More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1167 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1167  Signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 415 aa  857    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5603  histidine kinase  33.92 
 
 		 401 aa  234  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.833057 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1230  histidine kinase  31.92 
 
 		 432 aa  224  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.109044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5220  histidine kinase  33.1 
 
 		 438 aa  212  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5435  histidine kinase  32.08 
 
 		 455 aa  203  4e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268395  normal  0.150207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5074  histidine kinase  31.35 
 
 		 432 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.299774  normal  0.0561141 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2272  signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 405 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0838536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6039  histidine kinase  29.47 
 
 		 406 aa  149  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.56272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3102  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.66 
 
 		 1418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5175  histidine kinase  33.88 
 
 		 291 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5914  histidine kinase  28.12 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2114  signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4687  histidine kinase  26.63 
 
 		 409 aa  129  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.336228  normal  0.0853852 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0873  histidine kinase  26.39 
 
 		 396 aa  123  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00136581  normal  0.0338555 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2352  histidine kinase  34.8 
 
 		 441 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1526  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 		 733 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0396333  normal  0.047905 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2880  signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 733 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5254  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 		 579 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601488  normal  0.0228125 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 		 733 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  27.27 
 
 		 998 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.03 
 
 		 1145 aa  109  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2606  signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 		 458 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0231945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4547  signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 		 458 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.43 
 
 		 947 aa  106  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  28.94 
 
 		 1150 aa  106  9e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0186  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 		 657 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00908915 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0340  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.1 
 
 		 816 aa  106  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  28 
 
 		 1169 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.18 
 
 		 1174 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0229  histidine kinase  29.17 
 
 		 724 aa  104  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0610831  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.16 
 
 		 653 aa  103  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 		 1138 aa  103  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.69 
 
 		 1152 aa  102  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0636  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 		 535 aa  100  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318643  normal  0.125988 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.57 
 
 		 1691 aa  101  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4481  sensor histidine kinase/response regulator  27.45 
 
 		 982 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.13 
 
 		 1172 aa  100  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.54 
 
 		 1152 aa  100  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.95 
 
 		 1316 aa  100  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3356  histidine kinase  34.87 
 
 		 633 aa  100  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0907  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.06 
 
 		 919 aa  100  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.651038 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 1029 aa  100  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 1177 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 		 1172 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  27.89 
 
 		 1361 aa  100  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1150  signal transduction histidine kinase-like protein  28.86 
 
 		 609 aa  100  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3717  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 		 663 aa  100  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143813 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4376  histidine kinase  32.44 
 
 		 593 aa  99.8  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904194  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2985  fused histidine kinase sensor/response regulator  29.72 
 
 		 1121 aa  99.4  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.446873 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  24.34 
 
 		 1160 aa  99.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0136  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.91 
 
 		 912 aa  98.6  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0699  signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 744 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.324444  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.81 
 
 		 1116 aa  98.2  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.09 
 
 		 1362 aa  97.8  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1251  histidine kinase  28.85 
 
 		 477 aa  97.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0537245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.33 
 
 		 1167 aa  97.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2593  hybrid histidine kinase  28.85 
 
 		 477 aa  97.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2922  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.72 
 
 		 883 aa  97.1  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4194  histidine kinase  27.71 
 
 		 452 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100725  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  28.03 
 
 		 1145 aa  96.7  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000536  autoinducer 2 sensor kinase/phosphatase LuxQ  27.38 
 
 		 858 aa  96.7  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.47 
 
 		 1260 aa  96.7  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 582 aa  96.3  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 827 aa  96.3  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3009  histidine kinase  25.42 
 
 		 603 aa  96.3  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03280  hybrid sensory histidine protein kinase  27.92 
 
 		 957 aa  95.5  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.558043  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.03 
 
 		 1146 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0262  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 		 545 aa  95.9  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.446369  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0298  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.45 
 
 		 899 aa  95.9  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0542846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.03 
 
 		 1146 aa  96.3  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.03 
 
 		 1145 aa  95.5  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0291  sensor histidine kinase  30.71 
 
 		 545 aa  94.7  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  27.76 
 
 		 1168 aa  95.1  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.4 
 
 		 1169 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2676  histidine kinase  29.08 
 
 		 676 aa  95.5  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00458174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4974  sensor histidine kinase  28.46 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02280  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  27.13 
 
 		 509 aa  95.1  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  28.4 
 
 		 1177 aa  95.1  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1930  histidine kinase  30.71 
 
 		 476 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.592963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.4 
 
 		 1168 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.02 
 
 		 1169 aa  95.1  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.03 
 
 		 680 aa  95.1  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.03 
 
 		 1146 aa  95.5  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.03 
 
 		 1146 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2939  histidine kinase  28.11 
 
 		 447 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.012617 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  28.03 
 
 		 1146 aa  94.7  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1712  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.63 
 
 		 1173 aa  94.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0980923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1470  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 		 1140 aa  94.7  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2698  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.48 
 
 		 595 aa  94.7  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.155122 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  26.97 
 
 		 918 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  28.68 
 
 		 1055 aa  94.4  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19340  putative sensor/response regulator hybrid  26.69 
 
 		 918 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3519  histidine kinase  29.61 
 
 		 448 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0922492  normal  0.751112 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.74 
 
 		 862 aa  94  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1221  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 525 aa  94  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0121657 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0553  histidine kinase  23.66 
 
 		 395 aa  94  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1852  histidine kinase  30.25 
 
 		 1074 aa  94  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.496494  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.55 
 
 		 1237 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  28.35 
 
 		 1147 aa  93.2  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.65 
 
 		 1146 aa  93.2  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>