More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2229 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2229  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  715    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2795  hypothetical protein  69.46 
 
 		 341 aa  494  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.687935  normal  0.0471733 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4493  hypothetical protein  70.26 
 
 		 341 aa  463  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3428  hypothetical protein  65.45 
 
 		 337 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.10884 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1853  hypothetical protein  65.12 
 
 		 337 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2026  hypothetical protein  65.81 
 
 		 337 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0845932  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0482  hypothetical protein  66.67 
 
 		 337 aa  448  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5629  periplasmic tricarboxylate binding receptor (TctC)  52.78 
 
 		 333 aa  363  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3051  hypothetical protein  51.62 
 
 		 345 aa  350  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244764  normal  0.28827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5726  hypothetical protein  48.02 
 
 		 328 aa  330  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00555624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3081  hypothetical protein  41.23 
 
 		 337 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165969  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36130  hypothetical protein  39.83 
 
 		 365 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000443052 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4224  hypothetical protein  41.61 
 
 		 328 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3098  hypothetical protein  40.13 
 
 		 329 aa  255  6e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49783  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1220  hypothetical protein  41.06 
 
 		 328 aa  229  6e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.216947  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  34.11 
 
 		 336 aa  166  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2078  hypothetical protein  31.9 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000784829  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0241  twin-arginine translocation pathway signal  30.56 
 
 		 332 aa  142  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.862974  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  30.97 
 
 		 330 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  33.76 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  28.8 
 
 		 346 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0872  hypothetical protein  29.94 
 
 		 322 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0855  hypothetical protein  29.94 
 
 		 322 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.769055  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0861  hypothetical protein  29.62 
 
 		 322 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  27.85 
 
 		 326 aa  120  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  31.56 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  28.23 
 
 		 324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  28.23 
 
 		 324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  28.23 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  31.21 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3931  hypothetical protein  28.71 
 
 		 320 aa  116  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1457  hypothetical protein  29.08 
 
 		 325 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3490  hypothetical protein  30.9 
 
 		 314 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  29.43 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  29.37 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1353  hypothetical protein  28.71 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0759073  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0998  hypothetical protein  29.25 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  29.79 
 
 		 322 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0734  hypothetical protein  26.67 
 
 		 322 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0775704  decreased coverage  0.00137039 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2824  hypothetical protein  28.34 
 
 		 321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0750754 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4766  hypothetical protein  27.74 
 
 		 326 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4163  hypothetical protein  27.27 
 
 		 328 aa  112  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000721269  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  25.66 
 
 		 330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3196  hypothetical protein  27.17 
 
 		 334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0435858  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1058  hypothetical protein  27.1 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37830  hypothetical protein  28.9 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  26.95 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1042  hypothetical protein  26.58 
 
 		 329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  27.88 
 
 		 326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2741  hypothetical protein  27.08 
 
 		 321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0278237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  28.9 
 
 		 313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  35.63 
 
 		 326 aa  110  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  29.36 
 
 		 329 aa  110  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3704  hypothetical protein  29.26 
 
 		 328 aa  109  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3342  hypothetical protein  26.64 
 
 		 326 aa  109  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.019229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1636  TctC protein  27.56 
 
 		 321 aa  108  9.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.777278  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0154  hypothetical protein  27.1 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3300  hypothetical protein  24.19 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.659933  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1418  tricarboxylate transport protein TctC, putative  27.1 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4303  hypothetical protein  27.1 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  29.64 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4284  hypothetical protein  27.11 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  28.9 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1452  hypothetical protein  26 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3897  hypothetical protein  31.45 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0101322  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  28.9 
 
 		 314 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4393  hypothetical protein  26.77 
 
 		 326 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  30.51 
 
 		 327 aa  106  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3966  hypothetical protein  27.16 
 
 		 325 aa  106  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.846302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  28.19 
 
 		 323 aa  105  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3697  hypothetical protein  29.39 
 
 		 334 aa  105  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583429  normal  0.151066 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  27.91 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  25.25 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  26.6 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  27.04 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54540  hypothetical protein  27.74 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000174239  normal  0.0908275 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  31.91 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  28.78 
 
 		 356 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  28.97 
 
 		 314 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0620  hypothetical protein  31.98 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2897  hypothetical protein  27.88 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4232  TctC protein, putative  26.57 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0066  hypothetical protein  26.21 
 
 		 345 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.909485 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  26.02 
 
 		 332 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  29.66 
 
 		 331 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  26.12 
 
 		 332 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  33.91 
 
 		 337 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8066  hypothetical protein  28.48 
 
 		 325 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  26.07 
 
 		 308 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2581  hypothetical protein  26.9 
 
 		 323 aa  103  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6257  hypothetical protein  29.87 
 
 		 332 aa  102  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.460323  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  30.42 
 
 		 330 aa  102  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0726  hypothetical protein  26.89 
 
 		 329 aa  102  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  30.79 
 
 		 327 aa  102  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  30.96 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  26.79 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0906  hypothetical protein  30.34 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4413  hypothetical protein  31.87 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112259  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4433  hypothetical protein  26.27 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  30.55 
 
 		 330 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>