147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4524 on replicon NC_009669
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009669  Oant_4524  phage integrase family protein  100 
 
 
380 aa  766    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4716  phage integrase family protein  79.3 
 
 
379 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5471  integrase family protein  73.67 
 
 
382 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6161  integrase family protein  74.87 
 
 
382 aa  568  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.365462  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6311  integrase family protein  75 
 
 
380 aa  558  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.692197  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9510  phage-related integrase  66.12 
 
 
370 aa  500  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0464246  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5431  phage integrase family protein  64.46 
 
 
391 aa  494  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606096  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3773  integrase family protein  65.04 
 
 
390 aa  471  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4516  phage integrase  62.46 
 
 
422 aa  442  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8553  integrase family protein  58.22 
 
 
424 aa  408  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453986  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2722  phage integrase family protein  41.23 
 
 
367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.907602  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1972  integrase family protein  35.23 
 
 
359 aa  170  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.713568  normal  0.0793814 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2261  phage integrase  33.82 
 
 
353 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.245925  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3780  integrase family protein  34.49 
 
 
383 aa  155  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.325182  normal  0.557184 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1804  integrase family protein  34.27 
 
 
401 aa  140  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000010936 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1991  phage integrase family protein  30.9 
 
 
358 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3042  phage integrase  34.53 
 
 
366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6146  integrase family protein  31.21 
 
 
311 aa  113  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0918  integrase family protein  29.91 
 
 
329 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512331  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2995  integrase family protein  36.32 
 
 
323 aa  94.7  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.941848  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2304  phage integrase  31.25 
 
 
362 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0327568  normal  0.0181167 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0008  DNA integration/recombination/inversion protein  29.55 
 
 
314 aa  93.2  7e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.856285  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4157  integrase domain-containing protein  34.27 
 
 
366 aa  93.2  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118927  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1382  Phage integrase  30.74 
 
 
335 aa  87.8  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3434  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  33.95 
 
 
375 aa  87  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3181  phage integrase family site specific recombinase  30.53 
 
 
316 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2535  phage integrase family protein  30.27 
 
 
326 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2680  integrase family protein  29.92 
 
 
316 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3277  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  32.88 
 
 
375 aa  85.1  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2669  integrase family protein  30.15 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.261954  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25710  cointegrate resolution protein S  28.73 
 
 
325 aa  80.9  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4680  integrase family protein  30.45 
 
 
346 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2976  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  30.68 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0607408  normal  0.0219571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2981  Tn4652, cointegrate resolution protein S  26.79 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0457753 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35820  cointegrate resolution protein S  26.42 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000225241  decreased coverage  6.17783e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3058  cointegrate resolution protein S  26.42 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2276  integrase family protein  27.64 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00370914  hitchhiker  0.000967634 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1883  site-specific recombinase XerD-like  29.65 
 
 
649 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2511  phage integrase  28.57 
 
 
448 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2926  Phage integrase  28.17 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0537176  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1698  Phage integrase  28.61 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4239  hypothetical protein  31.4 
 
 
365 aa  73.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0653636  normal  0.519885 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3968  phage integrase family protein  32.09 
 
 
347 aa  72.8  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2094  integrase family protein  28.45 
 
 
400 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000349759  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3751  integrase family protein  30.75 
 
 
369 aa  72.4  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542126  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4316  phage integrase family protein  25.67 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2249  phage integrase family protein  27.31 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020372  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4792  integrase family protein  29.56 
 
 
363 aa  70.9  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00356022  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4027  integrase family protein  30 
 
 
372 aa  70.9  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.461361  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3109  cointegrate resolution protein S  28.02 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00637573  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8481  integrase family protein  26.82 
 
 
353 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383754  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2392  integrase family protein  27.56 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0530338  normal  0.472164 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2105  integrase family protein  27.56 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7902  integrase family protein  26.82 
 
 
353 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.356547  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1987  phage integrase family protein  27.07 
 
 
319 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02951  Phage integrase  24.1 
 
 
336 aa  69.3  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4367  phage integrase family protein  31.55 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1908  phage integrase family protein  31.8 
 
 
338 aa  68.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.454202  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5281  integrase family protein  26.56 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2480  integrase family protein  33.61 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.608661 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1640  integrase family protein  26.56 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4820  phage integrase family protein  28.57 
 
 
356 aa  67.8  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4462  integrase family protein  25.94 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2244  phage integrase family protein  24.77 
 
 
380 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.111867  normal 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5582  integrase family protein  25.87 
 
 
313 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9008  phage integrase family protein  27.67 
 
 
377 aa  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1674  phage integrase family protein  28.34 
 
 
330 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.198845 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00624  cointegrase  35.35 
 
 
322 aa  65.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.281729  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4591  integrase family protein  29.52 
 
 
316 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000000427706  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6851  integrase family protein  27.73 
 
 
323 aa  64.3  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100628  normal  0.271303 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6128  integrase family protein  27.04 
 
 
353 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440777  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7008  phage integrase family protein  27.04 
 
 
387 aa  63.9  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8006  integrase protein  28.06 
 
 
378 aa  63.2  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2185  integrase family protein  27.08 
 
 
413 aa  62.8  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0291516  hitchhiker  0.00000847111 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1962  AP endonuclease  25.42 
 
 
326 aa  62.4  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4548  phage integrase  32.49 
 
 
421 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.832393  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6972  integrase family protein  24.14 
 
 
329 aa  60.1  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0164563  normal  0.0336098 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2382  integrase family protein  25.32 
 
 
354 aa  60.1  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0941885  normal  0.501513 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5342  putative cointegrate resolution protein S / recombinase  27.83 
 
 
277 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2380  phage integrase family protein  25.56 
 
 
371 aa  59.7  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.503709  normal  0.032696 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4579  phage integrase  32.97 
 
 
406 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.18624  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1943  phage integrase family protein  24.6 
 
 
369 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171548  normal  0.0940691 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2082  integrase family protein  26.34 
 
 
371 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.024543  hitchhiker  0.000210845 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0294  hypothetical protein  64.29 
 
 
88 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.74571 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2384  phage integrase family site specific recombinase  23.44 
 
 
369 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4618  integrase family protein  24.69 
 
 
311 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4358  phage integrase  31.6 
 
 
408 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2033  phage integrase family protein  24.28 
 
 
369 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2263  phage integrase family protein  27.23 
 
 
371 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00650578  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0638  putative phage recombinase  27.19 
 
 
305 aa  58.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0874979  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1996  phage integrase family protein  24.28 
 
 
369 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4511  phage integrase  30.9 
 
 
369 aa  57.4  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.694348  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2466  integrase family protein  30.24 
 
 
342 aa  56.6  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0580014  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3964  phage integrase family protein  29.44 
 
 
380 aa  56.2  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00221994  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1553  putative integrase/recombinase  27.71 
 
 
343 aa  56.2  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4195  phage integrase  32.33 
 
 
408 aa  55.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0564405  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2092  phage integrase family protein  26.36 
 
 
406 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3041  cointegrase  24.7 
 
 
291 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5646  integrase family protein  25.75 
 
 
353 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.575287  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4576  phage integrase  28.63 
 
 
357 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>