215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3940 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3940  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 316 aa  644    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0963887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3733  oxidoreductase domain protein  24.42 
 
 		 343 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  24.49 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  23.83 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  24.3 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  25.09 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.33 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  30.21 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  26.76 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3409  oxidoreductase domain protein  23.56 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.137332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.33 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  27.16 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1636  oxidoreductase domain-containing protein  23.14 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  25.26 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4486  Inositol 2-dehydrogenase  22.96 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.910822 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  24.2 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  23.16 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  22.03 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0095  dehydrogenase and related proteins-like  26.03 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0526429  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  22.56 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  22.73 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  22.03 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  22.28 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  29.52 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  23.69 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2255  oxidoreductase domain-containing protein  23.14 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00678448 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  22.9 
 
 		 330 aa  57  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.21 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  25.34 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  26.85 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  23.68 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  22.64 
 
 		 359 aa  55.8  0.0000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  24.79 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.79 
 
 		 341 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  24.79 
 
 		 341 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  23.92 
 
 		 337 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  24.79 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  22.28 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  25.85 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  27.33 
 
 		 334 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  34.04 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4401  oxidoreductase domain protein  22.99 
 
 		 355 aa  54.3  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.276088  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  24.64 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  28 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  23.32 
 
 		 336 aa  54.3  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1070  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  32.5 
 
 		 286 aa  53.5  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  22.11 
 
 		 332 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  34.78 
 
 		 329 aa  53.1  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  26.67 
 
 		 335 aa  53.1  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3594  oxidoreductase domain protein  27.74 
 
 		 347 aa  53.1  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  31.25 
 
 		 362 aa  52.8  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  22.73 
 
 		 387 aa  52.8  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  24.05 
 
 		 327 aa  52.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  23.59 
 
 		 331 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3835  inositol 2-dehydrogenase  25.48 
 
 		 334 aa  52  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1905  oxidoreductase domain protein  23.64 
 
 		 347 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1659  oxidoreductase domain protein  21.55 
 
 		 351 aa  51.6  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  22.05 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  27.55 
 
 		 390 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  27.16 
 
 		 393 aa  50.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  24.49 
 
 		 363 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3353  Inositol 2-dehydrogenase  21.13 
 
 		 333 aa  50.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110738  normal  0.0600563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  21.05 
 
 		 342 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  27.21 
 
 		 344 aa  50.4  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  23.71 
 
 		 330 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  21.5 
 
 		 357 aa  50.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  25.33 
 
 		 334 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  24.28 
 
 		 340 aa  50.4  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1623  hypothetical protein  32 
 
 		 316 aa  50.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2344  oxidoreductase domain-containing protein  22.12 
 
 		 324 aa  50.1  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  20.74 
 
 		 331 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  25.77 
 
 		 311 aa  50.1  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  31.33 
 
 		 320 aa  50.1  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1618  hypothetical protein  32 
 
 		 316 aa  49.7  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0834  inositol 2-dehydrogenase  20.74 
 
 		 344 aa  49.7  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0396008  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2747  Inositol 2-dehydrogenase  22.82 
 
 		 362 aa  49.7  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.505904  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  23.56 
 
 		 327 aa  49.3  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1214  oxidoreductase domain protein  27.94 
 
 		 344 aa  49.3  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  22.34 
 
 		 326 aa  49.3  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  24.29 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1531  oxidoreductase domain protein  26.8 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  26 
 
 		 334 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  25.74 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  25.83 
 
 		 389 aa  48.9  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  25.5 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  24 
 
 		 335 aa  47.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  21.77 
 
 		 355 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  19.9 
 
 		 332 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  24.34 
 
 		 331 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  27.13 
 
 		 364 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  21.9 
 
 		 335 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  21.07 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  24.63 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3046  inositol 2-dehydrogenase  24.78 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  26.85 
 
 		 321 aa  47.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8496  Inositol 2-dehydrogenase  24.8 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  25.35 
 
 		 357 aa  47.8  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1685  alcohol dehydrogenase  26.92 
 
 		 724 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  26.17 
 
 		 360 aa  47.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0247  oxidoreductase domain-containing protein  27.1 
 
 		 318 aa  47.8  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>