More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1858 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1858  lipoyl synthase  100 
 
 
332 aa  675    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2109  lipoic acid synthetase  87.73 
 
 
337 aa  588  1e-167  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.126752  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15400  lipoate synthase  86.71 
 
 
333 aa  590  1e-167  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1481  lipoyl synthase  83.18 
 
 
339 aa  562  1.0000000000000001e-159  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.527679  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2035  lipoic acid synthetase  80.36 
 
 
333 aa  557  1e-157  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.616606  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1340  lipoyl synthase  79.76 
 
 
334 aa  556  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3077  lipoic acid synthetase  78.96 
 
 
342 aa  543  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3288  lipoyl synthase  74.92 
 
 
333 aa  537  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0066599 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2932  lipoyl synthase  82.68 
 
 
317 aa  532  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3561  lipoyl synthase  82.3 
 
 
329 aa  528  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4266  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1513  lipoic acid synthetase  77.16 
 
 
341 aa  528  1e-149  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.647542  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3370  lipoic acid synthetase  82.03 
 
 
324 aa  525  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0991  lipoyl synthase  81.37 
 
 
312 aa  523  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0386773  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10420  lipoyl synthase  77.2 
 
 
333 aa  523  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171036  normal  0.0249814 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3328  lipoyl synthase  81.85 
 
 
331 aa  523  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0213262  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0914  lipoyl synthase  82.78 
 
 
306 aa  521  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455502  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3582  lipoyl synthase  80.97 
 
 
332 aa  521  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342819  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0939  lipoic acid synthetase  79.61 
 
 
317 aa  520  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.0375608 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3327  lipoyl synthase  79.74 
 
 
325 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0977769 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3316  lipoyl synthase  79.74 
 
 
325 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3378  lipoyl synthase  79.74 
 
 
325 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4893  lipoic acid synthetase  79.34 
 
 
311 aa  516  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0062  lipoyl synthase  71.3 
 
 
335 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1604  lipoyl synthase  71.3 
 
 
335 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159499  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3099  lipoic acid synthetase  79.93 
 
 
305 aa  511  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244326  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1598  lipoyl synthase  70.75 
 
 
339 aa  511  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000295116 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0533  lipoyl synthase  71.04 
 
 
347 aa  511  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12246  lipoyl synthase  79.87 
 
 
311 aa  510  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.401424  normal  0.699705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2640  Lipoyl synthase  77.78 
 
 
309 aa  508  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0291657  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1266  lipoic acid synthetase  78.43 
 
 
308 aa  508  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0917009  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7406  lipoyl synthase  80.94 
 
 
323 aa  506  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2299  lipoyl synthase  77.39 
 
 
316 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16470  lipoyl synthase  69.18 
 
 
340 aa  492  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.523399  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1774  lipoyl synthase  76.32 
 
 
328 aa  488  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1919  lipoyl synthase  73.51 
 
 
320 aa  485  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0160088  decreased coverage  0.000217018 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13370  lipoyl synthase  68.58 
 
 
335 aa  487  1e-136  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.957716  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3138  lipoyl synthase  71.11 
 
 
333 aa  468  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718204  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16380  lipoyl synthase  66.07 
 
 
340 aa  461  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0443181  normal  0.259676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3323  lipoyl synthase  72.46 
 
 
308 aa  462  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.842671  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0926  lipoyl synthase  74.01 
 
 
323 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.546117  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  52.01 
 
 
303 aa  293  4e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  52.01 
 
 
303 aa  293  4e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  49.66 
 
 
351 aa  284  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  47.1 
 
 
325 aa  284  2.0000000000000002e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  50 
 
 
328 aa  280  3e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  47.83 
 
 
318 aa  279  4e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  48.18 
 
 
291 aa  279  5e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  46.21 
 
 
304 aa  279  6e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  46.18 
 
 
321 aa  278  8e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  49.08 
 
 
308 aa  278  9e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  47.99 
 
 
304 aa  277  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  50.68 
 
 
535 aa  272  6e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  47.62 
 
 
321 aa  271  9e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2824  lipoyl synthase  49.1 
 
 
320 aa  270  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  45.85 
 
 
302 aa  270  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  46.37 
 
 
315 aa  269  4e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  46.13 
 
 
321 aa  270  4e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  47.55 
 
 
320 aa  269  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  47.5 
 
 
314 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  48.53 
 
 
328 aa  269  5.9999999999999995e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  45.14 
 
 
325 aa  268  8e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  45.61 
 
 
322 aa  268  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  45.61 
 
 
322 aa  268  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6533  lipoyl synthase  47.48 
 
 
320 aa  268  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  45.29 
 
 
292 aa  267  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0899  lipoyl synthase  43 
 
 
347 aa  268  1e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.322339 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  44.26 
 
 
323 aa  268  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2857  lipoyl synthase  46.91 
 
 
319 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5924  lipoyl synthase  47.48 
 
 
320 aa  266  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  45.33 
 
 
324 aa  267  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  48.38 
 
 
329 aa  267  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0744  lipoyl synthase  43.82 
 
 
347 aa  267  2e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  44.34 
 
 
330 aa  267  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0749  lipoyl synthase  43.82 
 
 
347 aa  266  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.58387  normal  0.798574 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  45.82 
 
 
299 aa  266  2.9999999999999995e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3897  lipoyl synthase  46.91 
 
 
317 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.576703 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  44.07 
 
 
329 aa  266  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1583  lipoyl synthase  45.78 
 
 
316 aa  266  4e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.681458  normal  0.0313019 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  44.98 
 
 
321 aa  266  5e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3949  lipoyl synthase  46.83 
 
 
319 aa  265  7e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.331367 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  47.46 
 
 
320 aa  265  8e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  44.78 
 
 
325 aa  265  8e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  47.46 
 
 
320 aa  265  8e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2799  lipoyl synthase  45.92 
 
 
339 aa  265  8e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3027  lipoyl synthase  45.92 
 
 
339 aa  265  8e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.443203 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2176  lipoyl synthase  45.92 
 
 
327 aa  265  8e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.349481  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2923  lipoyl synthase  45.92 
 
 
334 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.790522  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1252  lipoyl synthase  45.14 
 
 
328 aa  265  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  44.41 
 
 
329 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  44.41 
 
 
329 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  44.41 
 
 
329 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  44.41 
 
 
329 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  44.41 
 
 
329 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  44.41 
 
 
329 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2572  lipoyl synthase  45.45 
 
 
319 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.085231  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  44.41 
 
 
329 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1084  lipoyl synthase  49.44 
 
 
291 aa  263  3e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  47.45 
 
 
309 aa  263  4e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  46.74 
 
 
298 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  43.73 
 
 
330 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>