106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0171 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0171  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 305 aa  614  1e-175  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00584415 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13411  hypothetical protein  33.76 
 
 		 326 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3988  oxidoreductase domain protein  20.49 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0345  oxidoreductase, NAD-binding  28.89 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0414  oxidoreductase domain-containing protein  28.89 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4060  oxidoreductase domain protein  20.61 
 
 		 334 aa  58.9  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  25.32 
 
 		 368 aa  57  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  21.98 
 
 		 350 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  22.61 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  23.94 
 
 		 350 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  23.94 
 
 		 350 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0790  putative oxidoreductase  28.8 
 
 		 365 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08431  putative oxidoreductase  28.65 
 
 		 365 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  28.06 
 
 		 358 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  21.82 
 
 		 350 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0530  oxidoreductase-like protein  20.51 
 
 		 368 aa  53.1  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0597685  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08461  putative oxidoreductase  28.8 
 
 		 365 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.336432  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  22.09 
 
 		 715 aa  52  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0762  oxidoreductase domain protein  23.03 
 
 		 378 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  24.53 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  25.55 
 
 		 310 aa  51.6  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  22.89 
 
 		 379 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  23 
 
 		 361 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0025  oxidoreductase domain-containing protein  19.4 
 
 		 333 aa  50.8  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0370  oxidoreductase domain protein  25.14 
 
 		 416 aa  50.8  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  24.18 
 
 		 352 aa  50.8  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  27.4 
 
 		 328 aa  50.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 342 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11260  oxidoreductase domain protein  23.4 
 
 		 349 aa  49.7  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.305619  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  18.12 
 
 		 326 aa  50.1  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0541  oxidoreductase domain protein  23.87 
 
 		 354 aa  49.7  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07991  putative oxidoreductase  27.46 
 
 		 367 aa  48.9  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.716989  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  25.18 
 
 		 340 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0387  inositol 2-dehydrogenase  24.36 
 
 		 343 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  22.15 
 
 		 334 aa  48.5  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0653  oxidoreductase domain-containing protein  23.53 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  21.84 
 
 		 329 aa  48.5  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2269  oxidoreductase domain protein  20.11 
 
 		 354 aa  48.5  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  21.34 
 
 		 330 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  22.58 
 
 		 342 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4020  inositol 2-dehydrogenase  24.66 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141873  normal  0.256136 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0356  oxidoreductase domain-containing protein  21.72 
 
 		 341 aa  47.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4070  oxidoreductase domain protein  23.84 
 
 		 734 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  20 
 
 		 336 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  22.36 
 
 		 327 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  21.39 
 
 		 367 aa  47  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  23 
 
 		 361 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  23.02 
 
 		 338 aa  47  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5485  oxidoreductase domain protein  24.8 
 
 		 358 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.863826  normal  0.176545 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5222  oxidoreductase domain protein  24 
 
 		 358 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.465619 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  26.15 
 
 		 384 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0747  oxidoreductase domain-containing protein  25.35 
 
 		 358 aa  46.2  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2013  dehydrogenase related protein  28.1 
 
 		 305 aa  46.2  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.465954  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0834  inositol 2-dehydrogenase  22.92 
 
 		 344 aa  46.2  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0396008  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3347  oxidoreductase-like  23.19 
 
 		 367 aa  45.8  0.0009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0144127  normal  0.198218 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  25.15 
 
 		 345 aa  45.8  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2084  virulence factor MviM, putative  25.64 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23420  putative zinc-binding dehydrogenase  24.39 
 
 		 722 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123826  hitchhiker  0.00977209 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3433  oxidoreductase domain-containing protein  23.86 
 
 		 363 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.808299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1061  oxidoreductase domain-containing protein  20.75 
 
 		 351 aa  45.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2877  oxidoreductase domain-containing protein  18.03 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.041895 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4486  Inositol 2-dehydrogenase  22.17 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.910822 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1139  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 317 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3594  oxidoreductase domain protein  20.59 
 
 		 347 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8496  Inositol 2-dehydrogenase  21.55 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  24.48 
 
 		 357 aa  44.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3819  oxidoreductase-like  17.19 
 
 		 341 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  20.85 
 
 		 350 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  23.64 
 
 		 347 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  22.58 
 
 		 328 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0947  oxidoreductase domain-containing protein  29.49 
 
 		 310 aa  45.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2322  oxidoreductase domain-containing protein  22.99 
 
 		 320 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0136  oxidoreductase domain-containing protein  29.37 
 
 		 348 aa  44.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000686096 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  24.41 
 
 		 377 aa  44.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2206  oxidoreductase domain protein  17.78 
 
 		 316 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.024069  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3701  oxidoreductase domain protein  18.54 
 
 		 335 aa  43.9  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  21.35 
 
 		 355 aa  43.9  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1532  oxidoreductase domain-containing protein  15.71 
 
 		 312 aa  43.9  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1379  oxidoreductase-like protein  21.97 
 
 		 362 aa  43.5  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  21.02 
 
 		 311 aa  43.5  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  21.94 
 
 		 328 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  22.7 
 
 		 336 aa  43.5  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.42 
 
 		 350 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  19.39 
 
 		 377 aa  43.5  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3652  oxidoreductase  22.07 
 
 		 337 aa  43.5  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0193  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  22.88 
 
 		 311 aa  43.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1495  oxidoreductase domain-containing protein  20.13 
 
 		 344 aa  43.5  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0319265  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  22.22 
 
 		 385 aa  43.5  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1246  putative oxidoreductase myo-inositol 2-dehydrogenase signal peptide protein  19.32 
 
 		 337 aa  43.1  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.405196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  20.19 
 
 		 386 aa  43.1  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  21.69 
 
 		 1080 aa  43.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3482  oxidoreductase domain protein  20.73 
 
 		 330 aa  43.1  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  25.41 
 
 		 338 aa  43.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3353  Inositol 2-dehydrogenase  20.79 
 
 		 333 aa  43.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110738  normal  0.0600563 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  26.79 
 
 		 323 aa  42.7  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  26.79 
 
 		 324 aa  42.7  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  27 
 
 		 331 aa  42.7  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1537  oxidoreductase domain protein  22.3 
 
 		 356 aa  42.7  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2700  oxidoreductase domain protein  24.44 
 
 		 362 aa  42.7  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.832188  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  21.76 
 
 		 324 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>