116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5485 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5485  polysaccharide export protein  100 
 
 		 384 aa  762    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05380  Polysaccharide export protein  27.24 
 
 		 334 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.273333  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2021  polysaccharide export protein  28.87 
 
 		 341 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3192  polysaccharide export protein  34.64 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1069  polysaccharide export protein  33.99 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16271  hypothetical protein  23.22 
 
 		 577 aa  66.6  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  28.1 
 
 		 184 aa  65.1  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1528  polysaccharide export protein  28.07 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1691  polysaccharide export protein  30.73 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000171908  normal  0.0125517 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0979  polysaccharide export protein  29.03 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3007  exopolysaccharide transporter  30.54 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  36.63 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  26.75 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  26.75 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  31.31 
 
 		 869 aa  57.8  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  26.75 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2881  polysaccharide export protein  39.73 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0827  polysaccharide export protein  27.05 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.895511  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  29.57 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  36.59 
 
 		 270 aa  57  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  30 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  35.53 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3189  polysaccharide export protein  24.26 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.32554  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4285  polysaccharide export protein  30.54 
 
 		 255 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0419531 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  31.73 
 
 		 202 aa  54.3  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0879  polysaccharide export outer membrane protein  28.47 
 
 		 250 aa  53.5  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  32.63 
 
 		 193 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  31.18 
 
 		 897 aa  53.1  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  34.25 
 
 		 212 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  21.13 
 
 		 282 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  24.07 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2182  polysaccharide export protein  30.81 
 
 		 298 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  32.58 
 
 		 210 aa  50.8  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  37.84 
 
 		 213 aa  50.8  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.08 
 
 		 396 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.08 
 
 		 396 aa  50.1  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  30.08 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  30.08 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1020  EPS I polysaccharide export outer membrane transmembrane protein  25.89 
 
 		 381 aa  49.7  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  32.33 
 
 		 207 aa  49.7  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  25.19 
 
 		 920 aa  49.7  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3242  polysaccharide export protein  28 
 
 		 212 aa  49.7  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3071  polysaccharide export protein  39.71 
 
 		 268 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  26.85 
 
 		 551 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2920  polysaccharide export protein  32.99 
 
 		 185 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.157284 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  23.98 
 
 		 779 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  33.67 
 
 		 407 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2909  polysaccharide export protein  26.7 
 
 		 446 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723004  hitchhiker  0.000339784 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  26.26 
 
 		 919 aa  47.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  22.7 
 
 		 387 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  31.54 
 
 		 397 aa  47.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  25.65 
 
 		 264 aa  47.8  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  26.55 
 
 		 919 aa  47.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  23.13 
 
 		 922 aa  47.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  21.68 
 
 		 379 aa  47.4  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  24.79 
 
 		 869 aa  47.4  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  32.65 
 
 		 407 aa  47  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  30.15 
 
 		 940 aa  47.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  28.89 
 
 		 869 aa  47  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2336  polysaccharide export protein  32.88 
 
 		 215 aa  47  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.125477  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5118  polysaccharide export protein  33 
 
 		 348 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  normal  0.024948 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  25.66 
 
 		 931 aa  47  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  30.61 
 
 		 393 aa  47  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2478  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  33.8 
 
 		 268 aa  47  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5851  EPS I polysaccharide export outer membrane protein  22.25 
 
 		 362 aa  46.6  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  23.13 
 
 		 270 aa  46.6  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  25.66 
 
 		 910 aa  46.6  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  25.76 
 
 		 347 aa  46.2  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  27.59 
 
 		 201 aa  46.6  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  30.53 
 
 		 185 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2222  polysaccharide export protein  38.24 
 
 		 281 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.456122  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  27.86 
 
 		 205 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2882  polysaccharide export protein  29.41 
 
 		 247 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000309988  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0689  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  33.82 
 
 		 268 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  25 
 
 		 912 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4031  polysaccharide export protein  32.14 
 
 		 216 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123149  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  30.53 
 
 		 185 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2730  polysaccharide export protein  30.53 
 
 		 185 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3890  polysaccharide export system outer membrane protein  26.76 
 
 		 264 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  29.33 
 
 		 208 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  21.6 
 
 		 362 aa  45.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1928  polysaccharide export protein  32 
 
 		 218 aa  45.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  29.47 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  31.51 
 
 		 208 aa  45.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  29.23 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  29.47 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  27.91 
 
 		 852 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2963  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 213 aa  45.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  23.53 
 
 		 915 aa  45.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  29.23 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  25.1 
 
 		 936 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0660  polysaccharide export protein  29.07 
 
 		 823 aa  44.7  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  22.94 
 
 		 214 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3531  lipoprotein PslD  25.3 
 
 		 258 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.717769  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  23.05 
 
 		 333 aa  43.9  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  29.23 
 
 		 392 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  28 
 
 		 384 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  25 
 
 		 508 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  28.36 
 
 		 834 aa  43.9  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  37.74 
 
 		 191 aa  43.9  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>