111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1279 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1279  integrase family protein  100 
 
 		 335 aa  681    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2466  integrase family protein  33.97 
 
 		 342 aa  145  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0580014  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2995  integrase family protein  29.63 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.941848  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6851  integrase family protein  30.39 
 
 		 323 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100628  normal  0.271303 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4157  integrase domain-containing protein  28.2 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118927  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6280  integrase family protein  29.61 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2304  phage integrase  28.3 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0327568  normal  0.0181167 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0008  DNA integration/recombination/inversion protein  27.53 
 
 		 314 aa  72.4  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.856285  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6128  integrase family protein  26.2 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3359  integrase family protein  26.47 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1698  Phage integrase  25.71 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1962  AP endonuclease  24.21 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6146  integrase family protein  25.82 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6972  integrase family protein  24.22 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0164563  normal  0.0336098 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8481  integrase family protein  25.75 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4680  integrase family protein  27.85 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0287  integrase domain protein SAM domain protein  25.94 
 
 		 362 aa  62.8  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1987  phage integrase family protein  23.51 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2276  integrase family protein  25.93 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00370914  hitchhiker  0.000967634 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4297  integrase family protein  25.66 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7902  integrase family protein  24.53 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.356547  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1674  phage integrase family protein  26.92 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198845 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5582  integrase family protein  29.34 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2976  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  24.68 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0607408  normal  0.0219571 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0918  integrase family protein  27.55 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512331  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0229  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  25.6 
 
 		 362 aa  59.3  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1553  putative integrase/recombinase  27.54 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.62 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5646  integrase family protein  25.24 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.575287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00624  cointegrase  23.75 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.281729  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3109  cointegrate resolution protein S  22.37 
 
 		 319 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00637573  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02951  Phage integrase  23.25 
 
 		 336 aa  57  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.62 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.62 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.62 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.62 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.27 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.27 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.62 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.62 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1205  integrase/recombinase XerD  29.73 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.27 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2105  integrase family protein  23.08 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2392  integrase family protein  23.08 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0530338  normal  0.472164 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3181  phage integrase family site specific recombinase  23.05 
 
 		 316 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3968  phage integrase family protein  25.18 
 
 		 347 aa  55.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2535  phage integrase family protein  23.05 
 
 		 326 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.91 
 
 		 296 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2669  integrase family protein  23.08 
 
 		 316 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.261954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0027  integrase/recombinase  27.49 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000824478  normal  0.490771 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4239  hypothetical protein  28.44 
 
 		 365 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0653636  normal  0.519885 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4316  phage integrase family protein  21.7 
 
 		 340 aa  53.5  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5150  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  26.44 
 
 		 399 aa  53.1  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  26.67 
 
 		 285 aa  52.8  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2480  integrase family protein  25.57 
 
 		 354 aa  52.8  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.608661 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1492  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  27.35 
 
 		 320 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2511  phage integrase  23.36 
 
 		 448 aa  52  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2249  phage integrase family protein  23.05 
 
 		 319 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2680  integrase family protein  22.76 
 
 		 316 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1640  integrase family protein  22.94 
 
 		 320 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5281  integrase family protein  22.94 
 
 		 320 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4608  site-specific recombinase, phage integrase family  26.78 
 
 		 320 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.764652  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1475  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  26.78 
 
 		 320 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.04346  normal  0.165942 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1883  site-specific recombinase XerD-like  30.6 
 
 		 649 aa  50.8  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4367  phage integrase family protein  29.27 
 
 		 335 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.4 
 
 		 298 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4027  integrase family protein  26.06 
 
 		 372 aa  50.1  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.461361  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4548  phage integrase  26.56 
 
 		 421 aa  49.7  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.832393  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2840  integrase family protein  25.88 
 
 		 322 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0238888  normal  0.278729 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35820  cointegrate resolution protein S  22.5 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000225241  decreased coverage  6.17783e-20 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3434  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  24.68 
 
 		 375 aa  49.3  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3058  cointegrate resolution protein S  22.5 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4646  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  28.09 
 
 		 317 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.77 
 
 		 351 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  28.25 
 
 		 335 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3277  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  24.6 
 
 		 375 aa  48.5  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  26.26 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5342  putative cointegrate resolution protein S / recombinase  22.55 
 
 		 277 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4820  phage integrase family protein  25.35 
 
 		 356 aa  47.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3751  integrase family protein  23.97 
 
 		 369 aa  47.8  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4579  phage integrase  27.02 
 
 		 406 aa  47.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.18624  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4229  phage integrase family protein  28.18 
 
 		 329 aa  47  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0180  phage integrase  27.1 
 
 		 336 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0996549 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2926  Phage integrase  22.48 
 
 		 312 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0537176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.22 
 
 		 329 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2981  Tn4652, cointegrate resolution protein S  21.66 
 
 		 323 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0457753 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0012  Phage integrase  25.75 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0173  tyrosine recombinase XerD  29.38 
 
 		 309 aa  45.8  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2185  integrase family protein  27 
 
 		 413 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0291516  hitchhiker  0.00000847111 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4591  integrase family protein  26.95 
 
 		 316 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000000427706  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  26.97 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.46 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.25 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  22.59 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3661  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.28 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  23.2 
 
 		 310 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.81 
 
 		 321 aa  44.3  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0046  putative integrase  27.34 
 
 		 189 aa  44.3  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25710  cointegrate resolution protein S  21.52 
 
 		 325 aa  44.3  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1220  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.06 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>