More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2114 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2114  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 405 aa  819    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5914  histidine kinase  86.91 
 
 		 405 aa  721    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2272  signal transduction histidine kinase  65.42 
 
 		 405 aa  535  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0838536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6039  histidine kinase  66.08 
 
 		 406 aa  537  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.56272 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4687  histidine kinase  63.59 
 
 		 409 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.336228  normal  0.0853852 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2606  signal transduction histidine kinase  71.04 
 
 		 458 aa  511  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0231945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4547  signal transduction histidine kinase  71.04 
 
 		 458 aa  511  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0873  histidine kinase  28.83 
 
 		 396 aa  149  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00136581  normal  0.0338555 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1167  Signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1230  histidine kinase  26.45 
 
 		 432 aa  123  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.109044 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1251  histidine kinase  33.83 
 
 		 477 aa  123  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0537245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2593  hybrid histidine kinase  33.83 
 
 		 477 aa  123  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1930  histidine kinase  35.55 
 
 		 476 aa  123  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.592963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0553  histidine kinase  28.03 
 
 		 395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  26.17 
 
 		 998 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5074  histidine kinase  27.08 
 
 		 432 aa  116  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.299774  normal  0.0561141 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.47 
 
 		 1261 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.47 
 
 		 1237 aa  114  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2352  histidine kinase  31.35 
 
 		 441 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 1044 aa  114  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.4 
 
 		 1964 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.370442 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6993  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.7 
 
 		 1159 aa  113  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.922616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.38 
 
 		 1155 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.21 
 
 		 1143 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2049  histidine kinase  31.82 
 
 		 494 aa  111  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2519  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  32.03 
 
 		 949 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000827535  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  31.17 
 
 		 1137 aa  110  6e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3632  histidine kinase  32.46 
 
 		 421 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.230628 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02145  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.6 
 
 		 933 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1440  histidine kinase  31.6 
 
 		 949 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00541515  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02104  hypothetical protein  31.6 
 
 		 933 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0720  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.6 
 
 		 949 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00107574  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1432  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.6 
 
 		 949 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0516926  hitchhiker  0.00218938 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2367  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.6 
 
 		 949 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000101959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2359  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.6 
 
 		 949 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000333746  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3358  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.6 
 
 		 949 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00504503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3274  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1911  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.27 
 
 		 787 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0413731  normal  0.503462 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 641 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5175  histidine kinase  28.89 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0185  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.5 
 
 		 1214 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467777  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.27 
 
 		 1356 aa  107  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0234  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 563 aa  107  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0975  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 383 aa  106  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  36.09 
 
 		 968 aa  106  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2001  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.33 
 
 		 1121 aa  106  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3666  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  31.97 
 
 		 1129 aa  106  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 970 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0102  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 763 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  28.42 
 
 		 1361 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3018  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  30.3 
 
 		 955 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0433784  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 681 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000333563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1994  histidine kinase  30.45 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.376445  hitchhiker  0.00440814 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3612  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  29.3 
 
 		 796 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463414  normal  0.719468 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3498  two component sensor kinase  34.11 
 
 		 1125 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2327  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.6 
 
 		 760 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762207 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5435  histidine kinase  24.34 
 
 		 455 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268395  normal  0.150207 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00572  putative signal transduction histidine kinase two-component system with Protein-glutamate methylesterase domain  32.43 
 
 		 919 aa  104  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.36 
 
 		 1361 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0637  histidine kinase  30.04 
 
 		 813 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2497  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  30.26 
 
 		 948 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147984  normal  0.803827 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5222  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 		 601 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.95 
 
 		 1431 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3362  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 		 575 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.516975 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 		 587 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2091  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 563 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 		 1153 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  28.46 
 
 		 1133 aa  104  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4177  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 490 aa  104  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 		 574 aa  104  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1181  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.74 
 
 		 601 aa  104  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2135  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 576 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0988  histidine kinase  31.01 
 
 		 486 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.638134  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0551  PAS  34.7 
 
 		 1026 aa  103  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.425664 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0931  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 		 446 aa  103  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.523505  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2911  Signal transduction histidine kinase-like  31.05 
 
 		 614 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.522468 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  27.64 
 
 		 1200 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3723  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.99 
 
 		 903 aa  103  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.803649  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2407  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  30.26 
 
 		 948 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000239257  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 		 1177 aa  103  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 817 aa  104  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2615  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  30.26 
 
 		 915 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.544475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5603  histidine kinase  25.45 
 
 		 401 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.833057 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.96 
 
 		 1137 aa  103  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0653  sensor histidine kinase  36.52 
 
 		 1124 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.450749  normal  0.469118 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3284  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 856 aa  103  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0250894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.25 
 
 		 1145 aa  103  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3706  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 		 738 aa  103  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15460  membrane sensor hybrid histidine protein kinase  28.41 
 
 		 772 aa  103  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.361903  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3065  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.3 
 
 		 1128 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0191  sensor protein EvgS  33.07 
 
 		 830 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.337786  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27550  putative sensor/response regulator hybrid  30.26 
 
 		 786 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922112 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1782  sensor histidine kinase/response regulator  28.98 
 
 		 783 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5416  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 		 632 aa  103  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.4 
 
 		 1362 aa  103  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1943  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.14 
 
 		 1468 aa  103  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.01 
 
 		 1965 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 		 1155 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2536  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 829 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>