14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0025 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0025  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
333 aa  679    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3988  oxidoreductase domain protein  28.09 
 
 
307 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  27.18 
 
 
350 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  27.59 
 
 
350 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  25.62 
 
 
350 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  25.62 
 
 
350 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13411  hypothetical protein  21.79 
 
 
326 aa  52.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0171  oxidoreductase domain-containing protein  19.4 
 
 
305 aa  50.8  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00584415 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  26.6 
 
 
352 aa  50.4  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.57 
 
 
377 aa  48.1  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  30.61 
 
 
347 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0356  oxidoreductase domain-containing protein  25.73 
 
 
341 aa  44.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  29.45 
 
 
670 aa  44.3  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3701  oxidoreductase domain protein  26.19 
 
 
335 aa  43.1  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>