More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4687 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4687  histidine kinase  100 
 
 		 409 aa  836    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.336228  normal  0.0853852 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6039  histidine kinase  71.82 
 
 		 406 aa  596  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.56272 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2272  signal transduction histidine kinase  71.07 
 
 		 405 aa  597  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0838536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5914  histidine kinase  62.59 
 
 		 405 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2114  signal transduction histidine kinase  63.59 
 
 		 405 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2606  signal transduction histidine kinase  63.66 
 
 		 458 aa  471  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0231945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4547  signal transduction histidine kinase  63.66 
 
 		 458 aa  471  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0873  histidine kinase  24.69 
 
 		 396 aa  139  8.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00136581  normal  0.0338555 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0553  histidine kinase  28.64 
 
 		 395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1167  Signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 		 415 aa  129  6e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2593  hybrid histidine kinase  33.46 
 
 		 477 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5435  histidine kinase  26.67 
 
 		 455 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268395  normal  0.150207 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1251  histidine kinase  33.46 
 
 		 477 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0537245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2352  histidine kinase  33.46 
 
 		 441 aa  119  9e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1930  histidine kinase  33.33 
 
 		 476 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.592963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 		 680 aa  117  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1230  histidine kinase  23.69 
 
 		 432 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.109044 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5074  histidine kinase  27.37 
 
 		 432 aa  116  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.299774  normal  0.0561141 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 		 1237 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.16 
 
 		 1356 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.74 
 
 		 917 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  32.51 
 
 		 1152 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.73 
 
 		 1143 aa  108  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  31.79 
 
 		 970 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 683 aa  106  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5220  histidine kinase  27.09 
 
 		 438 aa  106  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.81 
 
 		 1203 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2879  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 466 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.295143  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0319  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.02 
 
 		 636 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.49 
 
 		 936 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0749319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3237  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.8 
 
 		 854 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.967707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1854  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.8 
 
 		 579 aa  105  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.46631 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3781  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 592 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233259  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 		 760 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762207 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 592 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130733  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0961  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 		 1154 aa  103  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.544458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2062  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 951 aa  103  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.275424  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4472  PAS  31.44 
 
 		 679 aa  103  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.185936  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1994  histidine kinase  30.69 
 
 		 387 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.376445  hitchhiker  0.00440814 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3724  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 		 592 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2049  histidine kinase  30.65 
 
 		 494 aa  103  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3362  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 575 aa  102  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.516975 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2759  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 785 aa  102  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01510  two-component system sensor histidine kinase  32.64 
 
 		 813 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.683286  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.18 
 
 		 745 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 568 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 		 821 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0666  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 579 aa  102  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.74861  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4177  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 490 aa  101  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.99 
 
 		 1691 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 786 aa  100  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0102  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 763 aa  100  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0080  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 		 779 aa  100  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4255  PAS/PAC sensor, hybrid histidine kinase  31.51 
 
 		 1418 aa  100  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  28.82 
 
 		 823 aa  100  7e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  26.86 
 
 		 641 aa  99.8  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5222  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 		 601 aa  99.8  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  33.71 
 
 		 968 aa  99.4  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 631 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  28.51 
 
 		 1361 aa  99  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3498  two component sensor kinase  31.9 
 
 		 1125 aa  99  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0413  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 		 649 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2911  Signal transduction histidine kinase-like  27.91 
 
 		 614 aa  99.4  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.522468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2513  ATP-binding region, ATPase-like  29.68 
 
 		 945 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.543755  normal  0.160676 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1505  secretion system regulator:Sensor component  29.57 
 
 		 920 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000630125 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1949  secretion system regulator:Sensor component  29.57 
 
 		 920 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.14133  normal  0.0293966 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2001  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.95 
 
 		 1121 aa  99  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1527  secretion system regulator:Sensor component  29.57 
 
 		 920 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0140135 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  25.32 
 
 		 998 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  31.88 
 
 		 918 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.8 
 
 		 871 aa  99.4  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.363033  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.74 
 
 		 1141 aa  98.6  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03481  Multi-sensor Signal Transduction Histidine Kinase  29.39 
 
 		 908 aa  98.2  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0652805  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 361 aa  98.6  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.121387  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3042  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.21 
 
 		 1181 aa  98.6  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.227036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3706  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 		 738 aa  98.6  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 674 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0970  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 		 729 aa  97.8  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.16 
 
 		 796 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  30.35 
 
 		 1175 aa  97.4  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 436 aa  97.8  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.257658  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  29.49 
 
 		 1427 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  30.93 
 
 		 497 aa  97.8  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1746  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 		 903 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 		 883 aa  97.4  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3416  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 878 aa  97.4  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.58 
 
 		 574 aa  97.4  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 817 aa  97.4  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  27.53 
 
 		 1137 aa  97.1  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1779  secretion system regulator:Sensor component  29.18 
 
 		 920 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.255044  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 1046 aa  97.1  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1490  secretion system regulator:Sensor component  29.18 
 
 		 920 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.490223 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5603  histidine kinase  22.81 
 
 		 401 aa  97.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.833057 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0144  sensor protein evgS precursor  31.98 
 
 		 830 aa  97.1  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3150  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 408 aa  97.1  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3954  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 792 aa  97.1  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15460  membrane sensor hybrid histidine protein kinase  27.74 
 
 		 772 aa  97.1  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.361903  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1725  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 		 407 aa  96.7  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0129  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.63 
 
 		 752 aa  96.7  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0830  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 394 aa  97.1  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00410023  normal  0.375315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>