225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3042 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3042  phage integrase  100 
 
 		 366 aa  723    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1972  integrase family protein  51.55 
 
 		 359 aa  287  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.713568  normal  0.0793814 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2261  phage integrase  46.45 
 
 		 353 aa  286  5e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.245925  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3780  integrase family protein  47.35 
 
 		 383 aa  283  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.325182  normal  0.557184 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1991  phage integrase family protein  46.53 
 
 		 358 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1804  integrase family protein  44.44 
 
 		 401 aa  231  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000010936 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4524  phage integrase family protein  34.31 
 
 		 380 aa  151  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5471  integrase family protein  34.78 
 
 		 382 aa  146  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2722  phage integrase family protein  36 
 
 		 367 aa  145  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.907602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6311  integrase family protein  35.07 
 
 		 380 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.692197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4716  phage integrase family protein  35.09 
 
 		 379 aa  139  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6161  integrase family protein  34.01 
 
 		 382 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.365462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4516  phage integrase  34.83 
 
 		 422 aa  139  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9510  phage-related integrase  33.33 
 
 		 370 aa  135  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0464246  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5431  phage integrase family protein  34.49 
 
 		 391 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8553  integrase family protein  36.75 
 
 		 424 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453986  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3773  integrase family protein  33.92 
 
 		 390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2995  integrase family protein  31.62 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.941848  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4792  integrase family protein  33.64 
 
 		 363 aa  96.7  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00356022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0918  integrase family protein  33.47 
 
 		 329 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512331  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4548  phage integrase  31.63 
 
 		 421 aa  95.5  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.832393  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4358  phage integrase  31.19 
 
 		 408 aa  95.1  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2304  phage integrase  35.25 
 
 		 362 aa  93.2  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0327568  normal  0.0181167 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4195  phage integrase  33.33 
 
 		 408 aa  92.8  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0564405  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6146  integrase family protein  31.53 
 
 		 311 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6972  integrase family protein  27.19 
 
 		 329 aa  90.5  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0164563  normal  0.0336098 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4579  phage integrase  31.92 
 
 		 406 aa  89.7  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.18624  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1382  Phage integrase  28.87 
 
 		 335 aa  89.7  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2511  phage integrase  26.47 
 
 		 448 aa  89.4  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6851  integrase family protein  30.12 
 
 		 323 aa  89.4  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100628  normal  0.271303 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9008  phage integrase family protein  29.64 
 
 		 377 aa  88.6  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4157  integrase domain-containing protein  34.6 
 
 		 366 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118927  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7008  phage integrase family protein  28.79 
 
 		 387 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2480  integrase family protein  31.09 
 
 		 354 aa  87.4  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.608661 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25710  cointegrate resolution protein S  28.24 
 
 		 325 aa  86.7  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2249  phage integrase family protein  29.72 
 
 		 319 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2976  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  27.99 
 
 		 319 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0607408  normal  0.0219571 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0008  DNA integration/recombination/inversion protein  30.56 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.856285  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4027  integrase family protein  28.93 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.461361  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1698  Phage integrase  29.84 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35820  cointegrate resolution protein S  28.24 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000225241  decreased coverage  6.17783e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3058  cointegrate resolution protein S  28.24 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4239  hypothetical protein  31.76 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0653636  normal  0.519885 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4576  phage integrase  30.94 
 
 		 357 aa  83.6  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1908  phage integrase family protein  35.09 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.454202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4820  phage integrase family protein  29.32 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6280  integrase family protein  33.93 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2926  Phage integrase  26.19 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0537176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4511  phage integrase  32.13 
 
 		 369 aa  82.8  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.694348  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8006  integrase protein  29.32 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3109  cointegrate resolution protein S  26.05 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00637573  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1883  site-specific recombinase XerD-like  28.86 
 
 		 649 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3277  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  26.3 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2382  integrase family protein  26.76 
 
 		 354 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0941885  normal  0.501513 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2669  integrase family protein  27.41 
 
 		 316 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.261954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3434  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  26.3 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3359  integrase family protein  34.76 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2105  integrase family protein  26.81 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2680  integrase family protein  27.11 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2392  integrase family protein  26.81 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0530338  normal  0.472164 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4297  integrase family protein  33.63 
 
 		 394 aa  74.3  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2535  phage integrase family protein  26.91 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3181  phage integrase family site specific recombinase  27.11 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3751  integrase family protein  28.21 
 
 		 369 aa  72.8  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542126  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2981  Tn4652, cointegrate resolution protein S  25.87 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0457753 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5281  integrase family protein  26.35 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1640  integrase family protein  26.35 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0645  integrase family protein  31.33 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000112195  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2380  phage integrase family protein  27.34 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.503709  normal  0.032696 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5342  putative cointegrate resolution protein S / recombinase  29.92 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2082  integrase family protein  28.16 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.024543  hitchhiker  0.000210845 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2094  integrase family protein  24.56 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000349759  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1943  phage integrase family protein  27.64 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171548  normal  0.0940691 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2033  phage integrase family protein  27.24 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8481  integrase family protein  28.57 
 
 		 353 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383754  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2263  phage integrase family protein  27.91 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00650578  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1996  phage integrase family protein  27.24 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3968  phage integrase family protein  25.78 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1987  phage integrase family protein  26 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7902  integrase family protein  28.57 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.356547  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00624  cointegrase  26.04 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.281729  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4680  integrase family protein  27.17 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1326  integrase family protein  25.38 
 
 		 309 aa  67  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.847423  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1962  AP endonuclease  24.04 
 
 		 326 aa  67  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6128  integrase family protein  27.62 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2276  integrase family protein  26.35 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00370914  hitchhiker  0.000967634 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2092  phage integrase family protein  29.02 
 
 		 406 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2384  phage integrase family site specific recombinase  25.82 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1674  phage integrase family protein  27.76 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198845 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4316  phage integrase family protein  23.05 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4591  integrase family protein  30.48 
 
 		 316 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000000427706  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4367  phage integrase family protein  26.71 
 
 		 335 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02951  Phage integrase  25.88 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4618  integrase family protein  28.77 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3404  putative integrase  33.33 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25041  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  33.73 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4462  integrase family protein  28.77 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  33.51 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0180  phage integrase  29.67 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0996549 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2185  integrase family protein  25.82 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0291516  hitchhiker  0.00000847111 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>