aa  272  4.0000000000000004e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  45.58 
 
 
355 aa  271  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  46.94 
 
 
535 aa  271  2e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  46.15 
 
 
299 aa  270  2.9999999999999997e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0744  lipoyl synthase  45 
 
 
347 aa  269  4e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0749  lipoyl synthase  45 
 
 
347 aa  269  5.9999999999999995e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.58387  normal  0.798574 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1586  lipoyl synthase  46.83 
 
 
331 aa  269  5.9999999999999995e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.426522  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  44.33 
 
 
298 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1184  lipoyl synthase  48.39 
 
 
296 aa  267  1e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0667385  normal  0.0581993 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  43.99 
 
 
298 aa  268  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  44.33 
 
 
298 aa  268  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2644  lipoyl synthase  50 
 
 
276 aa  268  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0899  lipoyl synthase  44.44 
 
 
347 aa  267  1e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.322339 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  43.99 
 
 
298 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  43.99 
 
 
298 aa  267  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  43.99 
 
 
298 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  43.99 
 
 
298 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  43.99 
 
 
298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  43.99 
 
 
298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  43.99 
 
 
298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1552  lipoyl synthase  46.81 
 
 
368 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  44.33 
 
 
300 aa  266  4e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  45.74 
 
 
329 aa  266  5e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2572  lipoyl synthase  46.21 
 
 
319 aa  265  8e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.085231  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  44.44 
 
 
298 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  44.9 
 
 
323 aa  265  8.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  45.24 
 
 
323 aa  265  8.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  44.69 
 
 
304 aa  265  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  44.86 
 
 
315 aa  264  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  45.26 
 
 
282 aa  264  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  42.91 
 
 
299 aa  263  2e-69  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  46.23 
 
 
320 aa  264  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  45.1 
 
 
298 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2857  lipoyl synthase  46.91 
 
 
319 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  45.1 
 
 
298 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1252  lipoyl synthase  43.64 
 
 
328 aa  263  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  43.07 
 
 
292 aa  262  4e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  46.04 
 
 
325 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  43.38 
 
 
290 aa  262  4.999999999999999e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3189  lipoyl synthase  42.66 
 
 
290 aa  261  8e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.411626  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2824  lipoyl synthase  46.04 
 
 
320 aa  261  8.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1771  lipoic acid synthetase  46.55 
 
 
324 aa  261  1e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0949549  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>