24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_13411 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_13411  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  664    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0171  oxidoreductase domain-containing protein  33.76 
 
 		 305 aa  169  5e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00584415 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3988  oxidoreductase domain protein  20.59 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0025  oxidoreductase domain-containing protein  21.79 
 
 		 333 aa  52.8  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  29.09 
 
 		 358 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0370  oxidoreductase domain protein  23.35 
 
 		 416 aa  49.7  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1532  oxidoreductase domain-containing protein  20.94 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  19.63 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  20.93 
 
 		 341 aa  47.8  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  22.1 
 
 		 336 aa  46.6  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  22.37 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  25.17 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3940  oxidoreductase domain protein  30.63 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0963887 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  20.86 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2877  oxidoreductase domain-containing protein  17.76 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.041895 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  21.47 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  25.76 
 
 		 352 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  22.45 
 
 		 330 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4070  oxidoreductase domain protein  19.02 
 
 		 734 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  25.48 
 
 		 331 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4486  Inositol 2-dehydrogenase  22.83 
 
 		 338 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.910822 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  20.68 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0586  radical SAM domain-containing protein  30.61 
 
 		 318 aa  43.1  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3794  zinc-binding alcohol dehydrogenase  23.68 
 
 		 719 aa  42.4  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>