More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2714 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2714  lipoyl synthase  100 
 
 		 291 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.171225  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1401  lipoyl synthase  71.83 
 
 		 300 aa  423  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2079  lipoyl synthase  72.08 
 
 		 298 aa  403  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.069299 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2076  lipoyl synthase  61.87 
 
 		 299 aa  352  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.39872  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  53.57 
 
 		 300 aa  312  4.999999999999999e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  54.71 
 
 		 328 aa  310  2e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1762  lipoyl synthase  57.4 
 
 		 296 aa  309  2.9999999999999997e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0164606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 283 aa  292  4e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  51.8 
 
 		 298 aa  290  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1316  lipoyl synthase  47.86 
 
 		 294 aa  288  8e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  51.75 
 
 		 329 aa  285  5e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  48.55 
 
 		 282 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  49.28 
 
 		 325 aa  284  1.0000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  51.44 
 
 		 351 aa  283  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  47.72 
 
 		 321 aa  282  4.0000000000000003e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  46.74 
 
 		 291 aa  282  4.0000000000000003e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  47.99 
 
 		 292 aa  281  8.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3346  lipoyl synthase  51.09 
 
 		 294 aa  281  9e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  50.72 
 
 		 303 aa  280  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  50.72 
 
 		 303 aa  280  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  50 
 
 		 321 aa  279  4e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0527  lipoyl synthase  51.82 
 
 		 296 aa  278  6e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0400  lipoyl synthase  50.71 
 
 		 291 aa  277  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0183  lipoyl synthase  51.09 
 
 		 306 aa  277  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.604682  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  48.94 
 
 		 325 aa  276  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1277  lipoyl synthase  49.1 
 
 		 287 aa  276  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  50.91 
 
 		 297 aa  276  3e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  47.46 
 
 		 321 aa  275  4e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3189  lipoyl synthase  45.99 
 
 		 290 aa  275  5e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.411626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0399  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 291 aa  275  6e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.661131 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2824  lipoyl synthase  51.44 
 
 		 320 aa  275  6e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1129  lipoyl synthase  52.16 
 
 		 306 aa  275  8e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0246702 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1162  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 291 aa  275  9e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000484773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2857  lipoyl synthase  49.09 
 
 		 319 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3897  lipoyl synthase  48.19 
 
 		 317 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.576703 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1149  lipoyl synthase  51.06 
 
 		 292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025967  normal  0.19755 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16371  lipoyl synthase  50.88 
 
 		 294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4749  lipoyl synthase  50 
 
 		 306 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108215 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1213  lipoyl synthase  47.16 
 
 		 292 aa  273  3e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2572  lipoyl synthase  48.54 
 
 		 319 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.085231  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1831  lipoyl synthase  48.9 
 
 		 319 aa  272  6e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377575  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  46.55 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0538  lipoyl synthase  48.35 
 
 		 317 aa  270  1e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1370  lipoyl synthase  49.09 
 
 		 288 aa  270  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.472643 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3156  lipoyl synthase  48.38 
 
 		 289 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0241  lipoyl synthase  48.75 
 
 		 312 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.395057  normal  0.45798 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2888  lipoyl synthase  49.27 
 
 		 319 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  47.81 
 
 		 292 aa  270  2.9999999999999997e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  45.74 
 
 		 304 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2595  lipoyl synthase  47.72 
 
 		 321 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0686543  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  46.55 
 
 		 322 aa  269  4e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3150  lipoyl synthase  50.71 
 
 		 283 aa  269  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  46.55 
 
 		 322 aa  269  4e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1042  lipoyl synthase  51.61 
 
 		 301 aa  269  4e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  49.45 
 
 		 308 aa  269  4e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3099  lipoic acid synthetase  46.37 
 
 		 305 aa  269  4e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244326  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  47.54 
 
 		 325 aa  269  5e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  48.23 
 
 		 309 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2584  lipoyl synthase  48.91 
 
 		 319 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510234 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0567  lipoic acid synthetase  47.81 
 
 		 289 aa  268  7e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0274  lipoyl synthase  50 
 
 		 311 aa  268  8.999999999999999e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01649  lipoyl synthase  46.59 
 
 		 320 aa  267  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00769873  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2014  lipoyl synthase  51.46 
 
 		 296 aa  267  1e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.812557  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3949  lipoyl synthase  48.16 
 
 		 319 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.331367 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2940  lipoyl synthase  48.01 
 
 		 289 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23551  lipoyl synthase  51.27 
 
 		 294 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.225624 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  46.93 
 
 		 298 aa  266  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3156  lipoyl synthase  47.02 
 
 		 321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000010408  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1163  lipoyl synthase  47.5 
 
 		 321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0674  lipoyl synthase  47.5 
 
 		 321 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00338135  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0792  lipoyl synthase  47.5 
 
 		 321 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1084  lipoyl synthase  49.07 
 
 		 291 aa  266  4e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0688  lipoyl synthase  47.5 
 
 		 321 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0748  lipoyl synthase  47.5 
 
 		 321 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0734  lipoyl synthase  47.5 
 
 		 321 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  46.13 
 
 		 325 aa  265  5e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1439  lipoyl synthase  48.35 
 
 		 319 aa  265  5.999999999999999e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.115253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3582  lipoyl synthase  45.8 
 
 		 332 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342819  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  47.06 
 
 		 298 aa  265  8.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0399  lipoyl synthase  49.1 
 
 		 283 aa  264  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123517  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1774  lipoyl synthase  46.02 
 
 		 328 aa  264  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  43.97 
 
 		 302 aa  264  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0914  lipoyl synthase  44.98 
 
 		 306 aa  264  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3934  lipoyl synthase  48.75 
 
 		 338 aa  263  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.521126  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12246  lipoyl synthase  45.21 
 
 		 311 aa  263  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.401424  normal  0.699705 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1281  lipoyl synthase  47.27 
 
 		 311 aa  264  2e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  45.74 
 
 		 298 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00597  lipoyl synthase  47.14 
 
 		 321 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2998  lipoic acid synthetase  47.14 
 
 		 321 aa  263  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448089  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0652  lipoyl synthase  47.14 
 
 		 321 aa  263  3e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000125268  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5917  lipoyl synthase  50 
 
 		 328 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00586  hypothetical protein  47.14 
 
 		 321 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3382  lipoic acid synthetase  50.54 
 
 		 288 aa  263  3e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0716  lipoyl synthase  47.14 
 
 		 321 aa  263  3e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000187845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2942  lipoyl synthase  46.15 
 
 		 321 aa  263  3e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000018983  hitchhiker  0.00758797 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3017  lipoyl synthase  47.14 
 
 		 321 aa  263  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0056635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  48.41 
 
 		 314 aa  263  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0679  lipoyl synthase  47.14 
 
 		 321 aa  263  3e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215695  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0542  lipoyl synthase  47.14 
 
 		 321 aa  263  3e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0648  lipoyl synthase  47.14 
 
 		 321 aa  263  3e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.017557  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>