More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3150 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3150  lipoyl synthase  100 
 
 		 283 aa  577  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0399  lipoyl synthase  69.53 
 
 		 283 aa  412  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123517  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0380  lipoyl synthase  76.87 
 
 		 303 aa  409  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0399  lipoyl synthase  69.53 
 
 		 291 aa  403  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.661131 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0400  lipoyl synthase  69.89 
 
 		 291 aa  403  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2239  lipoyl synthase  66.31 
 
 		 280 aa  364  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2662  lipoyl synthase  64.64 
 
 		 281 aa  362  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  55.64 
 
 		 283 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  50.71 
 
 		 291 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  52.19 
 
 		 282 aa  302  5.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1762  lipoyl synthase  54.45 
 
 		 296 aa  299  3e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0164606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4375  lipoyl synthase  51.61 
 
 		 307 aa  294  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  49.1 
 
 		 314 aa  288  9e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1370  lipoyl synthase  50 
 
 		 288 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.472643 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2970  lipoyl synthase  48.39 
 
 		 321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1252  lipoyl synthase  49.12 
 
 		 328 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  48.74 
 
 		 322 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1086  lipoyl synthase  47.67 
 
 		 321 aa  282  5.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4749  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 306 aa  281  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108215 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1611  lipoyl synthase  48.55 
 
 		 323 aa  280  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2176  lipoyl synthase  51.64 
 
 		 327 aa  280  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.349481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5924  lipoyl synthase  51.45 
 
 		 320 aa  280  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  50 
 
 		 329 aa  279  3e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3346  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 294 aa  279  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1804  lipoyl synthase  48.19 
 
 		 323 aa  278  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00544633  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6533  lipoyl synthase  51.09 
 
 		 320 aa  278  5e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  51.46 
 
 		 321 aa  278  6e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1401  lipoyl synthase  52.08 
 
 		 300 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0542  lipoyl synthase  47.31 
 
 		 321 aa  276  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00597  lipoyl synthase  47.31 
 
 		 321 aa  276  3e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2998  lipoic acid synthetase  47.31 
 
 		 321 aa  276  3e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448089  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 323 aa  276  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1162  lipoyl synthase  48.4 
 
 		 291 aa  276  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000484773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0716  lipoyl synthase  47.31 
 
 		 321 aa  276  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000187845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0652  lipoyl synthase  47.31 
 
 		 321 aa  276  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000125268  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0679  lipoyl synthase  47.31 
 
 		 321 aa  276  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215695  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0648  lipoyl synthase  47.31 
 
 		 321 aa  276  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.017557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3017  lipoyl synthase  47.31 
 
 		 321 aa  276  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0056635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00586  hypothetical protein  47.31 
 
 		 321 aa  276  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  46.38 
 
 		 321 aa  276  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3897  lipoyl synthase  49.28 
 
 		 317 aa  275  5e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.576703 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0274  lipoyl synthase  50.73 
 
 		 311 aa  275  6e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3027  lipoyl synthase  50 
 
 		 339 aa  275  7e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.443203 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  48.74 
 
 		 292 aa  275  7e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1855  lipoyl synthase  46.24 
 
 		 321 aa  275  8e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000137205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3027  lipoyl synthase  46.24 
 
 		 321 aa  275  8e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200618  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2955  lipoyl synthase  46.24 
 
 		 321 aa  275  8e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000378828  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0688  lipoyl synthase  47.31 
 
 		 321 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0792  lipoyl synthase  47.31 
 
 		 321 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0674  lipoyl synthase  47.31 
 
 		 321 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00338135  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0734  lipoyl synthase  47.31 
 
 		 321 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0527  lipoyl synthase  50 
 
 		 296 aa  275  9e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0748  lipoyl synthase  47.31 
 
 		 321 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1163  lipoyl synthase  46.59 
 
 		 321 aa  274  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0538  lipoyl synthase  46.21 
 
 		 317 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 297 aa  273  2.0000000000000002e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2799  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 339 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  44.88 
 
 		 322 aa  273  3e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  48.03 
 
 		 325 aa  273  3e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1175  lipoyl synthase  46.24 
 
 		 321 aa  273  3e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000143147  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  44.88 
 
 		 322 aa  272  4.0000000000000004e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3156  lipoyl synthase  49.11 
 
 		 289 aa  272  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 325 aa  272  5.000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3156  lipoyl synthase  45.88 
 
 		 321 aa  272  5.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 325 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2923  lipoyl synthase  49.28 
 
 		 334 aa  272  6e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.790522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3569  lipoyl synthase  45.3 
 
 		 300 aa  271  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  48.19 
 
 		 351 aa  271  8.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  48.38 
 
 		 298 aa  271  8.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  51.65 
 
 		 303 aa  271  9e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2857  lipoyl synthase  48.54 
 
 		 319 aa  271  9e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  51.65 
 
 		 303 aa  271  9e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  52.16 
 
 		 324 aa  271  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  50 
 
 		 298 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  48.73 
 
 		 298 aa  270  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  48.36 
 
 		 298 aa  270  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1195  lipoyl synthase  45.88 
 
 		 321 aa  270  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  47.46 
 
 		 323 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2940  lipoyl synthase  49.28 
 
 		 289 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  48.36 
 
 		 298 aa  270  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  48.36 
 
 		 298 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  48.36 
 
 		 298 aa  270  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  48.36 
 
 		 298 aa  270  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 298 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2544  lipoyl synthase  44.95 
 
 		 300 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  48.36 
 
 		 298 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  47.62 
 
 		 299 aa  270  2e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1439  lipoyl synthase  48.35 
 
 		 319 aa  270  2e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.115253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  48.36 
 
 		 298 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  48.36 
 
 		 298 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3949  lipoyl synthase  47.86 
 
 		 319 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.331367 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  50.72 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  48.36 
 
 		 298 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3382  lipoic acid synthetase  48.39 
 
 		 288 aa  269  2.9999999999999997e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  47.83 
 
 		 325 aa  269  2.9999999999999997e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2714  lipoyl synthase  50.71 
 
 		 291 aa  269  4e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.171225  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2199  lipoic acid synthetase  46.32 
 
 		 304 aa  269  4e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.842595  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  47.1 
 
 		 290 aa  268  5.9999999999999995e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  49.28 
 
 		 318 aa  268  7e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>