241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3359 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3359  integrase family protein  100 
 
 		 307 aa  608  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2995  integrase family protein  44.9 
 
 		 323 aa  225  8e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.941848  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2304  phage integrase  45.08 
 
 		 362 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0327568  normal  0.0181167 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0918  integrase family protein  43.91 
 
 		 329 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512331  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4157  integrase domain-containing protein  46.96 
 
 		 366 aa  166  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118927  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2466  integrase family protein  41.73 
 
 		 342 aa  153  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0580014  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1698  Phage integrase  39.43 
 
 		 328 aa  151  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1962  AP endonuclease  36.78 
 
 		 326 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3277  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  41.41 
 
 		 375 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3434  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  41.41 
 
 		 375 aa  142  8e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4367  phage integrase family protein  37.45 
 
 		 335 aa  142  9e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1908  phage integrase family protein  41.15 
 
 		 338 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.454202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6851  integrase family protein  34.64 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100628  normal  0.271303 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6972  integrase family protein  32.52 
 
 		 329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0164563  normal  0.0336098 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1382  Phage integrase  37.18 
 
 		 335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3968  phage integrase family protein  36.64 
 
 		 347 aa  136  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2870  integrase family protein  31.7 
 
 		 322 aa  132  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00943332  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6146  integrase family protein  35.18 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4316  phage integrase family protein  34.8 
 
 		 340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1883  site-specific recombinase XerD-like  35.29 
 
 		 649 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02951  Phage integrase  36.4 
 
 		 336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7902  integrase family protein  37.32 
 
 		 353 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.356547  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8481  integrase family protein  37.32 
 
 		 353 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383754  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4579  phage integrase  33.92 
 
 		 406 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.18624  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6280  integrase family protein  40.28 
 
 		 335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6128  integrase family protein  36.49 
 
 		 353 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1553  putative integrase/recombinase  38.02 
 
 		 343 aa  126  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4511  phage integrase  35.36 
 
 		 369 aa  123  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.694348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4680  integrase family protein  36.96 
 
 		 346 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4792  integrase family protein  34.8 
 
 		 363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00356022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2752  integrase domain protein SAM domain protein  38.83 
 
 		 362 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00014768  normal  0.023237 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2480  integrase family protein  34.31 
 
 		 354 aa  119  7.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.608661 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4358  phage integrase  35.47 
 
 		 408 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4297  integrase family protein  34.73 
 
 		 394 aa  118  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1943  phage integrase family protein  28.72 
 
 		 369 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171548  normal  0.0940691 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9008  phage integrase family protein  32.53 
 
 		 377 aa  115  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4548  phage integrase  34.04 
 
 		 421 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.832393  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4820  phage integrase family protein  31.18 
 
 		 356 aa  115  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1996  phage integrase family protein  28.04 
 
 		 369 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2033  phage integrase family protein  28.38 
 
 		 369 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2094  integrase family protein  28.03 
 
 		 400 aa  113  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000349759  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4195  phage integrase  34.59 
 
 		 408 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0564405  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5646  integrase family protein  37.89 
 
 		 353 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.575287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7008  phage integrase family protein  31.1 
 
 		 387 aa  112  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8006  integrase protein  33.45 
 
 		 378 aa  111  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2384  phage integrase family site specific recombinase  27.08 
 
 		 369 aa  110  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0008  DNA integration/recombination/inversion protein  34 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.856285  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4576  phage integrase  34 
 
 		 357 aa  109  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4027  integrase family protein  31.31 
 
 		 372 aa  108  9.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.461361  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2680  integrase family protein  33.2 
 
 		 316 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4239  hypothetical protein  34.01 
 
 		 365 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0653636  normal  0.519885 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2382  integrase family protein  27.21 
 
 		 354 aa  105  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0941885  normal  0.501513 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2669  integrase family protein  34.39 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.261954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3751  integrase family protein  33.07 
 
 		 369 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2244  phage integrase family protein  31.34 
 
 		 380 aa  102  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.111867  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3181  phage integrase family site specific recombinase  33.6 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2535  phage integrase family protein  32.69 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2263  phage integrase family protein  26.6 
 
 		 371 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00650578  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2380  phage integrase family protein  26.6 
 
 		 371 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.503709  normal  0.032696 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2082  integrase family protein  26.26 
 
 		 371 aa  99.4  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.024543  hitchhiker  0.000210845 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2092  phage integrase family protein  27.63 
 
 		 406 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35820  cointegrate resolution protein S  30.83 
 
 		 323 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000225241  decreased coverage  6.17783e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3058  cointegrate resolution protein S  30.83 
 
 		 323 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2511  phage integrase  31.99 
 
 		 448 aa  92.8  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2976  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  32.3 
 
 		 319 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0607408  normal  0.0219571 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2276  integrase family protein  33.33 
 
 		 311 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00370914  hitchhiker  0.000967634 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5342  putative cointegrate resolution protein S / recombinase  30.97 
 
 		 277 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2249  phage integrase family protein  30.43 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2926  Phage integrase  32.14 
 
 		 312 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0537176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1674  phage integrase family protein  29.71 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198845 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25710  cointegrate resolution protein S  31.1 
 
 		 325 aa  90.5  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2185  integrase family protein  30.95 
 
 		 413 aa  90.1  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0291516  hitchhiker  0.00000847111 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1972  integrase family protein  35.09 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.713568  normal  0.0793814 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2981  Tn4652, cointegrate resolution protein S  30.16 
 
 		 323 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0457753 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3109  cointegrate resolution protein S  30.74 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00637573  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5281  integrase family protein  28.68 
 
 		 320 aa  86.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1640  integrase family protein  28.68 
 
 		 320 aa  86.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0046  putative integrase  36.36 
 
 		 189 aa  86.3  6e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2105  integrase family protein  31.15 
 
 		 313 aa  86.3  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2392  integrase family protein  31.15 
 
 		 313 aa  86.3  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0530338  normal  0.472164 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1987  phage integrase family protein  30 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3780  integrase family protein  29.66 
 
 		 383 aa  80.9  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.325182  normal  0.557184 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5150  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  32.13 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3404  putative integrase  28.06 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00624  cointegrase  29.24 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.281729  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2261  phage integrase  29.97 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.245925  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0638  putative phage recombinase  24.79 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0874979  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0031  DNA integration/recombination/inversion protein  35.76 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.976428  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1804  integrase family protein  30.81 
 
 		 401 aa  72  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000010936 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1991  phage integrase family protein  33.7 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1279  integrase family protein  26.47 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4377  phage integrase family protein  26.12 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.53808 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4516  phage integrase  28.3 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3041  cointegrase  29.96 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0237  phage integrase family protein  25.68 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1730  integrase family protein  34.53 
 
 		 317 aa  62  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2722  phage integrase family protein  31.41 
 
 		 367 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.907602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  25.21 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9510  phage-related integrase  27.22 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0464246  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5431  phage integrase family protein  29.37 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606096  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>