More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2932 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2932  lipoyl synthase  100 
 
 
317 aa  652    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3582  lipoyl synthase  93.4 
 
 
332 aa  590  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342819  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0914  lipoyl synthase  92.36 
 
 
306 aa  580  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455502  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3316  lipoyl synthase  85.76 
 
 
325 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3327  lipoyl synthase  85.76 
 
 
325 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0977769 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3378  lipoyl synthase  85.76 
 
 
325 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1340  lipoyl synthase  84.64 
 
 
334 aa  548  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3077  lipoic acid synthetase  83.77 
 
 
342 aa  537  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1513  lipoic acid synthetase  85.52 
 
 
341 aa  537  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.647542  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1858  lipoyl synthase  82.68 
 
 
332 aa  532  1e-150  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12246  lipoyl synthase  81.61 
 
 
311 aa  527  1e-148  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.401424  normal  0.699705 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10420  lipoyl synthase  81.91 
 
 
333 aa  525  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171036  normal  0.0249814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3370  lipoic acid synthetase  82.57 
 
 
324 aa  522  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2109  lipoic acid synthetase  80.07 
 
 
337 aa  513  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.126752  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15400  lipoate synthase  80.39 
 
 
333 aa  514  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0991  lipoyl synthase  78.57 
 
 
312 aa  509  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0386773  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3561  lipoyl synthase  79.28 
 
 
329 aa  506  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4266  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2035  lipoic acid synthetase  77.12 
 
 
333 aa  505  9.999999999999999e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.616606  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0939  lipoic acid synthetase  75.87 
 
 
317 aa  502  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.0375608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2640  Lipoyl synthase  76.22 
 
 
309 aa  498  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0291657  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4893  lipoic acid synthetase  75.08 
 
 
311 aa  499  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3328  lipoyl synthase  76.55 
 
 
331 aa  498  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0213262  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2299  lipoyl synthase  75.87 
 
 
316 aa  498  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3099  lipoic acid synthetase  77.63 
 
 
305 aa  496  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244326  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3288  lipoyl synthase  74.51 
 
 
333 aa  493  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0066599 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1266  lipoic acid synthetase  75.49 
 
 
308 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0917009  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1774  lipoyl synthase  73.97 
 
 
328 aa  489  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1481  lipoyl synthase  74.83 
 
 
339 aa  484  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.527679  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7406  lipoyl synthase  79.32 
 
 
323 aa  484  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1919  lipoyl synthase  73.42 
 
 
320 aa  483  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0160088  decreased coverage  0.000217018 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1598  lipoyl synthase  72.55 
 
 
339 aa  480  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000295116 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0533  lipoyl synthase  72.55 
 
 
347 aa  479  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3138  lipoyl synthase  72.13 
 
 
333 aa  474  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718204  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0062  lipoyl synthase  71.57 
 
 
335 aa  473  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1604  lipoyl synthase  71.57 
 
 
335 aa  472  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159499  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3323  lipoyl synthase  73.11 
 
 
308 aa  463  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.842671  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16380  lipoyl synthase  68.85 
 
 
340 aa  455  1e-127  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0443181  normal  0.259676 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13370  lipoyl synthase  69.18 
 
 
335 aa  452  1.0000000000000001e-126  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.957716  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0926  lipoyl synthase  72.22 
 
 
323 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.546117  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16470  lipoyl synthase  67.87 
 
 
340 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.523399  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  51.59 
 
 
303 aa  297  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  51.59 
 
 
303 aa  297  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  49.27 
 
 
291 aa  295  5e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  48.81 
 
 
325 aa  295  5e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  52.21 
 
 
328 aa  291  1e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  49.49 
 
 
351 aa  287  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  48.12 
 
 
321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  46.57 
 
 
304 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  50.65 
 
 
535 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  48.72 
 
 
308 aa  277  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  46.92 
 
 
318 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  45.77 
 
 
288 aa  276  3e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  45.71 
 
 
292 aa  275  5e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0899  lipoyl synthase  46.95 
 
 
347 aa  275  7e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.322339 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  47.99 
 
 
304 aa  274  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1586  lipoyl synthase  47.1 
 
 
331 aa  272  5.000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.426522  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1084  lipoyl synthase  49.44 
 
 
291 aa  272  6e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0749  lipoyl synthase  45.71 
 
 
347 aa  271  1e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.58387  normal  0.798574 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0744  lipoyl synthase  45.71 
 
 
347 aa  271  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  46.35 
 
 
299 aa  271  1e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  46.08 
 
 
315 aa  270  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  46.31 
 
 
321 aa  270  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  45.99 
 
 
290 aa  269  5e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  45.49 
 
 
321 aa  269  5e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  51.61 
 
 
334 aa  268  7e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1252  lipoyl synthase  45.86 
 
 
328 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2824  lipoyl synthase  49.1 
 
 
320 aa  268  1e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  45.79 
 
 
298 aa  268  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  48.03 
 
 
329 aa  267  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  45.83 
 
 
330 aa  267  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  43.95 
 
 
323 aa  267  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  47.2 
 
 
320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  45.49 
 
 
302 aa  266  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3897  lipoyl synthase  45.55 
 
 
317 aa  265  5.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.576703 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  44.9 
 
 
325 aa  265  7e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1611  lipoyl synthase  43.22 
 
 
323 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1804  lipoyl synthase  43.22 
 
 
323 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00544633  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  44.67 
 
 
322 aa  263  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  47.04 
 
 
298 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  44.67 
 
 
322 aa  263  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  43.81 
 
 
323 aa  263  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  48.73 
 
 
298 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3027  lipoyl synthase  46.92 
 
 
339 aa  263  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.443203 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  46.43 
 
 
298 aa  263  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6533  lipoyl synthase  45.18 
 
 
320 aa  263  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  46.07 
 
 
298 aa  263  4e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2799  lipoyl synthase  46.92 
 
 
339 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  45.67 
 
 
314 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  46.07 
 
 
298 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  44.83 
 
 
325 aa  262  4.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  46.26 
 
 
320 aa  262  6e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  46.26 
 
 
320 aa  262  6e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2226  lipoyl synthase  44.15 
 
 
315 aa  262  6e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0487133  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  45.61 
 
 
355 aa  262  6.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  44.2 
 
 
283 aa  261  8e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  45.71 
 
 
298 aa  261  8e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  45.71 
 
 
298 aa  261  8e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  45.71 
 
 
298 aa  261  8e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  45.71 
 
 
298 aa  261  8e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  45.71 
 
 
298 aa  261  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>