More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0620 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0620  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  644    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  36.62 
 
 		 324 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  40.88 
 
 		 322 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  36.62 
 
 		 324 aa  204  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  36.62 
 
 		 324 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  38.26 
 
 		 318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  42.59 
 
 		 327 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  36.53 
 
 		 350 aa  198  9e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  36.54 
 
 		 327 aa  198  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  41.26 
 
 		 333 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  37.67 
 
 		 343 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  34.78 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  34.27 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  37.37 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  39.74 
 
 		 335 aa  193  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  37.87 
 
 		 337 aa  193  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  38.51 
 
 		 332 aa  193  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  35.71 
 
 		 318 aa  192  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  38.27 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  36.05 
 
 		 331 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  36.5 
 
 		 327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  35.51 
 
 		 331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  35.56 
 
 		 330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  37.03 
 
 		 320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  35.13 
 
 		 328 aa  189  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  36.15 
 
 		 330 aa  189  5e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  38.54 
 
 		 322 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  36.96 
 
 		 325 aa  189  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  36.96 
 
 		 329 aa  188  9e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  36.66 
 
 		 338 aa  188  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  37.12 
 
 		 325 aa  188  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  36.65 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  34.59 
 
 		 322 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  36.36 
 
 		 333 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  33.43 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  35.81 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3907  hypothetical protein  36.54 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  36.63 
 
 		 329 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  36.61 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  34.37 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  36.12 
 
 		 326 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  34.37 
 
 		 331 aa  187  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  36.39 
 
 		 331 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  37.04 
 
 		 325 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  34.57 
 
 		 328 aa  186  6e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  38.51 
 
 		 322 aa  186  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2876  hypothetical protein  36.7 
 
 		 328 aa  185  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  35.12 
 
 		 332 aa  185  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  39.58 
 
 		 328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  34.23 
 
 		 327 aa  185  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1654  hypothetical protein  38.18 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.917353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  38.13 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  35.33 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3021  hypothetical protein  37.08 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.119535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  34.26 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  37.3 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  38.13 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1449  twin-arginine translocation pathway signal  34.27 
 
 		 331 aa  183  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0404058  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  34.48 
 
 		 320 aa  183  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  36.51 
 
 		 330 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  34.67 
 
 		 336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0097  hypothetical protein  36.02 
 
 		 316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  33.78 
 
 		 329 aa  182  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  35.88 
 
 		 334 aa  182  6e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3894  hypothetical protein  36.25 
 
 		 327 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367386  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  34.34 
 
 		 336 aa  182  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0114  hypothetical protein  35 
 
 		 316 aa  182  6e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  34.01 
 
 		 338 aa  182  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  39.27 
 
 		 325 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  34.06 
 
 		 321 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  35.67 
 
 		 332 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  33.22 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  35.47 
 
 		 339 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  36.88 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1953  hypothetical protein  33.89 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2849  hypothetical protein  38.08 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225811  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4101  extra-cytoplasmic solute receptor  36.56 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0889008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  32.23 
 
 		 336 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  38.26 
 
 		 332 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  35.08 
 
 		 347 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1257  hypothetical protein  37.5 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.37979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1904  hypothetical protein  36.76 
 
 		 326 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  36.48 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2701  hypothetical protein  35.65 
 
 		 420 aa  180  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0277  hypothetical protein  35.43 
 
 		 332 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0974  hypothetical protein  35.6 
 
 		 324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.013055 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0599  hypothetical protein  33.89 
 
 		 325 aa  179  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127348  normal  0.507852 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  35.29 
 
 		 349 aa  179  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  36.67 
 
 		 335 aa  179  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  33.02 
 
 		 343 aa  180  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  34.27 
 
 		 328 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  32.09 
 
 		 328 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  35.69 
 
 		 327 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  36.48 
 
 		 323 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  32.09 
 
 		 328 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  35.02 
 
 		 345 aa  179  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  35.85 
 
 		 328 aa  179  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5204  hypothetical protein  33.45 
 
 		 335 aa  179  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  34.37 
 
 		 321 aa  179  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4413  hypothetical protein  33.78 
 
 		 302 aa  178  9e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>