More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_36130 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_36130  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  752    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000443052 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3081  hypothetical protein  91.69 
 
 		 337 aa  610  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165969  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5726  hypothetical protein  47.42 
 
 		 328 aa  311  7.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00555624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5629  periplasmic tricarboxylate binding receptor (TctC)  44.24 
 
 		 333 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4224  hypothetical protein  46.91 
 
 		 328 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3098  hypothetical protein  45.23 
 
 		 329 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49783  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3051  hypothetical protein  43.32 
 
 		 345 aa  291  8e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244764  normal  0.28827 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2026  hypothetical protein  42.72 
 
 		 337 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0845932  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3428  hypothetical protein  41.72 
 
 		 337 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.10884 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1853  hypothetical protein  42.9 
 
 		 337 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2795  hypothetical protein  42.11 
 
 		 341 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.687935  normal  0.0471733 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4493  hypothetical protein  41.23 
 
 		 341 aa  274  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2229  hypothetical protein  41.35 
 
 		 349 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0482  hypothetical protein  39.81 
 
 		 337 aa  268  8.999999999999999e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1220  hypothetical protein  32.47 
 
 		 328 aa  182  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.216947  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3196  hypothetical protein  27.83 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0435858  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0241  twin-arginine translocation pathway signal  29.24 
 
 		 332 aa  123  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.862974  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  25.93 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  28.85 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  28.85 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  28.85 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  24.24 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1252  hypothetical protein  25.74 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.336107  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  25.33 
 
 		 322 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  24.92 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3704  hypothetical protein  26.21 
 
 		 328 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  26.67 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  25.41 
 
 		 308 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  26.43 
 
 		 332 aa  99.8  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  25.26 
 
 		 326 aa  99.4  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  26.3 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  24.31 
 
 		 318 aa  97.1  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  26.83 
 
 		 326 aa  96.7  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1829  hypothetical protein  26.07 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  0.517051 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  25.49 
 
 		 350 aa  94.7  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  26.99 
 
 		 314 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  23.64 
 
 		 315 aa  94  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5905  hypothetical protein  24.66 
 
 		 325 aa  93.6  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.339531 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  26.28 
 
 		 314 aa  93.6  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  26.69 
 
 		 314 aa  93.6  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2078  hypothetical protein  25.07 
 
 		 341 aa  92.8  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000784829  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7081  hypothetical protein  24.85 
 
 		 319 aa  91.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2148  hypothetical protein  25.5 
 
 		 330 aa  90.9  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0726  hypothetical protein  27.18 
 
 		 329 aa  91.3  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2849  hypothetical protein  24.51 
 
 		 340 aa  90.5  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225811  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  23.93 
 
 		 328 aa  90.5  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0861  hypothetical protein  23.58 
 
 		 322 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37830  hypothetical protein  27.21 
 
 		 374 aa  89.7  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  28.8 
 
 		 329 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1058  hypothetical protein  27.54 
 
 		 326 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  25.17 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3313  hypothetical protein  24.01 
 
 		 314 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0066  hypothetical protein  25.41 
 
 		 345 aa  88.2  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.909485 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  23.81 
 
 		 330 aa  87.8  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1636  TctC protein  25.33 
 
 		 321 aa  87.4  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.777278  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4163  hypothetical protein  24.18 
 
 		 328 aa  86.3  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000721269  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  23.43 
 
 		 322 aa  86.3  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0872  hypothetical protein  22.96 
 
 		 322 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1825  hypothetical protein  26.89 
 
 		 346 aa  86.3  7e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0855  hypothetical protein  22.96 
 
 		 322 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.769055  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  22.35 
 
 		 329 aa  86.3  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1418  tricarboxylate transport protein TctC, putative  27.54 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3342  hypothetical protein  25.69 
 
 		 326 aa  85.9  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.019229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4303  hypothetical protein  27.54 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  25.37 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1457  hypothetical protein  26.32 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0154  hypothetical protein  26.86 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4393  hypothetical protein  27.21 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  25 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  21.49 
 
 		 324 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0998  hypothetical protein  28.01 
 
 		 333 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  26.36 
 
 		 331 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1353  hypothetical protein  26.56 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0759073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2898  tricarboxylic transport  25.48 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4766  hypothetical protein  25.9 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2930  tricarboxylic transport  25.48 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.181856 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  25.41 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5795  hypothetical protein  26.56 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0293168 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3856  hypothetical protein  21.88 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000269594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1452  hypothetical protein  26.78 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5624  hypothetical protein  24.62 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  24.92 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3490  hypothetical protein  25.74 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3085  tricarboxylic transport  25.16 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2982  tricarboxylic transport  25.16 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.672552 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0734  hypothetical protein  24.03 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0775704  decreased coverage  0.00137039 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2965  tricarboxylic transport  25.16 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443141 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  24.23 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0353  hypothetical protein  26 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2072  hypothetical protein  22.06 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1642  hypothetical protein  22.06 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274465  normal  0.0446405 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  27.36 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  22.43 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2390  hypothetical protein  24.7 
 
 		 337 aa  79.3  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410983  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  30.54 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  23.79 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000184229  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  22.98 
 
 		 318 aa  79.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1047  hypothetical protein  24.16 
 
 		 316 aa  79  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0384871  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  22.78 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  26.09 
 
 		 327 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>