54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3988 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3988  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 307 aa  620  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0025  oxidoreductase domain-containing protein  28.09 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0171  oxidoreductase domain-containing protein  20.49 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00584415 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13411  hypothetical protein  20.59 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  29.49 
 
 		 350 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  29.95 
 
 		 350 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  28.46 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  25.88 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  25.29 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  28.44 
 
 		 324 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1334  oxidoreductase  23.39 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  25.94 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  26.98 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  25.97 
 
 		 352 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  29.15 
 
 		 347 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  22.82 
 
 		 337 aa  53.9  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  28.36 
 
 		 368 aa  53.5  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4060  oxidoreductase domain protein  33.87 
 
 		 334 aa  52.8  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  24.77 
 
 		 325 aa  52.8  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1532  oxidoreductase domain-containing protein  26.24 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0335  oxidoreductase domain protein  29.96 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485901  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2941  oxidoreductase domain-containing protein  29.75 
 
 		 324 aa  50.4  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 		 367 aa  50.1  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3470  oxidoreductase domain protein  26.89 
 
 		 328 aa  50.1  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  24.12 
 
 		 324 aa  49.7  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  27.73 
 
 		 327 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  28.03 
 
 		 329 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  23.77 
 
 		 356 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  26.29 
 
 		 355 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4196  oxidoreductase domain protein  43.33 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78306  oxidoreductase  25.75 
 
 		 390 aa  47.4  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.240941 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  19.74 
 
 		 350 aa  47  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  26.15 
 
 		 344 aa  47  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  21.91 
 
 		 340 aa  47  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  22.83 
 
 		 356 aa  46.6  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0199  oxidoreductase domain protein  24.31 
 
 		 326 aa  46.6  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000155644  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  31 
 
 		 322 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  25.12 
 
 		 345 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2877  oxidoreductase domain-containing protein  25.85 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.041895 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  26.05 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3919  oxidoreductase domain-containing protein  26.99 
 
 		 324 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0709512  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5485  oxidoreductase domain protein  24.4 
 
 		 358 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.863826  normal  0.176545 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  27.75 
 
 		 355 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  24.41 
 
 		 349 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.22 
 
 		 428 aa  44.3  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.22 
 
 		 329 aa  43.9  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  30.49 
 
 		 386 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  28.75 
 
 		 359 aa  43.9  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  22.65 
 
 		 339 aa  43.5  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  27.16 
 
 		 345 aa  43.9  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25 
 
 		 349 aa  43.5  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25422  predicted protein  28.04 
 
 		 374 aa  43.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  24.58 
 
 		 344 aa  42.7  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.74 
 
 		 349 aa  42.7  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>