138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2870 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2870  integrase family protein  100 
 
 		 322 aa  651    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00943332  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2995  integrase family protein  37.2 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.941848  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2304  phage integrase  36.52 
 
 		 362 aa  149  8e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0327568  normal  0.0181167 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6972  integrase family protein  32.83 
 
 		 329 aa  135  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0164563  normal  0.0336098 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3359  integrase family protein  32.27 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4576  phage integrase  37.2 
 
 		 357 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1698  Phage integrase  33.97 
 
 		 328 aa  126  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4792  integrase family protein  36.82 
 
 		 363 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00356022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4195  phage integrase  35.02 
 
 		 408 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0564405  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4579  phage integrase  33.47 
 
 		 406 aa  123  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.18624  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4358  phage integrase  35.06 
 
 		 408 aa  122  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2480  integrase family protein  36.98 
 
 		 354 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.608661 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4027  integrase family protein  33.72 
 
 		 372 aa  118  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.461361  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4548  phage integrase  34.68 
 
 		 421 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.832393  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4511  phage integrase  33.99 
 
 		 369 aa  116  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.694348  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6851  integrase family protein  32.81 
 
 		 323 aa  115  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100628  normal  0.271303 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1962  AP endonuclease  30.74 
 
 		 326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0918  integrase family protein  32.24 
 
 		 329 aa  112  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512331  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4157  integrase domain-containing protein  34.29 
 
 		 366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118927  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3277  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  34.88 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0008  DNA integration/recombination/inversion protein  34.85 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.856285  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6280  integrase family protein  34.41 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9008  phage integrase family protein  31.98 
 
 		 377 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4239  hypothetical protein  32.87 
 
 		 365 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0653636  normal  0.519885 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3434  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  35.35 
 
 		 375 aa  107  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4367  phage integrase family protein  32.95 
 
 		 335 aa  106  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8006  integrase protein  32.81 
 
 		 378 aa  106  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02951  Phage integrase  31.88 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1382  Phage integrase  32.16 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3968  phage integrase family protein  31.95 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4820  phage integrase family protein  31.82 
 
 		 356 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3751  integrase family protein  33.33 
 
 		 369 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6146  integrase family protein  31.35 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2752  integrase domain protein SAM domain protein  33.95 
 
 		 362 aa  103  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00014768  normal  0.023237 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1908  phage integrase family protein  33.04 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.454202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5281  integrase family protein  32.34 
 
 		 320 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2244  phage integrase family protein  30.52 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.111867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7008  phage integrase family protein  30.47 
 
 		 387 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1640  integrase family protein  32.34 
 
 		 320 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5342  putative cointegrate resolution protein S / recombinase  32 
 
 		 277 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2382  integrase family protein  28.43 
 
 		 354 aa  100  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0941885  normal  0.501513 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2535  phage integrase family protein  32.97 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2094  integrase family protein  28.57 
 
 		 400 aa  98.2  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000349759  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2926  Phage integrase  34.6 
 
 		 312 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0537176  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2384  phage integrase family site specific recombinase  30.04 
 
 		 369 aa  96.7  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1883  site-specific recombinase XerD-like  28.83 
 
 		 649 aa  96.3  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3181  phage integrase family site specific recombinase  32.61 
 
 		 316 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2669  integrase family protein  32.61 
 
 		 316 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.261954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4316  phage integrase family protein  29.15 
 
 		 340 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2680  integrase family protein  33.7 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2976  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  36.97 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0607408  normal  0.0219571 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1943  phage integrase family protein  29.61 
 
 		 369 aa  92.4  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171548  normal  0.0940691 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2466  integrase family protein  29.84 
 
 		 342 aa  92.4  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0580014  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2033  phage integrase family protein  29.61 
 
 		 369 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2263  phage integrase family protein  26.83 
 
 		 371 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00650578  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1996  phage integrase family protein  29.18 
 
 		 369 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2082  integrase family protein  26.52 
 
 		 371 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.024543  hitchhiker  0.000210845 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0046  putative integrase  33.17 
 
 		 189 aa  90.5  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4680  integrase family protein  30.18 
 
 		 346 aa  90.1  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3109  cointegrate resolution protein S  35.17 
 
 		 319 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00637573  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2380  phage integrase family protein  26.83 
 
 		 371 aa  89.4  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.503709  normal  0.032696 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2092  phage integrase family protein  28.98 
 
 		 406 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8481  integrase family protein  31.72 
 
 		 353 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383754  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7902  integrase family protein  31.72 
 
 		 353 aa  87  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.356547  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1987  phage integrase family protein  31.17 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2249  phage integrase family protein  32.77 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2276  integrase family protein  33.33 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00370914  hitchhiker  0.000967634 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4297  integrase family protein  28.57 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2185  integrase family protein  32.3 
 
 		 413 aa  80.1  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0291516  hitchhiker  0.00000847111 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1553  putative integrase/recombinase  28.74 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25710  cointegrate resolution protein S  31.36 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2511  phage integrase  29.63 
 
 		 448 aa  77  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00624  cointegrase  32.37 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.281729  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2981  Tn4652, cointegrate resolution protein S  27.84 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0457753 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6128  integrase family protein  29.2 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5646  integrase family protein  29.63 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.575287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35820  cointegrate resolution protein S  30.96 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000225241  decreased coverage  6.17783e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3058  cointegrate resolution protein S  30.96 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3404  putative integrase  30.29 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0031  DNA integration/recombination/inversion protein  31.61 
 
 		 163 aa  70.9  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.976428  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2105  integrase family protein  28.7 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2392  integrase family protein  28.7 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0530338  normal  0.472164 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3964  phage integrase family protein  25.48 
 
 		 380 aa  69.7  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00221994  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5150  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  32.35 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2722  phage integrase family protein  27.64 
 
 		 367 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.907602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4377  phage integrase family protein  24.12 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.53808 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1674  phage integrase family protein  24.27 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198845 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0237  phage integrase family protein  24.12 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1326  integrase family protein  23.72 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.847423  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  24.14 
 
 		 295 aa  55.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0229  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  26.21 
 
 		 362 aa  54.3  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0287  integrase domain protein SAM domain protein  26.19 
 
 		 362 aa  53.9  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  30.41 
 
 		 297 aa  52.8  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3773  integrase family protein  24.14 
 
 		 390 aa  52.8  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9510  phage-related integrase  27.21 
 
 		 370 aa  52.8  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0464246  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  26.84 
 
 		 297 aa  52.8  0.000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1468  phage integrase family protein  39.51 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  28.71 
 
 		 343 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  28.71 
 
 		 343 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2261  phage integrase  27 
 
 		 353 aa  50.4  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.245925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>