132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2680 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2680  integrase family protein  100 
 
 		 316 aa  636    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2669  integrase family protein  92.72 
 
 		 316 aa  597  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.261954  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3181  phage integrase family site specific recombinase  93.04 
 
 		 316 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2535  phage integrase family protein  92.72 
 
 		 326 aa  594  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2981  Tn4652, cointegrate resolution protein S  67.75 
 
 		 323 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0457753 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35820  cointegrate resolution protein S  67.86 
 
 		 323 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000225241  decreased coverage  6.17783e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3058  cointegrate resolution protein S  67.86 
 
 		 323 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25710  cointegrate resolution protein S  68.08 
 
 		 325 aa  433  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2976  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  63.97 
 
 		 319 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0607408  normal  0.0219571 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2926  Phage integrase  64.31 
 
 		 312 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0537176  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3109  cointegrate resolution protein S  62.63 
 
 		 319 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00637573  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2249  phage integrase family protein  62.17 
 
 		 319 aa  384  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5281  integrase family protein  56.11 
 
 		 320 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1640  integrase family protein  56.11 
 
 		 320 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2511  phage integrase  56.38 
 
 		 448 aa  345  4e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00624  cointegrase  55.52 
 
 		 322 aa  334  1e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.281729  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2105  integrase family protein  54.9 
 
 		 313 aa  333  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2392  integrase family protein  54.9 
 
 		 313 aa  333  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0530338  normal  0.472164 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1987  phage integrase family protein  52.29 
 
 		 319 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2276  integrase family protein  56.15 
 
 		 311 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00370914  hitchhiker  0.000967634 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5342  putative cointegrate resolution protein S / recombinase  56.3 
 
 		 277 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1698  Phage integrase  39.4 
 
 		 328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02951  Phage integrase  36.84 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3968  phage integrase family protein  35.76 
 
 		 347 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0008  DNA integration/recombination/inversion protein  38.21 
 
 		 314 aa  180  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.856285  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4316  phage integrase family protein  34.97 
 
 		 340 aa  176  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3041  cointegrase  36.68 
 
 		 291 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1962  AP endonuclease  34.2 
 
 		 326 aa  176  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3964  phage integrase family protein  33.87 
 
 		 380 aa  175  7e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00221994  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4367  phage integrase family protein  35.5 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1382  Phage integrase  38.31 
 
 		 335 aa  170  4e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0918  integrase family protein  36.61 
 
 		 329 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512331  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2995  integrase family protein  31.58 
 
 		 323 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.941848  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0046  putative integrase  41.21 
 
 		 189 aa  120  3e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6146  integrase family protein  31.68 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1943  phage integrase family protein  29.49 
 
 		 369 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171548  normal  0.0940691 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1996  phage integrase family protein  29.17 
 
 		 369 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2304  phage integrase  33.22 
 
 		 362 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0327568  normal  0.0181167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2033  phage integrase family protein  28.85 
 
 		 369 aa  110  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0031  DNA integration/recombination/inversion protein  43.23 
 
 		 163 aa  108  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.976428  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3359  integrase family protein  33.2 
 
 		 307 aa  106  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2384  phage integrase family site specific recombinase  29.17 
 
 		 369 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2466  integrase family protein  30.94 
 
 		 342 aa  104  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0580014  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4579  phage integrase  31.38 
 
 		 406 aa  102  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.18624  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2380  phage integrase family protein  28.98 
 
 		 371 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.503709  normal  0.032696 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2082  integrase family protein  28.34 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.024543  hitchhiker  0.000210845 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4548  phage integrase  30.48 
 
 		 421 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.832393  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2263  phage integrase family protein  28.66 
 
 		 371 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00650578  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4027  integrase family protein  31.4 
 
 		 372 aa  99.4  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.461361  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4792  integrase family protein  30.82 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00356022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4157  integrase domain-containing protein  30.87 
 
 		 366 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118927  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4195  phage integrase  30.82 
 
 		 408 aa  97.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0564405  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4358  phage integrase  29.6 
 
 		 408 aa  96.7  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9008  phage integrase family protein  29.73 
 
 		 377 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4576  phage integrase  29.35 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2094  integrase family protein  27.06 
 
 		 400 aa  94.7  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000349759  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2382  integrase family protein  27.42 
 
 		 354 aa  94.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0941885  normal  0.501513 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2092  phage integrase family protein  28.15 
 
 		 406 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8006  integrase protein  29.25 
 
 		 378 aa  93.6  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7008  phage integrase family protein  28.47 
 
 		 387 aa  93.6  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2244  phage integrase family protein  25.15 
 
 		 380 aa  92.4  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.111867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2870  integrase family protein  36.17 
 
 		 322 aa  92  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00943332  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1908  phage integrase family protein  29.9 
 
 		 338 aa  90.9  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.454202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4820  phage integrase family protein  27.42 
 
 		 356 aa  90.9  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8553  integrase family protein  35.55 
 
 		 424 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453986  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6851  integrase family protein  28.52 
 
 		 323 aa  89.4  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100628  normal  0.271303 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4297  integrase family protein  28.86 
 
 		 394 aa  89  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6972  integrase family protein  25.17 
 
 		 329 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0164563  normal  0.0336098 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1883  site-specific recombinase XerD-like  28.37 
 
 		 649 aa  86.3  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7902  integrase family protein  29.28 
 
 		 353 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.356547  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4524  phage integrase family protein  29.92 
 
 		 380 aa  85.9  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3773  integrase family protein  29.23 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8481  integrase family protein  29.28 
 
 		 353 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383754  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3751  integrase family protein  31.1 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6128  integrase family protein  28.33 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3277  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  30.14 
 
 		 375 aa  82.8  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3434  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  31.1 
 
 		 375 aa  82.4  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2752  integrase domain protein SAM domain protein  27.66 
 
 		 362 aa  82.4  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00014768  normal  0.023237 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4516  phage integrase  31.08 
 
 		 422 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1674  phage integrase family protein  25.67 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198845 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2480  integrase family protein  30.58 
 
 		 354 aa  78.2  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.608661 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5646  integrase family protein  28 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.575287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5431  phage integrase family protein  34.46 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606096  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2185  integrase family protein  27.42 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0291516  hitchhiker  0.00000847111 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9510  phage-related integrase  30.88 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0464246  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4511  phage integrase  27.8 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.694348  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6311  integrase family protein  30.68 
 
 		 380 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.692197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4716  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6161  integrase family protein  26.56 
 
 		 382 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.365462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0638  putative phage recombinase  24.19 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0874979  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5471  integrase family protein  26.8 
 
 		 382 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5150  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  29.37 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3780  integrase family protein  25.44 
 
 		 383 aa  69.7  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.325182  normal  0.557184 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6280  integrase family protein  30 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1553  putative integrase/recombinase  29.04 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4239  hypothetical protein  29.37 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0653636  normal  0.519885 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1972  integrase family protein  27.55 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.713568  normal  0.0793814 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2261  phage integrase  25.23 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.245925  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4680  integrase family protein  25.52 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2722  phage integrase family protein  29.12 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.907602  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>