More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0734 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0734  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  651    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0775704  decreased coverage  0.00137039 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2824  hypothetical protein  85.02 
 
 
321 aa  515  1.0000000000000001e-145  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0750754 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0726  hypothetical protein  46.26 
 
 
329 aa  289  4e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  42.46 
 
 
330 aa  283  4.0000000000000003e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  46.75 
 
 
329 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4232  TctC protein, putative  43.53 
 
 
325 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3966  hypothetical protein  42.55 
 
 
325 aa  272  6e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.846302  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1252  hypothetical protein  44.1 
 
 
334 aa  270  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.336107  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3085  tricarboxylic transport  40 
 
 
325 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2965  tricarboxylic transport  40 
 
 
325 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2982  tricarboxylic transport  40 
 
 
325 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.672552 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2898  tricarboxylic transport  39.69 
 
 
325 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2930  tricarboxylic transport  39.69 
 
 
325 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.181856 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0154  hypothetical protein  43.29 
 
 
326 aa  268  7e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1457  hypothetical protein  40.92 
 
 
325 aa  267  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1363  hypothetical protein  39.42 
 
 
325 aa  267  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4393  hypothetical protein  43.19 
 
 
326 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1418  tricarboxylate transport protein TctC, putative  43.19 
 
 
326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930091  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4303  hypothetical protein  43.19 
 
 
326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1058  hypothetical protein  42.86 
 
 
326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0902  tricarboxylic transport  37.54 
 
 
325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.897753  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1353  hypothetical protein  41.25 
 
 
325 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0759073  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3342  hypothetical protein  40.67 
 
 
326 aa  265  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.019229  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1636  TctC protein  42.05 
 
 
321 aa  259  5.0000000000000005e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.777278  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2581  hypothetical protein  37.54 
 
 
323 aa  258  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4433  hypothetical protein  40.52 
 
 
325 aa  257  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4766  hypothetical protein  41.53 
 
 
326 aa  255  7e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1825  hypothetical protein  40.67 
 
 
346 aa  253  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3856  hypothetical protein  40.51 
 
 
331 aa  252  6e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000269594 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54540  hypothetical protein  42.86 
 
 
327 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000174239  normal  0.0908275 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49460  tripartite tricarboxylate transporter periplasmic receptor protein  41.2 
 
 
327 aa  249  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0378673  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2897  hypothetical protein  44.44 
 
 
325 aa  245  6e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05850  hypothetical protein  38.06 
 
 
325 aa  232  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49490  Uncharacterized protein family UPF0065  36.88 
 
 
325 aa  229  6e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00178438  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1452  hypothetical protein  38.22 
 
 
323 aa  228  8e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  37.27 
 
 
330 aa  218  1e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  38.08 
 
 
346 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3804  hypothetical protein  34.46 
 
 
349 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0115718  normal  0.430416 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3933  extra-cytoplasmic solute receptor  38.01 
 
 
311 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3784  hypothetical protein  35.35 
 
 
327 aa  202  7e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3334  hypothetical protein  36.7 
 
 
339 aa  185  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02414  hypothetical protein  34.01 
 
 
325 aa  182  6e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  34.48 
 
 
315 aa  182  7e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  33.22 
 
 
323 aa  179  8e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003384  putative tricarboxylic transport TctC  32.99 
 
 
323 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1873  hypothetical protein  32.99 
 
 
326 aa  176  6e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797689  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2192  hypothetical protein  30.95 
 
 
328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3123  hypothetical protein  33.98 
 
 
326 aa  169  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37830  hypothetical protein  32.66 
 
 
374 aa  168  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3248  hypothetical protein  32.91 
 
 
328 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273356  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0901  hypothetical protein  33.33 
 
 
317 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3004  hypothetical protein  31.21 
 
 
332 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.033569 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0925  hypothetical protein  33.33 
 
 
317 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.524752  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3435  hypothetical protein  33.33 
 
 
317 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.636494  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3237  hypothetical protein  32.28 
 
 
328 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3099  hypothetical protein  33.33 
 
 
317 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0873  hypothetical protein  33.33 
 
 
317 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3299  hypothetical protein  32.28 
 
 
328 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0536538  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0935  hypothetical protein  32.98 
 
 
317 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3489  hypothetical protein  33.59 
 
 
324 aa  159  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  32.6 
 
 
332 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  32.12 
 
 
324 aa  159  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8066  hypothetical protein  31.53 
 
 
325 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  32.89 
 
 
332 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3502  hypothetical protein  30.57 
 
 
334 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.819446  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  31.97 
 
 
336 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1829  hypothetical protein  31.63 
 
 
329 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  0.517051 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2148  hypothetical protein  32.76 
 
 
330 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0998  hypothetical protein  32.65 
 
 
333 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  31.76 
 
 
308 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  33.11 
 
 
314 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2732  hypothetical protein  32.82 
 
 
326 aa  148  9e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15224  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  33.11 
 
 
314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1042  hypothetical protein  32.99 
 
 
329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  33.11 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00840  hypothetical protein  31.63 
 
 
335 aa  145  9e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0173913  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  32.43 
 
 
328 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  31.96 
 
 
322 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  34.12 
 
 
314 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1395  hypothetical protein  33.67 
 
 
335 aa  143  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0574924  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3490  hypothetical protein  34.12 
 
 
314 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970248  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0596  hypothetical protein  33.33 
 
 
336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0066  hypothetical protein  30.43 
 
 
345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.909485 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  30.19 
 
 
316 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  32.3 
 
 
322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  29.04 
 
 
311 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3625  hypothetical protein  30.74 
 
 
339 aa  139  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  31.08 
 
 
314 aa  139  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0861  hypothetical protein  31.94 
 
 
322 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2078  hypothetical protein  31.51 
 
 
341 aa  139  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000784829  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  31.19 
 
 
319 aa  139  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0855  hypothetical protein  31.6 
 
 
322 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.769055  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0872  hypothetical protein  31.6 
 
 
322 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  31.08 
 
 
314 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3313  hypothetical protein  29.73 
 
 
314 aa  136  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2741  hypothetical protein  30.4 
 
 
321 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0278237  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3704  hypothetical protein  31.99 
 
 
328 aa  135  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2795  hypothetical protein  30.55 
 
 
341 aa  135  9e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.687935  normal  0.0471733 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  30.38 
 
 
322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0967  tricarboxylate-binding protein  26.74 
 
 
323 aa  133  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>