222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3890 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3890  polysaccharide export system outer membrane protein  100 
 
 		 264 aa  530  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2882  polysaccharide export protein  30.56 
 
 		 247 aa  102  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000309988  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4765  polysaccharide export periplasmic protein  28.19 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00350662  normal  0.271358 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0879  polysaccharide export outer membrane protein  27.16 
 
 		 250 aa  92.4  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2358  polysaccharide export periplasmic protein  29.83 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2665  Soluble ligand binding domain protein  32.05 
 
 		 275 aa  90.1  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.436748  normal  0.303362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6397  Soluble ligand binding domain protein  26.58 
 
 		 265 aa  89.7  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6308  Soluble ligand binding domain protein  33.77 
 
 		 276 aa  88.2  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2077  polysaccharide export protein  32.3 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00598024  normal  0.432742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4354  Soluble ligand binding domain protein  25.81 
 
 		 266 aa  85.5  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.76847 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10728  polysaccharide export outer membrane protein  25.28 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4088  polysaccharide export protein  26.32 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.142355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0066  polysaccharide export protein  27.6 
 
 		 275 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.200434 
 
 
-
 
NC_002950  PG0437  BexD/CtrA/VexA family polysaccharide export protein  25.63 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0250029 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2287  polysaccharide export protein  27.62 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0727  polysaccharide export protein  24.89 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.567222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0361  polysaccharide export protein  26.62 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  36.54 
 
 		 495 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  30.22 
 
 		 473 aa  65.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2864  polysaccharide export protein  26.86 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  25.57 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0845  polysaccharide export protein  24.31 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.700264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  36.43 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07225  polysaccharide export protein, BexD/CtrA/VexA family protein  26.57 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1069  polysaccharide export protein  26.49 
 
 		 227 aa  62  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  26.32 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3189  polysaccharide export protein  26.4 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.32554  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0047  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.85 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2893  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.85 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2192  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.85 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2515  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.85 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0823  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.85 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  25.15 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0648  polysaccharide export periplasmic protein  26.61 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0639138  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3844  polysaccharide export periplasmic protein  21.37 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0647  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  29.85 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377734  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0661  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  29.85 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.520209  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  31.4 
 
 		 551 aa  59.7  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3242  polysaccharide export protein  38.3 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0536  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.1 
 
 		 429 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3192  polysaccharide export protein  25.25 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3133  polysaccharide export protein  27.57 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  29.02 
 
 		 243 aa  57  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  26.06 
 
 		 189 aa  57  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  26.14 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2182  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 298 aa  57  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1925  polysaccharide export protein  26.2 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  24.88 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  28.79 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  31.61 
 
 		 358 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  24.38 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  24.38 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  24.38 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  25 
 
 		 397 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  24.65 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  25.93 
 
 		 393 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  36.11 
 
 		 495 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  36.11 
 
 		 495 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  28.68 
 
 		 391 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3278  polysaccharide export protein  25.84 
 
 		 390 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.828407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  25.71 
 
 		 393 aa  55.8  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.67 
 
 		 446 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1463  putative polysaccharide export protein  31.82 
 
 		 352 aa  55.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.24713e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  30.56 
 
 		 356 aa  55.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  23.75 
 
 		 392 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3494  polysaccharide export protein  26.22 
 
 		 387 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.67 
 
 		 400 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  35.71 
 
 		 333 aa  53.9  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  26.11 
 
 		 379 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  24.39 
 
 		 396 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  23.75 
 
 		 392 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1690  polysaccharide export protein  29.28 
 
 		 428 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.977677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3196  polysaccharide export protein  25.96 
 
 		 391 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.622788  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.67 
 
 		 422 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  27.27 
 
 		 347 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  24.6 
 
 		 191 aa  53.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  26.42 
 
 		 431 aa  53.9  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  24.73 
 
 		 352 aa  53.9  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  25.42 
 
 		 385 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  27.21 
 
 		 391 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  24.39 
 
 		 391 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  24.39 
 
 		 391 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  24.74 
 
 		 407 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  24.39 
 
 		 396 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6745  polysaccharide export protein  26.82 
 
 		 369 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2254  putative polysaccharide export protein  28.89 
 
 		 385 aa  53.1  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.732758 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4112  polysaccharide export protein  32.41 
 
 		 378 aa  52  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2714  polysaccharide export protein  27.88 
 
 		 393 aa  51.6  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  34.25 
 
 		 833 aa  51.6  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  31 
 
 		 193 aa  51.6  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  23.71 
 
 		 407 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5851  EPS I polysaccharide export outer membrane protein  23.78 
 
 		 362 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13851  hypothetical protein  30.41 
 
 		 365 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5370  polysaccharide export protein  25.14 
 
 		 391 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4086  polysaccharide export protein  24.44 
 
 		 360 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.194923  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5118  polysaccharide export protein  23.45 
 
 		 348 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  normal  0.024948 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  35.64 
 
 		 214 aa  50.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3692  polysaccharide export protein  24.55 
 
 		 348 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  32 
 
 		 191 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2210  polysaccharide export outer membrane protein  28.23 
 
 		 357 aa  49.7  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>