220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6146 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6146  integrase family protein  100 
 
 		 311 aa  629  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2995  integrase family protein  36.04 
 
 		 323 aa  179  5.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.941848  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0008  DNA integration/recombination/inversion protein  37.2 
 
 		 314 aa  163  3e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.856285  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2304  phage integrase  39.05 
 
 		 362 aa  160  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0327568  normal  0.0181167 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1698  Phage integrase  34.53 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6972  integrase family protein  31.08 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0164563  normal  0.0336098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0918  integrase family protein  34.97 
 
 		 329 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512331  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4157  integrase domain-containing protein  35.09 
 
 		 366 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118927  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6851  integrase family protein  32.36 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100628  normal  0.271303 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1908  phage integrase family protein  35.62 
 
 		 338 aa  136  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.454202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1382  Phage integrase  34.47 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3359  integrase family protein  35.18 
 
 		 307 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4027  integrase family protein  31.49 
 
 		 372 aa  129  8.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.461361  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4297  integrase family protein  28.53 
 
 		 394 aa  129  8.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3968  phage integrase family protein  31.63 
 
 		 347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4792  integrase family protein  36.08 
 
 		 363 aa  125  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00356022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4548  phage integrase  33.68 
 
 		 421 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.832393  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2926  Phage integrase  32.21 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0537176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4316  phage integrase family protein  30.67 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2752  integrase domain protein SAM domain protein  30.49 
 
 		 362 aa  123  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00014768  normal  0.023237 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9008  phage integrase family protein  31.49 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1962  AP endonuclease  29.69 
 
 		 326 aa  122  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4576  phage integrase  34.44 
 
 		 357 aa  122  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2535  phage integrase family protein  32.55 
 
 		 326 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4680  integrase family protein  31.6 
 
 		 346 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1883  site-specific recombinase XerD-like  32.52 
 
 		 649 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4579  phage integrase  31.58 
 
 		 406 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.18624  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3181  phage integrase family site specific recombinase  32.21 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2976  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  30.54 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0607408  normal  0.0219571 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2669  integrase family protein  32.21 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.261954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4820  phage integrase family protein  30.56 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2033  phage integrase family protein  26.67 
 
 		 369 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8006  integrase protein  31.62 
 
 		 378 aa  119  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7008  phage integrase family protein  28.96 
 
 		 387 aa  119  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3277  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  33.44 
 
 		 375 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3434  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  32.8 
 
 		 375 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0046  putative integrase  38.76 
 
 		 189 aa  117  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1996  phage integrase family protein  26.67 
 
 		 369 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2249  phage integrase family protein  31.38 
 
 		 319 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020372  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2384  phage integrase family site specific recombinase  26.67 
 
 		 369 aa  116  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2981  Tn4652, cointegrate resolution protein S  30.58 
 
 		 323 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0457753 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2094  integrase family protein  26.71 
 
 		 400 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000349759  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3109  cointegrate resolution protein S  29.62 
 
 		 319 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00637573  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2466  integrase family protein  32.05 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0580014  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2480  integrase family protein  34.02 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.608661 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02951  Phage integrase  30.68 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1943  phage integrase family protein  26.36 
 
 		 369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171548  normal  0.0940691 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4239  hypothetical protein  33.81 
 
 		 365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0653636  normal  0.519885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2680  integrase family protein  31.68 
 
 		 316 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2082  integrase family protein  26.97 
 
 		 371 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.024543  hitchhiker  0.000210845 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4524  phage integrase family protein  31.21 
 
 		 380 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4195  phage integrase  31.19 
 
 		 408 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0564405  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4358  phage integrase  32.55 
 
 		 408 aa  113  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2263  phage integrase family protein  26.97 
 
 		 371 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00650578  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35820  cointegrate resolution protein S  30.58 
 
 		 323 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000225241  decreased coverage  6.17783e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3058  cointegrate resolution protein S  30.58 
 
 		 323 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3751  integrase family protein  30.36 
 
 		 369 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2380  phage integrase family protein  26.97 
 
 		 371 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.503709  normal  0.032696 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2382  integrase family protein  26.61 
 
 		 354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0941885  normal  0.501513 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9510  phage-related integrase  30.42 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0464246  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7902  integrase family protein  32.06 
 
 		 353 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.356547  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8481  integrase family protein  32.06 
 
 		 353 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383754  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4367  phage integrase family protein  30.08 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3773  integrase family protein  32.61 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4516  phage integrase  32.1 
 
 		 422 aa  107  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2244  phage integrase family protein  25.44 
 
 		 380 aa  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.111867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6161  integrase family protein  30.38 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.365462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25710  cointegrate resolution protein S  30.93 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2870  integrase family protein  33.19 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00943332  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1553  putative integrase/recombinase  31.52 
 
 		 343 aa  102  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2276  integrase family protein  29.5 
 
 		 311 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00370914  hitchhiker  0.000967634 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6128  integrase family protein  31.58 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0031  DNA integration/recombination/inversion protein  37.82 
 
 		 163 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.976428  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4511  phage integrase  30.28 
 
 		 369 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.694348  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2392  integrase family protein  28.67 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0530338  normal  0.472164 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1640  integrase family protein  28.19 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2105  integrase family protein  28.67 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5471  integrase family protein  32.8 
 
 		 382 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5281  integrase family protein  28.19 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4716  phage integrase family protein  32.67 
 
 		 379 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5342  putative cointegrate resolution protein S / recombinase  29.89 
 
 		 277 aa  99.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2092  phage integrase family protein  27.52 
 
 		 406 aa  99  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5431  phage integrase family protein  29.22 
 
 		 391 aa  99  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6280  integrase family protein  31.58 
 
 		 335 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1987  phage integrase family protein  27.21 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6311  integrase family protein  32.97 
 
 		 380 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.692197  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2185  integrase family protein  28.69 
 
 		 413 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0291516  hitchhiker  0.00000847111 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2511  phage integrase  28.18 
 
 		 448 aa  96.3  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00624  cointegrase  27.27 
 
 		 322 aa  91.7  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.281729  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1972  integrase family protein  33.58 
 
 		 359 aa  92  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.713568  normal  0.0793814 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5150  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  34.71 
 
 		 399 aa  90.9  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5646  integrase family protein  30.92 
 
 		 353 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.575287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3964  phage integrase family protein  26.28 
 
 		 380 aa  85.5  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00221994  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1804  integrase family protein  27.68 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000010936 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2261  phage integrase  33.05 
 
 		 353 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.245925  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8553  integrase family protein  32.31 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453986  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3780  integrase family protein  32.23 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.325182  normal  0.557184 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2722  phage integrase family protein  28 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.907602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1674  phage integrase family protein  25.1 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198845 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3404  putative integrase  25.95 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25041  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>