123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2276 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2276  integrase family protein  100 
 
 		 311 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00370914  hitchhiker  0.000967634 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2249  phage integrase family protein  54.73 
 
 		 319 aa  331  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020372  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3181  phage integrase family site specific recombinase  56.57 
 
 		 316 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2535  phage integrase family protein  56.57 
 
 		 326 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2669  integrase family protein  55.67 
 
 		 316 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.261954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2680  integrase family protein  56.15 
 
 		 316 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35820  cointegrate resolution protein S  53.67 
 
 		 323 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000225241  decreased coverage  6.17783e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3058  cointegrate resolution protein S  53.67 
 
 		 323 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2976  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  52.03 
 
 		 319 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0607408  normal  0.0219571 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25710  cointegrate resolution protein S  53 
 
 		 325 aa  312  5.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2981  Tn4652, cointegrate resolution protein S  53.18 
 
 		 323 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0457753 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2926  Phage integrase  50.34 
 
 		 312 aa  308  9e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0537176  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3109  cointegrate resolution protein S  51.01 
 
 		 319 aa  305  7e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00637573  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00624  cointegrase  54.88 
 
 		 322 aa  305  7e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.281729  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5281  integrase family protein  52.17 
 
 		 320 aa  301  9e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1640  integrase family protein  52.17 
 
 		 320 aa  301  9e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2105  integrase family protein  48.97 
 
 		 313 aa  293  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2392  integrase family protein  48.97 
 
 		 313 aa  293  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0530338  normal  0.472164 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1987  phage integrase family protein  45.97 
 
 		 319 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2511  phage integrase  44.86 
 
 		 448 aa  272  6e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5342  putative cointegrate resolution protein S / recombinase  48.5 
 
 		 277 aa  249  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3964  phage integrase family protein  35.18 
 
 		 380 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00221994  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4367  phage integrase family protein  38.19 
 
 		 335 aa  179  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02951  Phage integrase  37.28 
 
 		 336 aa  177  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3968  phage integrase family protein  36.59 
 
 		 347 aa  176  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4316  phage integrase family protein  35.99 
 
 		 340 aa  176  5e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1698  Phage integrase  37.7 
 
 		 328 aa  176  6e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0918  integrase family protein  40.75 
 
 		 329 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512331  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1962  AP endonuclease  34.81 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3041  cointegrase  33.93 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1382  Phage integrase  39.87 
 
 		 335 aa  166  5e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0008  DNA integration/recombination/inversion protein  35.76 
 
 		 314 aa  160  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.856285  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2995  integrase family protein  33.08 
 
 		 323 aa  132  7.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.941848  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4157  integrase domain-containing protein  32.69 
 
 		 366 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118927  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2304  phage integrase  31.53 
 
 		 362 aa  109  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0327568  normal  0.0181167 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0046  putative integrase  38.8 
 
 		 189 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4792  integrase family protein  32.53 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00356022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6146  integrase family protein  29.5 
 
 		 311 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2466  integrase family protein  32.31 
 
 		 342 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0580014  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4548  phage integrase  30.77 
 
 		 421 aa  99.8  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.832393  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4027  integrase family protein  30.66 
 
 		 372 aa  99.8  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.461361  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9008  phage integrase family protein  30.45 
 
 		 377 aa  99.8  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8006  integrase protein  30.58 
 
 		 378 aa  97.8  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1908  phage integrase family protein  29.87 
 
 		 338 aa  97.8  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.454202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4576  phage integrase  30.21 
 
 		 357 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4358  phage integrase  30.33 
 
 		 408 aa  97.4  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8481  integrase family protein  29.43 
 
 		 353 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383754  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7902  integrase family protein  29.43 
 
 		 353 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.356547  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7008  phage integrase family protein  28.77 
 
 		 387 aa  96.3  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1996  phage integrase family protein  26.48 
 
 		 369 aa  95.9  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4195  phage integrase  29.67 
 
 		 408 aa  95.1  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0564405  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4579  phage integrase  28.96 
 
 		 406 aa  95.5  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.18624  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1943  phage integrase family protein  26.37 
 
 		 369 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171548  normal  0.0940691 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2033  phage integrase family protein  26.83 
 
 		 369 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0031  DNA integration/recombination/inversion protein  39.13 
 
 		 163 aa  94.4  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.976428  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3751  integrase family protein  32.4 
 
 		 369 aa  94.7  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2244  phage integrase family protein  27.47 
 
 		 380 aa  94  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.111867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3359  integrase family protein  33.33 
 
 		 307 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6972  integrase family protein  26.5 
 
 		 329 aa  91.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0164563  normal  0.0336098 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2384  phage integrase family site specific recombinase  26.83 
 
 		 369 aa  91.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4820  phage integrase family protein  28.03 
 
 		 356 aa  91.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1674  phage integrase family protein  27.03 
 
 		 330 aa  90.5  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198845 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2380  phage integrase family protein  26.3 
 
 		 371 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.503709  normal  0.032696 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2082  integrase family protein  26.3 
 
 		 371 aa  89.7  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.024543  hitchhiker  0.000210845 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4511  phage integrase  31.62 
 
 		 369 aa  89.4  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.694348  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2382  integrase family protein  26.77 
 
 		 354 aa  89  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0941885  normal  0.501513 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2263  phage integrase family protein  26.3 
 
 		 371 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00650578  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6851  integrase family protein  27.11 
 
 		 323 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100628  normal  0.271303 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2480  integrase family protein  31.03 
 
 		 354 aa  87.8  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.608661 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2094  integrase family protein  26.79 
 
 		 400 aa  87.4  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000349759  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6280  integrase family protein  33.45 
 
 		 335 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4297  integrase family protein  26.56 
 
 		 394 aa  85.9  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3277  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  31.15 
 
 		 375 aa  85.9  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2870  integrase family protein  33.33 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00943332  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2185  integrase family protein  29.23 
 
 		 413 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0291516  hitchhiker  0.00000847111 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3434  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  30.74 
 
 		 375 aa  84  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2092  phage integrase family protein  26.64 
 
 		 406 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4239  hypothetical protein  31.01 
 
 		 365 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0653636  normal  0.519885 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3780  integrase family protein  30.49 
 
 		 383 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.325182  normal  0.557184 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4524  phage integrase family protein  27.64 
 
 		 380 aa  79.7  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5646  integrase family protein  26.54 
 
 		 353 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.575287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4516  phage integrase  27.38 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6128  integrase family protein  25.76 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1553  putative integrase/recombinase  34.34 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9510  phage-related integrase  29.3 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0464246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4680  integrase family protein  26.76 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1883  site-specific recombinase XerD-like  27.8 
 
 		 649 aa  76.6  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3773  integrase family protein  30.3 
 
 		 390 aa  75.9  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6311  integrase family protein  26.28 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.692197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4716  phage integrase family protein  25.09 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0638  putative phage recombinase  25.87 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0874979  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5471  integrase family protein  25 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6161  integrase family protein  26.09 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.365462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2752  integrase domain protein SAM domain protein  26.95 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00014768  normal  0.023237 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0237  phage integrase family protein  26.56 
 
 		 331 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2261  phage integrase  26.12 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.245925  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4377  phage integrase family protein  26.56 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.53808 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5431  phage integrase family protein  28.51 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8553  integrase family protein  28.1 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453986  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5150  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384118  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>