76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0237 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0237  phage integrase family protein  100 
 
 		 331 aa  688    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4377  phage integrase family protein  97.89 
 
 		 371 aa  676    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.53808 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6128  integrase family protein  30.46 
 
 		 353 aa  142  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8481  integrase family protein  30.46 
 
 		 353 aa  142  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383754  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7902  integrase family protein  30.46 
 
 		 353 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.356547  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5646  integrase family protein  30.16 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.575287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5150  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  27.33 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1674  phage integrase family protein  25.61 
 
 		 330 aa  98.2  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198845 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2995  integrase family protein  27.36 
 
 		 323 aa  95.1  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.941848  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0638  putative phage recombinase  25.41 
 
 		 305 aa  86.7  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0874979  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1883  site-specific recombinase XerD-like  27.88 
 
 		 649 aa  86.3  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2244  phage integrase family protein  28.18 
 
 		 380 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.111867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2094  integrase family protein  25.17 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000349759  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0918  integrase family protein  26.67 
 
 		 329 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512331  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2382  integrase family protein  28.87 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0941885  normal  0.501513 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02045  Site-specific recombinase XerD-like protein  23.77 
 
 		 424 aa  69.7  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.317068  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02951  Phage integrase  24.5 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1996  phage integrase family protein  27.51 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0008  DNA integration/recombination/inversion protein  27.03 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.856285  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2304  phage integrase  25.5 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0327568  normal  0.0181167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2033  phage integrase family protein  27.07 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2384  phage integrase family site specific recombinase  26.72 
 
 		 369 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2466  integrase family protein  25.89 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0580014  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2276  integrase family protein  26.56 
 
 		 311 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00370914  hitchhiker  0.000967634 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1943  phage integrase family protein  26.64 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171548  normal  0.0940691 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4316  phage integrase family protein  24.73 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3968  phage integrase family protein  22.96 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1698  Phage integrase  25.5 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3359  integrase family protein  25.68 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2263  phage integrase family protein  25.44 
 
 		 371 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00650578  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4680  integrase family protein  22.97 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2082  integrase family protein  27.66 
 
 		 371 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.024543  hitchhiker  0.000210845 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2092  phage integrase family protein  28.34 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1908  phage integrase family protein  30.67 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.454202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1962  AP endonuclease  25.52 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2870  integrase family protein  24.12 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00943332  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3434  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  26.96 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2380  phage integrase family protein  27.13 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.503709  normal  0.032696 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2680  integrase family protein  23.99 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35820  cointegrate resolution protein S  25 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000225241  decreased coverage  6.17783e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3058  cointegrate resolution protein S  25 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3277  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  26.62 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1553  putative integrase/recombinase  25.13 
 
 		 343 aa  57  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4157  integrase domain-containing protein  24.48 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118927  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3181  phage integrase family site specific recombinase  23.62 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2669  integrase family protein  23.25 
 
 		 316 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.261954  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2981  Tn4652, cointegrate resolution protein S  25.65 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0457753 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2535  phage integrase family protein  23.62 
 
 		 326 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4297  integrase family protein  25 
 
 		 394 aa  55.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6146  integrase family protein  23.56 
 
 		 311 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25710  cointegrate resolution protein S  25 
 
 		 325 aa  53.5  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3109  cointegrate resolution protein S  25.65 
 
 		 319 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00637573  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6280  integrase family protein  26.2 
 
 		 335 aa  52.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4367  phage integrase family protein  23.67 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2249  phage integrase family protein  24.68 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2105  integrase family protein  23.21 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2392  integrase family protein  23.21 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0530338  normal  0.472164 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00624  cointegrase  23.46 
 
 		 322 aa  48.5  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.281729  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3964  phage integrase family protein  22.41 
 
 		 380 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00221994  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2976  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  24.16 
 
 		 319 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0607408  normal  0.0219571 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1987  phage integrase family protein  23.91 
 
 		 319 aa  47.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2511  phage integrase  20.86 
 
 		 448 aa  46.6  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6972  integrase family protein  25.57 
 
 		 329 aa  46.2  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0164563  normal  0.0336098 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9008  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 377 aa  46.2  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0046  putative integrase  28.86 
 
 		 189 aa  46.2  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4792  integrase family protein  27.22 
 
 		 363 aa  46.2  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00356022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2752  integrase domain protein SAM domain protein  25.15 
 
 		 362 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00014768  normal  0.023237 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1382  Phage integrase  21.78 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3773  integrase family protein  23.06 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8006  integrase protein  45.95 
 
 		 378 aa  43.9  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2926  Phage integrase  24.63 
 
 		 312 aa  43.9  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0537176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6851  integrase family protein  26.32 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100628  normal  0.271303 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7008  phage integrase family protein  25.64 
 
 		 387 aa  42.7  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2751  hypothetical protein  36.21 
 
 		 298 aa  42.7  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000220273  normal  0.0224901 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4358  phage integrase  24.67 
 
 		 408 aa  42.7  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4820  phage integrase family protein  44.44 
 
 		 356 aa  42.7  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>