More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1316 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1316  lipoyl synthase  100 
 
 		 294 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  69.78 
 
 		 300 aa  426  1e-118  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1277  lipoyl synthase  66.55 
 
 		 287 aa  410  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1213  lipoyl synthase  70.91 
 
 		 292 aa  396  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1084  lipoyl synthase  66.42 
 
 		 291 aa  380  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1370  lipoyl synthase  61.92 
 
 		 288 aa  364  1e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.472643 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1149  lipoyl synthase  61.4 
 
 		 292 aa  340  1e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025967  normal  0.19755 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  55.43 
 
 		 328 aa  317  2e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1086  lipoyl synthase  51.4 
 
 		 321 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  51.25 
 
 		 288 aa  306  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3715  lipoyl synthase  51.05 
 
 		 321 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00165797  hitchhiker  0.00474747 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3027  lipoyl synthase  50.7 
 
 		 321 aa  301  8.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200618  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1855  lipoyl synthase  50.7 
 
 		 321 aa  301  8.000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000137205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2955  lipoyl synthase  50.7 
 
 		 321 aa  301  8.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000378828  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  50.55 
 
 		 299 aa  301  1e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2970  lipoyl synthase  50.35 
 
 		 321 aa  299  3e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  54.91 
 
 		 283 aa  299  3e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 304 aa  299  3e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3156  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 321 aa  299  3e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000010408  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  52.73 
 
 		 303 aa  298  8e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3492  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 321 aa  298  8e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000891871 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  52.73 
 
 		 303 aa  298  8e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  51.43 
 
 		 298 aa  298  9e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1085  lipoyl synthase  50 
 
 		 321 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00323584  hitchhiker  0.0000378022 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2942  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 321 aa  297  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000018983  hitchhiker  0.00758797 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3460  lipoyl synthase  50 
 
 		 321 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633504  normal  0.0256244 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3282  lipoyl synthase  50 
 
 		 321 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0177206  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2595  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 321 aa  297  1e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0686543  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 290 aa  297  2e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2076  lipoyl synthase  51.97 
 
 		 299 aa  296  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.39872  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1175  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 321 aa  296  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000143147  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  49.65 
 
 		 318 aa  296  2e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2876  lipoyl synthase  50 
 
 		 321 aa  296  3e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0754529  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3324  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 321 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0295877  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3156  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 321 aa  296  3e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  51.08 
 
 		 314 aa  296  3e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1161  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 321 aa  295  4e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0792  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 321 aa  295  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0748  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 321 aa  295  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0674  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 321 aa  295  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00338135  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0734  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 321 aa  295  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0688  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 321 aa  295  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0692  lipoyl synthase  50 
 
 		 321 aa  295  5e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0984  lipoyl synthase  50 
 
 		 321 aa  295  6e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.10688  normal  0.0219109 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0988  lipoyl synthase  50 
 
 		 321 aa  295  6e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0584288  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00597  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 321 aa  295  7e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2998  lipoic acid synthetase  49.65 
 
 		 321 aa  295  7e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448089  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3017  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 321 aa  295  7e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0056635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0716  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 321 aa  295  7e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000187845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0652  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 321 aa  295  7e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000125268  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 315 aa  295  7e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0648  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 321 aa  295  7e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.017557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0542  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 321 aa  295  7e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1049  lipoyl synthase  50 
 
 		 321 aa  295  7e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710809  hitchhiker  0.0056856 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00586  hypothetical protein  49.65 
 
 		 321 aa  295  7e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0679  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 321 aa  295  7e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215695  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0979  lipoyl synthase  50.7 
 
 		 321 aa  295  8e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.464322  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1195  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 321 aa  295  8e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0467  lipoyl synthase  50.35 
 
 		 321 aa  295  8e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00091244  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 315 aa  294  1e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  53.45 
 
 		 308 aa  294  1e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0867  lipoyl synthase  50 
 
 		 321 aa  294  1e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.719819  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  51.97 
 
 		 321 aa  294  1e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04289  lipoyl synthase  51.97 
 
 		 327 aa  293  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  50.9 
 
 		 298 aa  293  3e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1163  lipoyl synthase  49.3 
 
 		 321 aa  292  5e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 304 aa  292  6e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 298 aa  291  9e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 298 aa  290  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 298 aa  290  1e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 298 aa  290  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 298 aa  290  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 298 aa  290  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 298 aa  290  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 298 aa  290  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 298 aa  290  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01211  lipoyl synthase  49.47 
 
 		 321 aa  290  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  49.09 
 
 		 302 aa  290  3e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  50.88 
 
 		 282 aa  289  3e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 355 aa  289  4e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1401  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 300 aa  289  4e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  50.71 
 
 		 298 aa  289  4e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 298 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3202  lipoyl synthase  49.09 
 
 		 292 aa  288  5.0000000000000004e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3030  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 322 aa  288  5.0000000000000004e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.464318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004228  lipoate synthase  49.12 
 
 		 321 aa  289  5.0000000000000004e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000803554  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 305 aa  288  6e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 305 aa  288  6e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2714  lipoyl synthase  47.86 
 
 		 291 aa  288  8e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.171225  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  51.44 
 
 		 298 aa  288  8e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  52.71 
 
 		 324 aa  288  9e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0599  lipoyl synthase  50.7 
 
 		 373 aa  287  1e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0992056  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 297 aa  286  2e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0554  lipoyl synthase  50.7 
 
 		 373 aa  286  2e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.86018  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  48.73 
 
 		 292 aa  286  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_002950  PG0504  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 282 aa  286  2.9999999999999996e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.354667 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  50.71 
 
 		 298 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0238  lipoyl synthase  49.47 
 
 		 294 aa  285  5.999999999999999e-76  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.39899  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1029  lipoyl synthase  51.25 
 
 		 314 aa  285  5.999999999999999e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1162  lipoyl synthase  48.23 
 
 		 291 aa  285  7e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000484773  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>