More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5074 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5074  histidine kinase  100 
 
 
432 aa  866    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.299774  normal  0.0561141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5435  histidine kinase  34.17 
 
 
455 aa  233  7.000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268395  normal  0.150207 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5220  histidine kinase  33.96 
 
 
438 aa  210  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1167  Signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 
415 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1230  histidine kinase  30.34 
 
 
432 aa  199  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.109044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5603  histidine kinase  32.93 
 
 
401 aa  196  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.833057 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3102  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  39.92 
 
 
1418 aa  173  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5175  histidine kinase  36.62 
 
 
291 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2114  signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 
405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5914  histidine kinase  27.38 
 
 
405 aa  124  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4687  histidine kinase  27.58 
 
 
409 aa  123  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.336228  normal  0.0853852 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6039  histidine kinase  26.2 
 
 
406 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.56272 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.9 
 
 
1362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  26.01 
 
 
1361 aa  110  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2272  signal transduction histidine kinase  25.68 
 
 
405 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0838536  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06167  sensor protein LuxQ  25.78 
 
 
594 aa  100  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0873  histidine kinase  24.32 
 
 
396 aa  100  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00136581  normal  0.0338555 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2606  signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
458 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0231945  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4547  signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
458 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130611  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 
1120 aa  97.8  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0229  histidine kinase  28.4 
 
 
724 aa  97.1  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0610831  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  25.43 
 
 
763 aa  96.7  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0559  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.24 
 
 
704 aa  95.5  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.33 
 
 
785 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0553  histidine kinase  25.76 
 
 
395 aa  94.7  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  24.55 
 
 
1160 aa  94.7  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2759  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 
785 aa  94.4  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3666  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  29.15 
 
 
1129 aa  92.8  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0852  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.64 
 
 
859 aa  92.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  28.74 
 
 
1177 aa  92  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.56 
 
 
1070 aa  92  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4555  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.62 
 
 
406 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.330139  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.87 
 
 
875 aa  90.9  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.19 
 
 
738 aa  90.9  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.46 
 
 
959 aa  90.5  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.33 
 
 
1322 aa  90.5  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  26.85 
 
 
677 aa  90.5  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  28.52 
 
 
1322 aa  90.5  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4222  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.37 
 
 
1002 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480663  normal  0.970552 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 
467 aa  90.1  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2835  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.74 
 
 
964 aa  90.1  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.106901  decreased coverage  0.00127572 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.97 
 
 
907 aa  89.7  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0585  ATP-binding region ATPase domain protein  24.43 
 
 
528 aa  89.7  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.215545  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.51 
 
 
646 aa  89.4  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.59 
 
 
1137 aa  89.4  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.68 
 
 
1199 aa  89.4  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  27.82 
 
 
736 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.99 
 
 
657 aa  89  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3563  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 
1023 aa  89  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0431  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 
664 aa  89  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.747811  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0775  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 
449 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.82168  normal  0.228948 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0210  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 
708 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.4 
 
 
1127 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  27.24 
 
 
1137 aa  88.6  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.85 
 
 
1303 aa  88.6  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  25.41 
 
 
1193 aa  87.8  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.72 
 
 
627 aa  87.8  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  28.79 
 
 
1001 aa  88.2  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.98 
 
 
647 aa  87.8  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00025473 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4725  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.08 
 
 
614 aa  88.2  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269083  normal  0.0435637 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.15 
 
 
713 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  26.71 
 
 
1346 aa  87.4  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.07 
 
 
1237 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2504  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.29 
 
 
1132 aa  87.4  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0636  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 
535 aa  87.8  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318643  normal  0.125988 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2393  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.25 
 
 
676 aa  87  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00822967 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 
1711 aa  87.4  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4938  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.66 
 
 
686 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.269297 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.09 
 
 
1002 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.09 
 
 
1002 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.27 
 
 
901 aa  86.7  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.135172  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.98 
 
 
647 aa  86.7  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 
2654 aa  86.7  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  26.22 
 
 
1214 aa  85.9  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3706  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.92 
 
 
738 aa  86.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.6 
 
 
1301 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1905  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  26.84 
 
 
668 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0295515  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0654  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.12 
 
 
934 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.64 
 
 
816 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.29 
 
 
1078 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01510  two-component system sensor histidine kinase  26.92 
 
 
813 aa  85.9  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.683286  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.39 
 
 
1029 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11300  signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 
556 aa  85.1  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.57 
 
 
700 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.941332 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  28.63 
 
 
800 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0715  histidine kinase  26.67 
 
 
553 aa  85.1  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519915  normal  0.60104 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2127  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.8 
 
 
815 aa  85.5  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  26.13 
 
 
560 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1425  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.22 
 
 
1096 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.579353  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 
979 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1375  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 
490 aa  85.5  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.98 
 
 
767 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0318  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.01 
 
 
1223 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.438074 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4471  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 
627 aa  84.7  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.611462  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2940  PAS  27.11 
 
 
1353 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0980  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.25 
 
 
1171 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7014  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.46 
 
 
781 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  25.65 
 
 
352 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0974  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.22 
 
 
916 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4631  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.83 
 
 
1672 aa  84.3  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.659803  normal  0.0232391 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>