More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0553 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0553  histidine kinase  100 
 
 		 395 aa  794    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4687  histidine kinase  28.64 
 
 		 409 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.336228  normal  0.0853852 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2114  signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5914  histidine kinase  26.28 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4301  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 579 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0832  histidine kinase  26.81 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.636786  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2312  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 549 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367472  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3611  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 577 aa  113  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6039  histidine kinase  27.83 
 
 		 406 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.56272 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0579  histidine kinase  27.14 
 
 		 375 aa  112  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2272  signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 		 405 aa  112  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0838536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 680 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0961  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 		 1154 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.544458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4177  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 490 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 557 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.125124  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0873  histidine kinase  23.29 
 
 		 396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00136581  normal  0.0338555 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 568 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2393  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 676 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2593  hybrid histidine kinase  35.08 
 
 		 477 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1251  histidine kinase  34.51 
 
 		 477 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0537245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  29.02 
 
 		 1200 aa  109  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0194  ATPase domain-containing protein  33.88 
 
 		 549 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.357239  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3328  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 		 1482 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1949  secretion system regulator:Sensor component  33.19 
 
 		 920 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.14133  normal  0.0293966 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1527  secretion system regulator:Sensor component  33.19 
 
 		 920 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0140135 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1779  secretion system regulator:Sensor component  33.19 
 
 		 920 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.255044  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  34.03 
 
 		 1361 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1490  secretion system regulator:Sensor component  33.19 
 
 		 920 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.490223 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  31.47 
 
 		 560 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1930  histidine kinase  35.06 
 
 		 476 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.592963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 581 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335096  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1505  secretion system regulator:Sensor component  33.19 
 
 		 920 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000630125 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4049  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.95 
 
 		 1406 aa  107  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0931  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 446 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.523505  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 		 733 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 		 917 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  31.35 
 
 		 910 aa  107  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2142  histidine kinase  31.49 
 
 		 502 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.000590991  normal  0.0793761 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1070 aa  107  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1722  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 763 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.418059 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1111  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 		 463 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 		 1152 aa  106  9e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 979 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 730 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0447  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.23 
 
 		 662 aa  105  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 		 1362 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2880  signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 733 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0666  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.05 
 
 		 1400 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.982341 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2513  histidine kinase  31.8 
 
 		 586 aa  104  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 2783 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5118  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 		 837 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1526  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.19 
 
 		 733 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0396333  normal  0.047905 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  28.85 
 
 		 565 aa  104  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2074  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 		 489 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.104517  normal  0.105314 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3854  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 386 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1885  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 792 aa  104  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  29.39 
 
 		 742 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1787  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 		 522 aa  103  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1391  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.07 
 
 		 526 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444347  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0806  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 		 587 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1730  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.1 
 
 		 1195 aa  103  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.479441  normal  0.752594 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 880 aa  103  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 383 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.143908  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6993  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.26 
 
 		 1159 aa  103  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.922616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.63 
 
 		 1322 aa  103  8e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6439  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.07 
 
 		 776 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.36 
 
 		 1137 aa  103  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 763 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 		 587 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.773486  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.72 
 
 		 833 aa  102  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1190  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 746 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0535  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 383 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.175177  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0511  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 		 490 aa  102  9e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000039961  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 549 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.303527  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1788  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 763 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.49 
 
 		 529 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  29.72 
 
 		 970 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4523  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.94 
 
 		 1179 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522992  decreased coverage  0.00180703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0210  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 		 708 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2802  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  30.93 
 
 		 771 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0334  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 492 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.091816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0083  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.73 
 
 		 874 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.146368  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4428  PAS sensor protein  29.41 
 
 		 693 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.426756 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.04 
 
 		 700 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.941332 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1446  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  33.99 
 
 		 1131 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.705679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.22 
 
 		 1058 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1239  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 601 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 		 1965 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1130  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 748 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10590  sensory histidine protein kinase  34.05 
 
 		 488 aa  102  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4376  histidine kinase  32.48 
 
 		 593 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904194  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 456 aa  102  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1671  histidine kinase  33.33 
 
 		 755 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.05 
 
 		 1143 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  33.86 
 
 		 1137 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1171  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 601 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.764922  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1933  ATPase domain-containing protein  32.91 
 
 		 535 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493372  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3416  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 		 878 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>