More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0381 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0381  lipoyl synthase  100 
 
 
297 aa  612  9.999999999999999e-175  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.224918  hitchhiker  0.0000000000185759 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  53.19 
 
 
282 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  52.9 
 
 
283 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  52.87 
 
 
309 aa  285  5.999999999999999e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0313  lipoyl synthase  47.69 
 
 
357 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108375  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0242  lipoyl synthase  46.9 
 
 
332 aa  281  7.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0316  lipoyl synthase  46.98 
 
 
339 aa  279  5e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0479875  normal  0.0232399 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1598  lipoyl synthase  46.98 
 
 
318 aa  278  6e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3492  lipoyl synthase  50.18 
 
 
321 aa  278  7e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000891871 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5917  lipoyl synthase  46.18 
 
 
328 aa  277  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1639  lipoyl synthase  46.95 
 
 
337 aa  277  2e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00216295  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  48.21 
 
 
321 aa  277  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0410  lipoyl synthase  47.33 
 
 
326 aa  276  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  49.82 
 
 
355 aa  276  3e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  48.6 
 
 
325 aa  276  3e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3934  lipoyl synthase  47.04 
 
 
338 aa  276  4e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.521126  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0400  lipoyl synthase  48.39 
 
 
291 aa  275  6e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0298  lipoyl synthase  46.26 
 
 
326 aa  275  7e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132518 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0293  lipoyl synthase  46.26 
 
 
326 aa  275  7e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1162  lipoyl synthase  45.74 
 
 
291 aa  275  8e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000484773  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  49.47 
 
 
328 aa  275  8e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1762  lipoyl synthase  46.92 
 
 
296 aa  275  9e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0164606  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0399  lipoyl synthase  48.39 
 
 
291 aa  275  9e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.661131 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2942  lipoyl synthase  49.1 
 
 
321 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000018983  hitchhiker  0.00758797 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0470  lipoyl synthase  46.37 
 
 
332 aa  274  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0362  lipoyl synthase  46.98 
 
 
332 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.297178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  46.85 
 
 
338 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  46.85 
 
 
338 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3156  lipoyl synthase  50.18 
 
 
321 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000010408  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0183  lipoyl synthase  49.11 
 
 
306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.604682  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0504  lipoyl synthase  47.67 
 
 
335 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3442  lipoyl synthase  47.26 
 
 
336 aa  273  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.725492  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  46.45 
 
 
292 aa  274  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0274  lipoyl synthase  48.57 
 
 
311 aa  273  3e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  47.33 
 
 
340 aa  273  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3715  lipoyl synthase  48.75 
 
 
321 aa  273  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00165797  hitchhiker  0.00474747 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1771  lipoic acid synthetase  52.14 
 
 
324 aa  273  3e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0949549  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3757  lipoyl synthase  47.55 
 
 
326 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0485522  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01211  lipoyl synthase  48.39 
 
 
321 aa  272  4.0000000000000004e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4358  lipoyl synthase  46.98 
 
 
335 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383654  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  49.64 
 
 
315 aa  273  4.0000000000000004e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  48.75 
 
 
291 aa  272  4.0000000000000004e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4881  lipoyl synthase  46.26 
 
 
327 aa  272  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  46.5 
 
 
338 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  49.64 
 
 
315 aa  272  5.000000000000001e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3382  lipoic acid synthetase  47.7 
 
 
288 aa  272  6e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4212  lipoyl synthase  47.31 
 
 
334 aa  272  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740031 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  49.43 
 
 
320 aa  272  6e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0217  lipoyl synthase  47.67 
 
 
334 aa  272  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3282  lipoyl synthase  48.39 
 
 
321 aa  271  7e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0177206  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1085  lipoyl synthase  48.39 
 
 
321 aa  271  7e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00323584  hitchhiker  0.0000378022 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3460  lipoyl synthase  48.39 
 
 
321 aa  271  7e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633504  normal  0.0256244 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  46.15 
 
 
338 aa  271  7e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04289  lipoyl synthase  49.11 
 
 
327 aa  271  7e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0599  lipoyl synthase  48.75 
 
 
373 aa  271  8.000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0992056  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004228  lipoate synthase  48.75 
 
 
321 aa  271  9e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000803554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3346  lipoyl synthase  45.04 
 
 
294 aa  270  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0086  lipoyl synthase  45.8 
 
 
331 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  47.31 
 
 
318 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  47.67 
 
 
330 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0061  lipoyl synthase  45.8 
 
 
330 aa  270  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1277  lipoyl synthase  47.52 
 
 
287 aa  270  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3324  lipoyl synthase  48.39 
 
 
321 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0295877  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  48.07 
 
 
320 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2876  lipoyl synthase  48.39 
 
 
321 aa  270  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0754529  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0554  lipoyl synthase  48.75 
 
 
373 aa  270  2e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.86018  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2841  lipoyl synthase  46.59 
 
 
319 aa  270  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176893  hitchhiker  0.000447826 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4818  lipoic acid synthetase  46.62 
 
 
318 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0688  lipoyl synthase  47.67 
 
 
321 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  46.95 
 
 
329 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0748  lipoyl synthase  47.67 
 
 
321 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0734  lipoyl synthase  47.67 
 
 
321 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0674  lipoyl synthase  47.67 
 
 
321 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00338135  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  46.95 
 
 
329 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  46.95 
 
 
329 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  46.95 
 
 
329 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0792  lipoyl synthase  47.67 
 
 
321 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  47.31 
 
 
330 aa  269  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  47.31 
 
 
330 aa  269  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0979  lipoyl synthase  48.03 
 
 
321 aa  269  5e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.464322  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  45.42 
 
 
321 aa  269  5e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  47.31 
 
 
329 aa  269  5e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00597  lipoyl synthase  47.31 
 
 
321 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2998  lipoic acid synthetase  47.31 
 
 
321 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448089  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0716  lipoyl synthase  47.31 
 
 
321 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000187845  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0652  lipoyl synthase  47.31 
 
 
321 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000125268  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0648  lipoyl synthase  47.31 
 
 
321 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.017557  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00586  hypothetical protein  47.31 
 
 
321 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3017  lipoyl synthase  47.31 
 
 
321 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0056635  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0679  lipoyl synthase  47.31 
 
 
321 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215695  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  47.31 
 
 
329 aa  268  7e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  47.31 
 
 
330 aa  268  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  47.31 
 
 
329 aa  268  7e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  47.31 
 
 
329 aa  268  7e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0542  lipoyl synthase  47.31 
 
 
321 aa  268  7e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1086  lipoyl synthase  47.04 
 
 
321 aa  268  7e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2662  lipoyl synthase  49.64 
 
 
281 aa  268  8e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1163  lipoyl synthase  46.95 
 
 
321 aa  268  8.999999999999999e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2595  lipoyl synthase  48.03 
 
 
321 aa  268  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0686543  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1113  lipoyl synthase  45.55 
 
 
323 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>