137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2105 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011667  Tmz1t_2392  integrase family protein  100 
 
 
313 aa  641    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0530338  normal  0.472164 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2105  integrase family protein  100 
 
 
313 aa  641    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5281  integrase family protein  61.74 
 
 
320 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1640  integrase family protein  61.74 
 
 
320 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2511  phage integrase  57.1 
 
 
448 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2976  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  57.38 
 
 
319 aa  363  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0607408  normal  0.0219571 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00624  cointegrase  58.01 
 
 
322 aa  362  6e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.281729  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3109  cointegrate resolution protein S  57.33 
 
 
319 aa  360  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00637573  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2926  Phage integrase  53.92 
 
 
312 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0537176  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35820  cointegrate resolution protein S  56.62 
 
 
323 aa  347  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000225241  decreased coverage  6.17783e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3058  cointegrate resolution protein S  56.62 
 
 
323 aa  347  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25710  cointegrate resolution protein S  56.95 
 
 
325 aa  346  4e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1987  phage integrase family protein  52.4 
 
 
319 aa  344  1e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2249  phage integrase family protein  55.45 
 
 
319 aa  344  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020372  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2981  Tn4652, cointegrate resolution protein S  54.64 
 
 
323 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0457753 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3181  phage integrase family site specific recombinase  55.63 
 
 
316 aa  335  7e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2535  phage integrase family protein  55.3 
 
 
326 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2669  integrase family protein  55.3 
 
 
316 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.261954  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2680  integrase family protein  54.9 
 
 
316 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5342  putative cointegrate resolution protein S / recombinase  60.37 
 
 
277 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2276  integrase family protein  48.97 
 
 
311 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00370914  hitchhiker  0.000967634 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3964  phage integrase family protein  33.97 
 
 
380 aa  190  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00221994  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1698  Phage integrase  38.7 
 
 
328 aa  188  9e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02951  Phage integrase  35.19 
 
 
336 aa  177  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4316  phage integrase family protein  35.19 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4367  phage integrase family protein  35.19 
 
 
335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1962  AP endonuclease  33.56 
 
 
326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0008  DNA integration/recombination/inversion protein  34.53 
 
 
314 aa  170  3e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.856285  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3968  phage integrase family protein  34.15 
 
 
347 aa  168  8e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3041  cointegrase  36.3 
 
 
291 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0918  integrase family protein  36.64 
 
 
329 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512331  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1382  Phage integrase  34.69 
 
 
335 aa  149  5e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0046  putative integrase  38.95 
 
 
189 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2995  integrase family protein  29.53 
 
 
323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.941848  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0031  DNA integration/recombination/inversion protein  40.54 
 
 
163 aa  106  6e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.976428  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2304  phage integrase  31.72 
 
 
362 aa  105  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0327568  normal  0.0181167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4157  integrase domain-containing protein  30.82 
 
 
366 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118927  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6146  integrase family protein  28.67 
 
 
311 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1996  phage integrase family protein  30.32 
 
 
369 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1943  phage integrase family protein  30.32 
 
 
369 aa  94  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171548  normal  0.0940691 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1908  phage integrase family protein  31.93 
 
 
338 aa  94  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.454202  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2466  integrase family protein  29.77 
 
 
342 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0580014  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1883  site-specific recombinase XerD-like  29.6 
 
 
649 aa  90.9  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2033  phage integrase family protein  29.9 
 
 
369 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2382  integrase family protein  26.28 
 
 
354 aa  90.5  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0941885  normal  0.501513 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2380  phage integrase family protein  28.48 
 
 
371 aa  89.7  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.503709  normal  0.032696 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2082  integrase family protein  28.48 
 
 
371 aa  89.7  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.024543  hitchhiker  0.000210845 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2263  phage integrase family protein  28.16 
 
 
371 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00650578  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6280  integrase family protein  32.95 
 
 
335 aa  87  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3359  integrase family protein  31.15 
 
 
307 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2384  phage integrase family site specific recombinase  27.1 
 
 
369 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6972  integrase family protein  25.18 
 
 
329 aa  85.1  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0164563  normal  0.0336098 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4297  integrase family protein  27.64 
 
 
394 aa  83.6  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2094  integrase family protein  25.32 
 
 
400 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000349759  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2244  phage integrase family protein  25.95 
 
 
380 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.111867  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2752  integrase domain protein SAM domain protein  32.54 
 
 
362 aa  79.3  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00014768  normal  0.023237 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2092  phage integrase family protein  30.94 
 
 
406 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5150  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  27.76 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384118  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8553  integrase family protein  30.82 
 
 
424 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453986  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9008  phage integrase family protein  28.04 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8481  integrase family protein  25 
 
 
353 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383754  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4579  phage integrase  27.53 
 
 
406 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.18624  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7902  integrase family protein  25 
 
 
353 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.356547  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9510  phage-related integrase  28.85 
 
 
370 aa  74.7  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0464246  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4195  phage integrase  28.77 
 
 
408 aa  73.9  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0564405  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3277  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  30.47 
 
 
375 aa  73.9  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3434  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  31.07 
 
 
375 aa  73.9  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5431  phage integrase family protein  30.23 
 
 
391 aa  73.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606096  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1553  putative integrase/recombinase  29.96 
 
 
343 aa  73.2  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4576  phage integrase  29.01 
 
 
357 aa  73.2  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4792  integrase family protein  29.11 
 
 
363 aa  73.2  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00356022  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4548  phage integrase  29.49 
 
 
421 aa  73.2  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.832393  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6851  integrase family protein  25.53 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100628  normal  0.271303 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4716  phage integrase family protein  27.67 
 
 
379 aa  72.4  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8006  integrase protein  29.25 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2870  integrase family protein  28.7 
 
 
322 aa  70.9  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00943332  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4680  integrase family protein  24.76 
 
 
346 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4358  phage integrase  28.42 
 
 
408 aa  70.5  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4524  phage integrase family protein  27.56 
 
 
380 aa  70.1  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5471  integrase family protein  27.27 
 
 
382 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7008  phage integrase family protein  29.05 
 
 
387 aa  69.7  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4820  phage integrase family protein  27.12 
 
 
356 aa  69.3  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2185  integrase family protein  26.3 
 
 
413 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0291516  hitchhiker  0.00000847111 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6128  integrase family protein  23.63 
 
 
353 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440777  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6161  integrase family protein  27.78 
 
 
382 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.365462  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2722  phage integrase family protein  28.85 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.907602  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6311  integrase family protein  26.07 
 
 
380 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.692197  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4027  integrase family protein  27.15 
 
 
372 aa  67  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.461361  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4516  phage integrase  28.32 
 
 
422 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3773  integrase family protein  27.49 
 
 
390 aa  65.1  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2480  integrase family protein  28.72 
 
 
354 aa  65.1  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.608661 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3751  integrase family protein  27.08 
 
 
369 aa  63.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542126  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1674  phage integrase family protein  24.15 
 
 
330 aa  62  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.198845 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3780  integrase family protein  29.04 
 
 
383 aa  62  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.325182  normal  0.557184 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5646  integrase family protein  24.23 
 
 
353 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.575287  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4511  phage integrase  27.82 
 
 
369 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.694348  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1972  integrase family protein  26.2 
 
 
359 aa  58.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.713568  normal  0.0793814 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0638  putative phage recombinase  22.22 
 
 
305 aa  57  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0874979  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  27.98 
 
 
300 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1279  integrase family protein  23.08 
 
 
335 aa  55.8  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>