279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42625 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42625  predicted protein  100 
 
 
724 aa  1497    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07704  polyubiquitin binding protein (Doa1/Ufd3), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08370)  28.16 
 
 
811 aa  157  6e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00597659  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85406  predicted protein  27.79 
 
 
780 aa  142  1.9999999999999998e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.920544 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05350  Phospholipase A-2-activating protein, putative  31.2 
 
 
842 aa  130  6e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  27.36 
 
 
1652 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  28.09 
 
 
1454 aa  97.1  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  27.8 
 
 
1831 aa  95.5  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.46 
 
 
740 aa  92.4  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  28.32 
 
 
344 aa  91.7  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  25.7 
 
 
1247 aa  92  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  27.03 
 
 
1236 aa  91.3  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  25.55 
 
 
1523 aa  90.5  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  25.95 
 
 
1364 aa  88.6  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  28.31 
 
 
344 aa  88.6  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  31.97 
 
 
696 aa  88.6  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  25.45 
 
 
1443 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25 
 
 
1557 aa  86.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  29.93 
 
 
742 aa  85.1  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  25.86 
 
 
1280 aa  84.3  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.01 
 
 
642 aa  84  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  24.02 
 
 
1363 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  28.25 
 
 
1661 aa  82.4  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  27.45 
 
 
1190 aa  83.2  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  26.13 
 
 
1242 aa  82  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  26.01 
 
 
1304 aa  81.6  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.72 
 
 
930 aa  80.9  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  25.21 
 
 
1213 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  26.96 
 
 
1807 aa  80.5  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.07 
 
 
792 aa  80.5  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  26.84 
 
 
1510 aa  80.5  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  25.25 
 
 
464 aa  79.7  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  27.95 
 
 
1868 aa  79.7  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  24.16 
 
 
1901 aa  78.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1643  WD-40 repeat protein  30.04 
 
 
520 aa  78.2  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1670  WD-40 repeat protein  30.04 
 
 
520 aa  77.8  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  22.8 
 
 
947 aa  78.2  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.46 
 
 
1240 aa  77.4  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22868  predicted protein  25.92 
 
 
551 aa  77.4  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  27.42 
 
 
1188 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  25.81 
 
 
657 aa  77  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  23.6 
 
 
1163 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.27 
 
 
1481 aa  77  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  25.41 
 
 
1789 aa  76.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  24.16 
 
 
1196 aa  75.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.41 
 
 
676 aa  75.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  24.04 
 
 
578 aa  75.5  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.85 
 
 
682 aa  75.5  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.01 
 
 
1711 aa  75.1  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  26.05 
 
 
1656 aa  73.9  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.62 
 
 
1626 aa  73.9  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  24.2 
 
 
1367 aa  73.9  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.24 
 
 
1686 aa  73.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.52 
 
 
576 aa  73.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.77 
 
 
664 aa  73.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  26.64 
 
 
434 aa  73.2  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  26.52 
 
 
574 aa  72.8  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27 
 
 
596 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  26.86 
 
 
317 aa  72  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  25.59 
 
 
1221 aa  72  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.73 
 
 
1760 aa  71.6  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  25.93 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  24.08 
 
 
505 aa  71.2  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  26.36 
 
 
1858 aa  70.9  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  23.86 
 
 
1552 aa  70.9  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32006  WD domain protein  25.65 
 
 
367 aa  70.9  0.00000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.69 
 
 
1072 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  26.64 
 
 
1599 aa  70.1  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.42 
 
 
1072 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  23.32 
 
 
1411 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  27.59 
 
 
1766 aa  69.3  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  23.91 
 
 
1484 aa  69.7  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  25.89 
 
 
1553 aa  69.7  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  25.65 
 
 
316 aa  68.9  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  27.59 
 
 
1878 aa  68.9  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.13 
 
 
677 aa  68.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.42 
 
 
1547 aa  68.9  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.81 
 
 
1607 aa  68.6  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.58 
 
 
1609 aa  68.2  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  24.16 
 
 
1211 aa  68.2  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  23.06 
 
 
1474 aa  68.2  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.18 
 
 
630 aa  68.2  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  24.67 
 
 
728 aa  68.2  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  24.24 
 
 
1176 aa  68.2  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  24.4 
 
 
1161 aa  67.8  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  24.4 
 
 
1161 aa  67.8  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  26.55 
 
 
774 aa  67.4  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  23.12 
 
 
1330 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  25.47 
 
 
589 aa  66.6  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  23.91 
 
 
1311 aa  66.2  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  26.9 
 
 
316 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  27.03 
 
 
1193 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  25.61 
 
 
1208 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.22 
 
 
1599 aa  65.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1024  hypothetical protein  24.92 
 
 
1026 aa  65.1  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000341432  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  22.35 
 
 
1348 aa  65.1  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.37 
 
 
608 aa  65.1  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.84 
 
 
1823 aa  64.7  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  27.17 
 
 
1041 aa  64.3  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2599  WD-40 repeat protein  27.47 
 
 
511 aa  64.7  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.34 
 
 
692 aa  64.7  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>