More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2480 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2480  integrase family protein  100 
 
 		 354 aa  719    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.608661 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4358  phage integrase  71.43 
 
 		 408 aa  478  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4548  phage integrase  70.09 
 
 		 421 aa  473  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.832393  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4195  phage integrase  70.21 
 
 		 408 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0564405  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4579  phage integrase  68.42 
 
 		 406 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.18624  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4792  integrase family protein  67.96 
 
 		 363 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00356022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4576  phage integrase  68.57 
 
 		 357 aa  443  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9008  phage integrase family protein  63.76 
 
 		 377 aa  434  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8006  integrase protein  68.09 
 
 		 378 aa  430  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7008  phage integrase family protein  66.27 
 
 		 387 aa  428  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4820  phage integrase family protein  66.57 
 
 		 356 aa  429  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4027  integrase family protein  58.77 
 
 		 372 aa  391  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.461361  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4239  hypothetical protein  59.72 
 
 		 365 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0653636  normal  0.519885 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3751  integrase family protein  58.66 
 
 		 369 aa  375  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4511  phage integrase  60.29 
 
 		 369 aa  348  1e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.694348  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3404  putative integrase  41.39 
 
 		 291 aa  202  6e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2995  integrase family protein  40.55 
 
 		 323 aa  197  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.941848  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2304  phage integrase  40.29 
 
 		 362 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0327568  normal  0.0181167 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1908  phage integrase family protein  36.05 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.454202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6972  integrase family protein  31.81 
 
 		 329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0164563  normal  0.0336098 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4157  integrase domain-containing protein  36.92 
 
 		 366 aa  133  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118927  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0918  integrase family protein  34 
 
 		 329 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512331  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2870  integrase family protein  36.98 
 
 		 322 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00943332  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3359  integrase family protein  34.31 
 
 		 307 aa  119  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6146  integrase family protein  34.02 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1382  Phage integrase  35.23 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1698  Phage integrase  35.4 
 
 		 328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6851  integrase family protein  31.33 
 
 		 323 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100628  normal  0.271303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4680  integrase family protein  30.77 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0008  DNA integration/recombination/inversion protein  31.49 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.856285  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3434  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  32.72 
 
 		 375 aa  103  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3277  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  32.72 
 
 		 375 aa  102  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2466  integrase family protein  33.45 
 
 		 342 aa  99.4  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0580014  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2752  integrase domain protein SAM domain protein  30.77 
 
 		 362 aa  96.3  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00014768  normal  0.023237 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1962  AP endonuclease  29.82 
 
 		 326 aa  95.5  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6280  integrase family protein  36.6 
 
 		 335 aa  94  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8481  integrase family protein  32.91 
 
 		 353 aa  94  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383754  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7902  integrase family protein  32.26 
 
 		 353 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.356547  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2535  phage integrase family protein  30.65 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6128  integrase family protein  29.94 
 
 		 353 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2380  phage integrase family protein  24.92 
 
 		 371 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.503709  normal  0.032696 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2263  phage integrase family protein  25.31 
 
 		 371 aa  90.1  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00650578  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3181  phage integrase family site specific recombinase  30.34 
 
 		 316 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2244  phage integrase family protein  23.58 
 
 		 380 aa  88.6  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.111867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2082  integrase family protein  24.61 
 
 		 371 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.024543  hitchhiker  0.000210845 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2276  integrase family protein  31.03 
 
 		 311 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00370914  hitchhiker  0.000967634 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3968  phage integrase family protein  29.49 
 
 		 347 aa  87  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2094  integrase family protein  24.92 
 
 		 400 aa  86.3  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000349759  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2382  integrase family protein  24.28 
 
 		 354 aa  85.9  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0941885  normal  0.501513 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2185  integrase family protein  32 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0291516  hitchhiker  0.00000847111 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2669  integrase family protein  29.72 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.261954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4316  phage integrase family protein  25.71 
 
 		 340 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3082  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.62 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.633641  normal  0.120316 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1553  putative integrase/recombinase  30.86 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3133  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2996  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0374572 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2092  phage integrase family protein  25.52 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5646  integrase family protein  29.56 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.575287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0046  putative integrase  33.84 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0031  DNA integration/recombination/inversion protein  37.27 
 
 		 163 aa  80.9  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.976428  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2680  integrase family protein  29.72 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2384  phage integrase family site specific recombinase  21.94 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02951  Phage integrase  29.22 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1943  phage integrase family protein  23.04 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171548  normal  0.0940691 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4367  phage integrase family protein  29.04 
 
 		 335 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1972  integrase family protein  31.09 
 
 		 359 aa  79.3  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.713568  normal  0.0793814 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2033  phage integrase family protein  23.55 
 
 		 369 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0170  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.17 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1996  phage integrase family protein  22.49 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3104  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.45 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494742 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1674  phage integrase family protein  26.91 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198845 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4297  integrase family protein  28.21 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3780  integrase family protein  28.57 
 
 		 383 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.325182  normal  0.557184 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2976  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  29.11 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0607408  normal  0.0219571 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3258  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.45 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.706598  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0392  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.45 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2169  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.45 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126979  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2926  Phage integrase  30.48 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0537176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0195  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.45 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2473  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.12 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.45 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3428  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.45 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2920  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.45 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.510567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3087  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.12 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2249  phage integrase family protein  28.52 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6437  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.33 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.798094 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2511  phage integrase  26.74 
 
 		 448 aa  72.8  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3109  cointegrate resolution protein S  29.45 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00637573  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25710  cointegrate resolution protein S  27.95 
 
 		 325 aa  72.4  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0074  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.82 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4524  phage integrase family protein  33.61 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  27.4 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0052  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.578512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5342  putative cointegrate resolution protein S / recombinase  27.55 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1640  integrase family protein  27.52 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5281  integrase family protein  27.52 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0347  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.97 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2392  integrase family protein  28.23 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0530338  normal  0.472164 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  28.27 
 
 		 343 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2105  integrase family protein  28.23 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>