More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4239 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4239  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  726    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0653636  normal  0.519885 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3751  integrase family protein  71.07 
 
 		 369 aa  509  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4027  integrase family protein  68.68 
 
 		 372 aa  501  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.461361  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4358  phage integrase  60.82 
 
 		 408 aa  421  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4195  phage integrase  60.76 
 
 		 408 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0564405  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4548  phage integrase  61.18 
 
 		 421 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.832393  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4579  phage integrase  58.76 
 
 		 406 aa  402  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.18624  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4792  integrase family protein  59.57 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00356022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2480  integrase family protein  59.72 
 
 		 354 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.608661 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4820  phage integrase family protein  61.58 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9008  phage integrase family protein  61.61 
 
 		 377 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7008  phage integrase family protein  62.31 
 
 		 387 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4576  phage integrase  60.97 
 
 		 357 aa  367  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8006  integrase protein  60.3 
 
 		 378 aa  362  4e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4511  phage integrase  55.92 
 
 		 369 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.694348  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3404  putative integrase  44.16 
 
 		 291 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2995  integrase family protein  41.23 
 
 		 323 aa  199  7e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.941848  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1908  phage integrase family protein  35.45 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.454202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0918  integrase family protein  35.94 
 
 		 329 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512331  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2304  phage integrase  37.83 
 
 		 362 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0327568  normal  0.0181167 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6972  integrase family protein  31.63 
 
 		 329 aa  126  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0164563  normal  0.0336098 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6146  integrase family protein  33.81 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6851  integrase family protein  31.35 
 
 		 323 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100628  normal  0.271303 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2870  integrase family protein  33.45 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00943332  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4157  integrase domain-containing protein  34.82 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118927  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4680  integrase family protein  33.33 
 
 		 346 aa  106  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3359  integrase family protein  33.69 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1553  putative integrase/recombinase  31.49 
 
 		 343 aa  91.3  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2466  integrase family protein  30.89 
 
 		 342 aa  89.7  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0580014  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2185  integrase family protein  30 
 
 		 413 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0291516  hitchhiker  0.00000847111 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2244  phage integrase family protein  22.38 
 
 		 380 aa  87  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.111867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2382  integrase family protein  23.06 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0941885  normal  0.501513 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0008  DNA integration/recombination/inversion protein  28.57 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.856285  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2752  integrase domain protein SAM domain protein  28.53 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00014768  normal  0.023237 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2384  phage integrase family site specific recombinase  23.8 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3434  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  31.25 
 
 		 375 aa  82.8  0.000000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1962  AP endonuclease  27.8 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3277  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  31.05 
 
 		 375 aa  82  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2276  integrase family protein  31.01 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00370914  hitchhiker  0.000967634 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2380  phage integrase family protein  22.29 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.503709  normal  0.032696 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3082  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.49 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.633641  normal  0.120316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6280  integrase family protein  33.46 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2082  integrase family protein  22.29 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.024543  hitchhiker  0.000210845 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2094  integrase family protein  23.31 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000349759  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2263  phage integrase family protein  21.99 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00650578  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1943  phage integrase family protein  23.76 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171548  normal  0.0940691 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3104  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.2 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494742 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2033  phage integrase family protein  23.84 
 
 		 369 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1996  phage integrase family protein  23.76 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4316  phage integrase family protein  27.08 
 
 		 340 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3133  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.7 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2996  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.7 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0374572 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2473  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.03 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3087  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.03 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6437  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.09 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.798094 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1382  Phage integrase  31.03 
 
 		 335 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1698  Phage integrase  31.01 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3968  phage integrase family protein  30.72 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4367  phage integrase family protein  28.16 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2092  phage integrase family protein  22.22 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4524  phage integrase family protein  31.4 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8481  integrase family protein  31.09 
 
 		 353 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383754  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7902  integrase family protein  30.87 
 
 		 353 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.356547  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1674  phage integrase family protein  25.74 
 
 		 330 aa  72  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2535  phage integrase family protein  29.1 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3181  phage integrase family site specific recombinase  28.79 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2680  integrase family protein  29.19 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2669  integrase family protein  29.27 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.261954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2169  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.67 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126979  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3258  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.67 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.706598  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2976  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  27.92 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0607408  normal  0.0219571 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0195  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.67 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4516  phage integrase  30.18 
 
 		 422 aa  67.8  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2920  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.67 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.510567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3428  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.67 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6128  integrase family protein  32.07 
 
 		 353 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02951  Phage integrase  28.03 
 
 		 336 aa  67  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0392  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.33 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.33 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0347  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.72 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2511  phage integrase  27.27 
 
 		 448 aa  66.2  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0170  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.19 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9510  phage-related integrase  29 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0464246  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0046  putative integrase  29.76 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0645  integrase family protein  33.17 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000112195  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4297  integrase family protein  25.93 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0031  DNA integration/recombination/inversion protein  30.72 
 
 		 163 aa  63.9  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.976428  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0074  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.29 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3109  cointegrate resolution protein S  27.56 
 
 		 319 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00637573  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2840  integrase family protein  30.68 
 
 		 322 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0238888  normal  0.278729 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8553  integrase family protein  30.89 
 
 		 424 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453986  n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0026  Phage integrase  29.86 
 
 		 309 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6311  integrase family protein  29.81 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.692197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2249  phage integrase family protein  25.54 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2926  Phage integrase  27.27 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0537176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  26.98 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3964  phage integrase family protein  26.25 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00221994  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2722  phage integrase family protein  34.34 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.907602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1640  integrase family protein  27.46 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5281  integrase family protein  27.46 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>