More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4358 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4195  phage integrase  91.67 
 
 		 408 aa  739    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0564405  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4358  phage integrase  100 
 
 		 408 aa  828    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4548  phage integrase  84.11 
 
 		 421 aa  699    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.832393  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4579  phage integrase  80.38 
 
 		 406 aa  595  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.18624  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4576  phage integrase  79.05 
 
 		 357 aa  544  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4792  integrase family protein  80.46 
 
 		 363 aa  542  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00356022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9008  phage integrase family protein  69.12 
 
 		 377 aa  527  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8006  integrase protein  68.95 
 
 		 378 aa  519  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4820  phage integrase family protein  75.29 
 
 		 356 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7008  phage integrase family protein  76.38 
 
 		 387 aa  516  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2480  integrase family protein  71.43 
 
 		 354 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.608661 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4027  integrase family protein  59.31 
 
 		 372 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.461361  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3751  integrase family protein  63.64 
 
 		 369 aa  404  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4239  hypothetical protein  60.82 
 
 		 365 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0653636  normal  0.519885 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4511  phage integrase  64.76 
 
 		 369 aa  391  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.694348  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3404  putative integrase  39.29 
 
 		 291 aa  204  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2995  integrase family protein  40.24 
 
 		 323 aa  190  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.941848  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0918  integrase family protein  32.78 
 
 		 329 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512331  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2304  phage integrase  37.34 
 
 		 362 aa  135  9e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0327568  normal  0.0181167 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1908  phage integrase family protein  35.76 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.454202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6972  integrase family protein  29.32 
 
 		 329 aa  123  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0164563  normal  0.0336098 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2870  integrase family protein  35.06 
 
 		 322 aa  123  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00943332  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3359  integrase family protein  35.47 
 
 		 307 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4157  integrase domain-containing protein  34.07 
 
 		 366 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118927  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6146  integrase family protein  32.55 
 
 		 311 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1962  AP endonuclease  30.94 
 
 		 326 aa  104  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0008  DNA integration/recombination/inversion protein  31.97 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.856285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4680  integrase family protein  31.54 
 
 		 346 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1698  Phage integrase  32.27 
 
 		 328 aa  100  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4316  phage integrase family protein  29.97 
 
 		 340 aa  99.8  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2466  integrase family protein  30.87 
 
 		 342 aa  98.2  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0580014  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2752  integrase domain protein SAM domain protein  29.86 
 
 		 362 aa  97.8  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00014768  normal  0.023237 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8481  integrase family protein  35.24 
 
 		 353 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383754  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2535  phage integrase family protein  29.91 
 
 		 326 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2276  integrase family protein  30.33 
 
 		 311 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00370914  hitchhiker  0.000967634 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3277  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  31.9 
 
 		 375 aa  96.7  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3181  phage integrase family site specific recombinase  29.91 
 
 		 316 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2680  integrase family protein  29.6 
 
 		 316 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3434  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  31.9 
 
 		 375 aa  96.3  8e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7902  integrase family protein  34.9 
 
 		 353 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.356547  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6851  integrase family protein  27.19 
 
 		 323 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100628  normal  0.271303 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2669  integrase family protein  31.16 
 
 		 316 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.261954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4367  phage integrase family protein  30.06 
 
 		 335 aa  94  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02951  Phage integrase  29.26 
 
 		 336 aa  93.2  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3968  phage integrase family protein  30.03 
 
 		 347 aa  92.4  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2384  phage integrase family site specific recombinase  23.72 
 
 		 369 aa  91.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1382  Phage integrase  30.03 
 
 		 335 aa  91.7  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6128  integrase family protein  33.12 
 
 		 353 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1553  putative integrase/recombinase  29.66 
 
 		 343 aa  89.4  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6280  integrase family protein  33.19 
 
 		 335 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2511  phage integrase  28.99 
 
 		 448 aa  87.8  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2382  integrase family protein  23.01 
 
 		 354 aa  87.4  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0941885  normal  0.501513 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2082  integrase family protein  24.13 
 
 		 371 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.024543  hitchhiker  0.000210845 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1943  phage integrase family protein  23.56 
 
 		 369 aa  87  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171548  normal  0.0940691 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2033  phage integrase family protein  23.05 
 
 		 369 aa  87  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2185  integrase family protein  29.32 
 
 		 413 aa  86.7  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0291516  hitchhiker  0.00000847111 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2380  phage integrase family protein  23.55 
 
 		 371 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.503709  normal  0.032696 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1996  phage integrase family protein  24.14 
 
 		 369 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2263  phage integrase family protein  23.26 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00650578  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2244  phage integrase family protein  21.19 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.111867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2976  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  30.41 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0607408  normal  0.0219571 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2094  integrase family protein  23.65 
 
 		 400 aa  84  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000349759  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25710  cointegrate resolution protein S  29.15 
 
 		 325 aa  82.8  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1674  phage integrase family protein  27.97 
 
 		 330 aa  82.8  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198845 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3104  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.26 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494742 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3082  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.2 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.633641  normal  0.120316 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1640  integrase family protein  26.03 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5281  integrase family protein  26.03 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3109  cointegrate resolution protein S  29.25 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00637573  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1972  integrase family protein  30.06 
 
 		 359 aa  79.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.713568  normal  0.0793814 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2996  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.84 
 
 		 306 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0374572 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5646  integrase family protein  30.23 
 
 		 353 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.575287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2473  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.85 
 
 		 306 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3133  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.84 
 
 		 306 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3087  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.85 
 
 		 306 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2169  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.85 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126979  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.85 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3258  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.85 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.706598  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0392  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.85 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0195  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.85 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2920  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.85 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.510567  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3780  integrase family protein  29.29 
 
 		 383 aa  78.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.325182  normal  0.557184 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3428  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.85 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2092  phage integrase family protein  23.95 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0031  DNA integration/recombination/inversion protein  33.33 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.976428  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4297  integrase family protein  25.65 
 
 		 394 aa  75.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0046  putative integrase  31.34 
 
 		 189 aa  75.9  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0170  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.45 
 
 		 306 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  28.57 
 
 		 305 aa  75.9  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1987  phage integrase family protein  27.73 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5342  putative cointegrate resolution protein S / recombinase  25.95 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3058  cointegrate resolution protein S  27.52 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6437  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.05 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.798094 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35820  cointegrate resolution protein S  27.52 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000225241  decreased coverage  6.17783e-20 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2926  Phage integrase  28.57 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0537176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2249  phage integrase family protein  26.25 
 
 		 319 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  29.63 
 
 		 302 aa  72  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2261  phage integrase  28.61 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.245925  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0074  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.28 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  29.08 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>