More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1266 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1266  lipoic acid synthetase  100 
 
 
308 aa  633  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0917009  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3099  lipoic acid synthetase  84.21 
 
 
305 aa  542  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244326  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2640  Lipoyl synthase  83.66 
 
 
309 aa  543  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0291657  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3561  lipoyl synthase  81.05 
 
 
329 aa  526  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4266  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3328  lipoyl synthase  81.79 
 
 
331 aa  521  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0213262  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1340  lipoyl synthase  80.07 
 
 
334 aa  518  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4893  lipoic acid synthetase  78.5 
 
 
311 aa  513  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3370  lipoic acid synthetase  78.29 
 
 
324 aa  509  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1858  lipoyl synthase  78.43 
 
 
332 aa  508  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1919  lipoyl synthase  77.81 
 
 
320 aa  504  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0160088  decreased coverage  0.000217018 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0991  lipoyl synthase  79.74 
 
 
312 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0386773  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7406  lipoyl synthase  81 
 
 
323 aa  507  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3288  lipoyl synthase  74.84 
 
 
333 aa  500  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0066599 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10420  lipoyl synthase  78.62 
 
 
333 aa  500  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171036  normal  0.0249814 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2299  lipoyl synthase  77.74 
 
 
316 aa  499  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3378  lipoyl synthase  78.07 
 
 
325 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3327  lipoyl synthase  78.07 
 
 
325 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0977769 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3316  lipoyl synthase  78.07 
 
 
325 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2109  lipoic acid synthetase  77.45 
 
 
337 aa  496  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.126752  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2932  lipoyl synthase  75.49 
 
 
317 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1774  lipoyl synthase  75.33 
 
 
328 aa  491  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0939  lipoic acid synthetase  76.82 
 
 
317 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.0375608 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12246  lipoyl synthase  76.8 
 
 
311 aa  490  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.401424  normal  0.699705 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3582  lipoyl synthase  76.82 
 
 
332 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342819  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1513  lipoic acid synthetase  76.77 
 
 
341 aa  488  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.647542  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2035  lipoic acid synthetase  74.51 
 
 
333 aa  488  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.616606  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15400  lipoate synthase  75.82 
 
 
333 aa  488  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0914  lipoyl synthase  76.49 
 
 
306 aa  488  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455502  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1481  lipoyl synthase  75.42 
 
 
339 aa  482  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.527679  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3077  lipoic acid synthetase  74.83 
 
 
342 aa  482  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3138  lipoyl synthase  74.34 
 
 
333 aa  481  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718204  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0926  lipoyl synthase  76.72 
 
 
323 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.546117  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3323  lipoyl synthase  72.04 
 
 
308 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.842671  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0062  lipoyl synthase  71.29 
 
 
335 aa  466  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1604  lipoyl synthase  71.29 
 
 
335 aa  466  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159499  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0533  lipoyl synthase  70.96 
 
 
347 aa  463  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1598  lipoyl synthase  70.96 
 
 
339 aa  463  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000295116 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13370  lipoyl synthase  70.3 
 
 
335 aa  460  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.957716  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16380  lipoyl synthase  69.64 
 
 
340 aa  447  1e-125  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0443181  normal  0.259676 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16470  lipoyl synthase  67.33 
 
 
340 aa  441  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.523399  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  55.44 
 
 
303 aa  331  1e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  55.44 
 
 
303 aa  331  1e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  53.85 
 
 
321 aa  310  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  49.64 
 
 
291 aa  292  6e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  51.09 
 
 
328 aa  290  2e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  49.82 
 
 
308 aa  288  8e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  48.6 
 
 
304 aa  287  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  46.53 
 
 
321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  47.3 
 
 
318 aa  285  9e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  46.08 
 
 
325 aa  283  2.0000000000000002e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  47.24 
 
 
351 aa  283  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  46.55 
 
 
304 aa  282  6.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1184  lipoyl synthase  51.05 
 
 
296 aa  279  4e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0667385  normal  0.0581993 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  49.08 
 
 
298 aa  279  5e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2644  lipoyl synthase  52.06 
 
 
276 aa  278  1e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1084  lipoyl synthase  49.44 
 
 
291 aa  276  3e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0744  lipoyl synthase  46.07 
 
 
347 aa  276  4e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0749  lipoyl synthase  46.07 
 
 
347 aa  275  6e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.58387  normal  0.798574 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1252  lipoyl synthase  45.67 
 
 
328 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  46.55 
 
 
302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3897  lipoyl synthase  45.36 
 
 
317 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.576703 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  47.08 
 
 
282 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  48.99 
 
 
535 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  47.86 
 
 
298 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  48.03 
 
 
329 aa  274  2.0000000000000002e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  47.86 
 
 
298 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  47.5 
 
 
298 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  47.5 
 
 
298 aa  273  3e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  46.57 
 
 
283 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  47.5 
 
 
298 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  47.5 
 
 
298 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  45.45 
 
 
337 aa  273  3e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  47.5 
 
 
298 aa  273  3e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  47.5 
 
 
298 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  43.97 
 
 
322 aa  272  4.0000000000000004e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  47.5 
 
 
298 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  47.5 
 
 
298 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  48.95 
 
 
298 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  47.86 
 
 
298 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  43.97 
 
 
322 aa  272  5.000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2824  lipoyl synthase  47.84 
 
 
320 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2572  lipoyl synthase  45.96 
 
 
319 aa  272  7e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.085231  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2857  lipoyl synthase  46.18 
 
 
319 aa  271  7e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0527  lipoyl synthase  46.21 
 
 
296 aa  271  9e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5924  lipoyl synthase  47.48 
 
 
320 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1762  lipoyl synthase  48.06 
 
 
296 aa  271  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0164606  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0899  lipoyl synthase  45.16 
 
 
347 aa  270  2e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.322339 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  45.58 
 
 
320 aa  270  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  47.2 
 
 
315 aa  270  2e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  45.85 
 
 
300 aa  270  2e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  47.29 
 
 
355 aa  270  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6533  lipoyl synthase  47.12 
 
 
320 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  46.48 
 
 
309 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  48.6 
 
 
298 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  45.96 
 
 
321 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  47.2 
 
 
315 aa  270  2.9999999999999997e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0743  lipoic acid synthetase  45.85 
 
 
326 aa  269  4e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1439  lipoyl synthase  45.77 
 
 
319 aa  269  4e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.115253  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  48.55 
 
 
314 aa  269  4e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  46.59 
 
 
321 aa  269  5e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.732613 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>