More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4163 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4163  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  651    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000721269  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1829  hypothetical protein  55.02 
 
 		 329 aa  353  2e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  0.517051 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2148  hypothetical protein  59.93 
 
 		 330 aa  342  5.999999999999999e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0323  hypothetical protein  54.49 
 
 		 331 aa  331  1e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8066  hypothetical protein  50.17 
 
 		 325 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  49.2 
 
 		 316 aa  290  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  47.14 
 
 		 315 aa  288  9e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  47.4 
 
 		 314 aa  285  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3313  hypothetical protein  50.35 
 
 		 314 aa  285  8e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  47.06 
 
 		 314 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  47.75 
 
 		 314 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  47.4 
 
 		 314 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3490  hypothetical protein  47.4 
 
 		 314 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  45.28 
 
 		 324 aa  280  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  47.12 
 
 		 311 aa  279  5e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  47.08 
 
 		 308 aa  277  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0066  hypothetical protein  47.24 
 
 		 345 aa  275  7e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.909485 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0998  hypothetical protein  45.87 
 
 		 333 aa  271  9e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  46.9 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  46.37 
 
 		 313 aa  267  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  45.33 
 
 		 314 aa  266  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3704  hypothetical protein  45.36 
 
 		 328 aa  265  8e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37830  hypothetical protein  44.88 
 
 		 374 aa  262  4.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3004  hypothetical protein  43.39 
 
 		 332 aa  258  8e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.033569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3502  hypothetical protein  39.45 
 
 		 334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.819446  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5905  hypothetical protein  39.44 
 
 		 325 aa  253  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.339531 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0361  hypothetical protein  40.98 
 
 		 323 aa  243  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.662417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  38.24 
 
 		 319 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3010  hypothetical protein  41.78 
 
 		 319 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00840  hypothetical protein  40.85 
 
 		 335 aa  239  4e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0173913  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2072  hypothetical protein  42.07 
 
 		 319 aa  239  5e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1642  hypothetical protein  42.07 
 
 		 319 aa  239  5e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274465  normal  0.0446405 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  43.1 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  44.48 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3625  hypothetical protein  41.16 
 
 		 339 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2569  hypothetical protein  39.94 
 
 		 319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0034025 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1234  hypothetical protein  39.44 
 
 		 319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2009  hypothetical protein  41.03 
 
 		 319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3248  hypothetical protein  44.03 
 
 		 328 aa  229  7e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273356  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0596  hypothetical protein  41.22 
 
 		 336 aa  227  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479944 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3075  hypothetical protein  42.49 
 
 		 323 aa  227  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3299  hypothetical protein  43.69 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0536538  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3237  hypothetical protein  43.69 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2518  hypothetical protein  39.66 
 
 		 319 aa  225  7e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3011  hypothetical protein  40 
 
 		 319 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655008 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1395  hypothetical protein  40.48 
 
 		 335 aa  221  9e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0574924  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1042  hypothetical protein  40.33 
 
 		 329 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2012  twin-arginine translocation pathway signal  39.52 
 
 		 341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1237  hypothetical protein  36.76 
 
 		 337 aa  207  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.462545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5058  hypothetical protein  39.86 
 
 		 358 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.566129  normal  0.354156 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3102  hypothetical protein  36.61 
 
 		 338 aa  195  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.571018 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2509  hypothetical protein  38.85 
 
 		 317 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0752263  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4958  hypothetical protein  39.04 
 
 		 319 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  32 
 
 		 346 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  31.97 
 
 		 323 aa  163  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  33.55 
 
 		 330 aa  159  5e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6270  putative tricarboxylic transport membrane protein  32.77 
 
 		 342 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0141318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2741  hypothetical protein  36.81 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0278237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1252  hypothetical protein  30.95 
 
 		 334 aa  153  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.336107  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3123  hypothetical protein  32.87 
 
 		 326 aa  152  8e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0872  hypothetical protein  35.93 
 
 		 322 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0855  hypothetical protein  35.93 
 
 		 322 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.769055  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0861  hypothetical protein  35.93 
 
 		 322 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3489  hypothetical protein  33.58 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1873  hypothetical protein  28.95 
 
 		 326 aa  149  7e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797689  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  28.79 
 
 		 330 aa  149  8e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003384  putative tricarboxylic transport TctC  29.51 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2732  hypothetical protein  31.68 
 
 		 326 aa  146  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2192  hypothetical protein  29.9 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02414  hypothetical protein  28.67 
 
 		 325 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2117  hypothetical protein  33.2 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.820451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5629  periplasmic tricarboxylate binding receptor (TctC)  29.93 
 
 		 333 aa  139  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  32.01 
 
 		 336 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  30.53 
 
 		 329 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1058  hypothetical protein  30.87 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0726  hypothetical protein  29.01 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2897  hypothetical protein  31 
 
 		 325 aa  132  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  27.94 
 
 		 332 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1457  hypothetical protein  31.19 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1353  hypothetical protein  30.2 
 
 		 325 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0759073  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0734  hypothetical protein  30.82 
 
 		 322 aa  129  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0775704  decreased coverage  0.00137039 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0241  twin-arginine translocation pathway signal  30.58 
 
 		 332 aa  129  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.862974  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0902  tricarboxylic transport  27.52 
 
 		 325 aa  129  7.000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.897753  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1418  tricarboxylate transport protein TctC, putative  30.2 
 
 		 326 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4303  hypothetical protein  30.2 
 
 		 326 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2581  hypothetical protein  27.91 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4393  hypothetical protein  29.87 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3342  hypothetical protein  28.23 
 
 		 326 aa  126  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.019229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  27.78 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0839  hypothetical protein  27.01 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00353012  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3966  hypothetical protein  29.87 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.846302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1006  tricarboxylate-binding protein  27.05 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1825  hypothetical protein  29.8 
 
 		 346 aa  123  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1636  TctC protein  30.07 
 
 		 321 aa  123  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.777278  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1091  putative lipoprotein  26.77 
 
 		 325 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4344  putative lipoprotein  26.64 
 
 		 325 aa  122  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0136809  hitchhiker  0.000000000438941 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4232  TctC protein, putative  30.2 
 
 		 325 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2824  hypothetical protein  30.07 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0750754 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  29.29 
 
 		 326 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0967  tricarboxylate-binding protein  26.69 
 
 		 323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>