More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2722 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2722  phage integrase family protein  100 
 
 		 367 aa  722    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.907602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3773  integrase family protein  41.4 
 
 		 390 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8553  integrase family protein  43.84 
 
 		 424 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453986  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9510  phage-related integrase  41.47 
 
 		 370 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0464246  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5471  integrase family protein  42.22 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4516  phage integrase  40.52 
 
 		 422 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6161  integrase family protein  40.3 
 
 		 382 aa  199  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.365462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4524  phage integrase family protein  41.23 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5431  phage integrase family protein  40.64 
 
 		 391 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4716  phage integrase family protein  39.2 
 
 		 379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1972  integrase family protein  40.55 
 
 		 359 aa  193  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.713568  normal  0.0793814 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6311  integrase family protein  40.82 
 
 		 380 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.692197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3780  integrase family protein  34.29 
 
 		 383 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.325182  normal  0.557184 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2261  phage integrase  35.69 
 
 		 353 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.245925  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1804  integrase family protein  37.22 
 
 		 401 aa  152  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000010936 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1991  phage integrase family protein  35.21 
 
 		 358 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3042  phage integrase  37.08 
 
 		 366 aa  122  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2995  integrase family protein  28.49 
 
 		 323 aa  98.6  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.941848  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0008  DNA integration/recombination/inversion protein  31.42 
 
 		 314 aa  92.8  7e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.856285  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0918  integrase family protein  30.63 
 
 		 329 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512331  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6146  integrase family protein  30.19 
 
 		 311 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1987  phage integrase family protein  29.45 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2466  integrase family protein  32.68 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0580014  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2249  phage integrase family protein  26.89 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25710  cointegrate resolution protein S  30.63 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4680  integrase family protein  31.42 
 
 		 346 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6280  integrase family protein  30.22 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4316  phage integrase family protein  28.29 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1883  site-specific recombinase XerD-like  30.21 
 
 		 649 aa  76.6  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2094  integrase family protein  32.43 
 
 		 400 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000349759  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1962  AP endonuclease  30 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4820  phage integrase family protein  27.65 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2511  phage integrase  29.37 
 
 		 448 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7008  phage integrase family protein  29.77 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4157  integrase domain-containing protein  29.97 
 
 		 366 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118927  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2976  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  26.03 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0607408  normal  0.0219571 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1908  phage integrase family protein  30.77 
 
 		 338 aa  73.6  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.454202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9008  phage integrase family protein  27.97 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3109  cointegrate resolution protein S  25.47 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00637573  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1674  phage integrase family protein  30.62 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198845 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2926  Phage integrase  27.64 
 
 		 312 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0537176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2105  integrase family protein  28.63 
 
 		 313 aa  72.4  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2304  phage integrase  29.12 
 
 		 362 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0327568  normal  0.0181167 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2392  integrase family protein  28.63 
 
 		 313 aa  72.4  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0530338  normal  0.472164 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4511  phage integrase  31.6 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.694348  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02951  Phage integrase  27.2 
 
 		 336 aa  72  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4195  phage integrase  28.91 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0564405  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3181  phage integrase family site specific recombinase  30.65 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1640  integrase family protein  29.92 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5281  integrase family protein  29.92 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2535  phage integrase family protein  30 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4579  phage integrase  28.61 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.18624  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2669  integrase family protein  30.65 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.261954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3082  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.49 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.633641  normal  0.120316 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4548  phage integrase  29.68 
 
 		 421 aa  69.3  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.832393  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8006  integrase protein  28.43 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0078  phage integrase family protein  29.95 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4358  phage integrase  27.01 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2680  integrase family protein  29.62 
 
 		 316 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2870  integrase family protein  27.94 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00943332  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4792  integrase family protein  28.53 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00356022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4367  phage integrase family protein  27.71 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4239  hypothetical protein  30.64 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0653636  normal  0.519885 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2996  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.25 
 
 		 306 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0374572 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3359  integrase family protein  31.29 
 
 		 307 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  26.83 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0170  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.25 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3058  cointegrate resolution protein S  26.91 
 
 		 323 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3133  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.25 
 
 		 306 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35820  cointegrate resolution protein S  26.91 
 
 		 323 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000225241  decreased coverage  6.17783e-20 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2380  phage integrase family protein  27.95 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.503709  normal  0.032696 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2981  Tn4652, cointegrate resolution protein S  25.4 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0457753 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8481  integrase family protein  32.49 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383754  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2082  integrase family protein  27.51 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.024543  hitchhiker  0.000210845 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7902  integrase family protein  32.49 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.356547  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0046  putative integrase  33.1 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2480  integrase family protein  28.62 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.608661 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3104  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.66 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494742 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2263  phage integrase family protein  27.07 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00650578  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4591  integrase family protein  30.77 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000000427706  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00624  cointegrase  28.23 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.281729  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1943  phage integrase family protein  28.51 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171548  normal  0.0940691 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2033  phage integrase family protein  27.63 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3221  integrase family protein  37.5 
 
 		 337 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  hitchhiker  0.000000474252 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.41 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3258  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.41 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.706598  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0392  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.41 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3428  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.41 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2169  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.41 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126979  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2920  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.41 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.510567  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6972  integrase family protein  24.62 
 
 		 329 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0164563  normal  0.0336098 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1996  phage integrase family protein  28.07 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0195  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.41 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2384  phage integrase family site specific recombinase  27.5 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6437  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.99 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.798094 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0074  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.99 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2092  phage integrase family protein  27.11 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4576  phage integrase  29.02 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0645  integrase family protein  30.98 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000112195  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5150  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  34.07 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384118  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>