128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5471 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5471  integrase family protein  100 
 
 		 382 aa  770    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6161  integrase family protein  77.23 
 
 		 382 aa  608  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.365462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6311  integrase family protein  82.31 
 
 		 380 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.692197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4524  phage integrase family protein  73.67 
 
 		 380 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4716  phage integrase family protein  73.66 
 
 		 379 aa  567  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9510  phage-related integrase  66.94 
 
 		 370 aa  503  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0464246  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5431  phage integrase family protein  64.46 
 
 		 391 aa  487  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3773  integrase family protein  63.96 
 
 		 390 aa  462  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4516  phage integrase  63.59 
 
 		 422 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8553  integrase family protein  59.89 
 
 		 424 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453986  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2722  phage integrase family protein  42.22 
 
 		 367 aa  196  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.907602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1972  integrase family protein  34.36 
 
 		 359 aa  166  9e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.713568  normal  0.0793814 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2261  phage integrase  34.26 
 
 		 353 aa  159  7e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.245925  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3780  integrase family protein  33.53 
 
 		 383 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.325182  normal  0.557184 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1804  integrase family protein  32.24 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000010936 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3042  phage integrase  35.01 
 
 		 366 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1991  phage integrase family protein  30.92 
 
 		 358 aa  112  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0918  integrase family protein  29.85 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512331  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6146  integrase family protein  32.8 
 
 		 311 aa  100  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2304  phage integrase  33.44 
 
 		 362 aa  99.8  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0327568  normal  0.0181167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4157  integrase domain-containing protein  32 
 
 		 366 aa  94  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118927  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3434  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  34.56 
 
 		 375 aa  90.9  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3277  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  34.1 
 
 		 375 aa  88.6  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0008  DNA integration/recombination/inversion protein  30.86 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.856285  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2995  integrase family protein  29.38 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.941848  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2511  phage integrase  29.3 
 
 		 448 aa  84.3  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4680  integrase family protein  28.11 
 
 		 346 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1382  Phage integrase  30.28 
 
 		 335 aa  79  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1698  Phage integrase  29.52 
 
 		 328 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3968  phage integrase family protein  24.52 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25710  cointegrate resolution protein S  27.15 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1883  site-specific recombinase XerD-like  28.76 
 
 		 649 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1908  phage integrase family protein  31.76 
 
 		 338 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.454202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2276  integrase family protein  25 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00370914  hitchhiker  0.000967634 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1674  phage integrase family protein  29.15 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198845 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2669  integrase family protein  25.94 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.261954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2105  integrase family protein  27.27 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2392  integrase family protein  27.27 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0530338  normal  0.472164 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2680  integrase family protein  26.8 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3181  phage integrase family site specific recombinase  26.32 
 
 		 316 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2976  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  27.44 
 
 		 319 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0607408  normal  0.0219571 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2926  Phage integrase  25 
 
 		 312 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0537176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1987  phage integrase family protein  27.2 
 
 		 319 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35820  cointegrate resolution protein S  23.92 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000225241  decreased coverage  6.17783e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3058  cointegrate resolution protein S  23.92 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02951  Phage integrase  23.7 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2981  Tn4652, cointegrate resolution protein S  28.57 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0457753 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2535  phage integrase family protein  25.94 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4316  phage integrase family protein  23.89 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4367  phage integrase family protein  26.29 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3109  cointegrate resolution protein S  25.94 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00637573  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4792  integrase family protein  29.11 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00356022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4591  integrase family protein  25.38 
 
 		 316 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000000427706  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3751  integrase family protein  27.74 
 
 		 369 aa  62.8  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4462  integrase family protein  25.11 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5582  integrase family protein  24.29 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6972  integrase family protein  24.16 
 
 		 329 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0164563  normal  0.0336098 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4579  phage integrase  28.98 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.18624  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2185  integrase family protein  26.84 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0291516  hitchhiker  0.00000847111 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2249  phage integrase family protein  30.06 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2094  integrase family protein  26.41 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000349759  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5281  integrase family protein  28.16 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1640  integrase family protein  28.16 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6128  integrase family protein  26.1 
 
 		 353 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4358  phage integrase  31.74 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0294  hypothetical protein  64.29 
 
 		 88 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.74571 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1962  AP endonuclease  24.22 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5342  putative cointegrate resolution protein S / recombinase  31.08 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4195  phage integrase  30.87 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0564405  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00624  cointegrase  32 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.281729  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4548  phage integrase  30.04 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.832393  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3041  cointegrase  23.87 
 
 		 291 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4820  phage integrase family protein  26.25 
 
 		 356 aa  57  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4027  integrase family protein  28.27 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.461361  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4239  hypothetical protein  28.44 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0653636  normal  0.519885 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4297  integrase family protein  35.37 
 
 		 394 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0012  Phage integrase  24.62 
 
 		 320 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9008  phage integrase family protein  30.51 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3359  integrase family protein  32.5 
 
 		 307 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5150  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  25.94 
 
 		 399 aa  54.3  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8006  integrase protein  26.07 
 
 		 378 aa  54.7  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4576  phage integrase  31.03 
 
 		 357 aa  53.9  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4618  integrase family protein  23.38 
 
 		 311 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8481  integrase family protein  26.35 
 
 		 353 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383754  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2480  integrase family protein  29.79 
 
 		 354 aa  53.9  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.608661 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3404  putative integrase  31.34 
 
 		 291 aa  53.5  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2389  integrase family protein  27.98 
 
 		 345 aa  53.1  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000168042  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2382  integrase family protein  24.38 
 
 		 354 aa  53.1  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0941885  normal  0.501513 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0423  integrase family protein  29.17 
 
 		 304 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2466  integrase family protein  28.02 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0580014  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7902  integrase family protein  26.35 
 
 		 353 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.356547  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7008  phage integrase family protein  26.27 
 
 		 387 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2384  phage integrase family site specific recombinase  23.32 
 
 		 369 aa  50.8  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4067  integrase/recombinase  28.95 
 
 		 324 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130649  normal  0.280594 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6851  integrase family protein  24.69 
 
 		 323 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100628  normal  0.271303 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3964  phage integrase family protein  26.67 
 
 		 380 aa  50.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00221994  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  26.25 
 
 		 302 aa  50.1  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02665  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.62 
 
 		 336 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2752  integrase domain protein SAM domain protein  27.27 
 
 		 362 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00014768  normal  0.023237 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0645  integrase family protein  27.8 
 
 		 328 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000112195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>