More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1453 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  676    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2897  hypothetical protein  77.96 
 
 		 325 aa  491  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  64.67 
 
 		 330 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1252  hypothetical protein  57.14 
 
 		 334 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.336107  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3856  hypothetical protein  53.01 
 
 		 331 aa  350  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000269594 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0734  hypothetical protein  46.75 
 
 		 322 aa  280  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0775704  decreased coverage  0.00137039 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3784  hypothetical protein  45.64 
 
 		 327 aa  278  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0726  hypothetical protein  45 
 
 		 329 aa  267  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2824  hypothetical protein  43.61 
 
 		 321 aa  264  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0750754 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1457  hypothetical protein  40.06 
 
 		 325 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2898  tricarboxylic transport  37.73 
 
 		 325 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2930  tricarboxylic transport  37.73 
 
 		 325 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.181856 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3342  hypothetical protein  37.86 
 
 		 326 aa  240  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.019229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2982  tricarboxylic transport  37.42 
 
 		 325 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.672552 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3085  tricarboxylic transport  37.42 
 
 		 325 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2965  tricarboxylic transport  37.42 
 
 		 325 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443141 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1353  hypothetical protein  39.94 
 
 		 325 aa  238  9e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0759073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3966  hypothetical protein  39.02 
 
 		 325 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.846302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0902  tricarboxylic transport  36.5 
 
 		 325 aa  235  7e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.897753  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1058  hypothetical protein  39.32 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4232  TctC protein, putative  38.41 
 
 		 325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4766  hypothetical protein  40 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2581  hypothetical protein  36.99 
 
 		 323 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1418  tricarboxylate transport protein TctC, putative  39.32 
 
 		 326 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4303  hypothetical protein  39.32 
 
 		 326 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1636  TctC protein  38.36 
 
 		 321 aa  229  4e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.777278  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4393  hypothetical protein  38.7 
 
 		 326 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1363  hypothetical protein  37 
 
 		 325 aa  229  6e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4433  hypothetical protein  38.7 
 
 		 325 aa  228  7e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  38.91 
 
 		 330 aa  228  1e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54540  hypothetical protein  40.33 
 
 		 327 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000174239  normal  0.0908275 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0154  hypothetical protein  39.53 
 
 		 326 aa  222  9e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1825  hypothetical protein  36.45 
 
 		 346 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1452  hypothetical protein  35.57 
 
 		 323 aa  207  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49460  tripartite tricarboxylate transporter periplasmic receptor protein  37.99 
 
 		 327 aa  205  9e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0378673  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05850  hypothetical protein  34.89 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3804  hypothetical protein  35.91 
 
 		 349 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0115718  normal  0.430416 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3933  extra-cytoplasmic solute receptor  38.95 
 
 		 311 aa  199  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  34.54 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3334  hypothetical protein  36.19 
 
 		 339 aa  192  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49490  Uncharacterized protein family UPF0065  33.67 
 
 		 325 aa  188  9e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00178438  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3248  hypothetical protein  35.71 
 
 		 328 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273356  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1829  hypothetical protein  35.11 
 
 		 329 aa  179  9e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  0.517051 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  38.05 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3299  hypothetical protein  35.4 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0536538  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3237  hypothetical protein  35.4 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003384  putative tricarboxylic transport TctC  34.06 
 
 		 323 aa  176  7e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02414  hypothetical protein  33.95 
 
 		 325 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37830  hypothetical protein  34.34 
 
 		 374 aa  173  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  34.1 
 
 		 315 aa  172  5.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3004  hypothetical protein  33.89 
 
 		 332 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.033569 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  37.71 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  34.44 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  35.76 
 
 		 308 aa  170  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  37.37 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3502  hypothetical protein  33.23 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.819446  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3490  hypothetical protein  36.7 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970248  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2148  hypothetical protein  36.24 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0066  hypothetical protein  36.12 
 
 		 345 aa  162  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.909485 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  31.5 
 
 		 323 aa  162  8.000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2192  hypothetical protein  32.83 
 
 		 328 aa  162  8.000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  30.12 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  34.8 
 
 		 314 aa  159  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  33.75 
 
 		 316 aa  160  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2509  hypothetical protein  35.87 
 
 		 317 aa  159  7e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0752263  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1873  hypothetical protein  32.44 
 
 		 326 aa  158  9e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797689  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2732  hypothetical protein  34.5 
 
 		 326 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3123  hypothetical protein  32.62 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  30.91 
 
 		 319 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3489  hypothetical protein  34.4 
 
 		 324 aa  153  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2569  hypothetical protein  32.38 
 
 		 319 aa  153  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0034025 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  32.77 
 
 		 314 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  32.77 
 
 		 314 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8066  hypothetical protein  31.67 
 
 		 325 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5905  hypothetical protein  31.68 
 
 		 325 aa  150  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.339531 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3313  hypothetical protein  29.5 
 
 		 314 aa  150  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  35.33 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3704  hypothetical protein  33.22 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0596  hypothetical protein  31.7 
 
 		 336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479944 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1011  putative lipoprotein  28.92 
 
 		 324 aa  143  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.9236  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1395  hypothetical protein  31.89 
 
 		 335 aa  144  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0574924  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0813  hypothetical protein  29.37 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0839  hypothetical protein  29.68 
 
 		 343 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00353012  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  32.23 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1006  tricarboxylate-binding protein  28.67 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00840  hypothetical protein  30.72 
 
 		 335 aa  140  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0173913  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4163  hypothetical protein  30.53 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000721269  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3099  hypothetical protein  32.92 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0873  hypothetical protein  32.92 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1091  putative lipoprotein  28.98 
 
 		 325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0925  hypothetical protein  33.23 
 
 		 317 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.524752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3435  hypothetical protein  33.23 
 
 		 317 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.636494  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3010  hypothetical protein  31.31 
 
 		 319 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  29.28 
 
 		 332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0901  hypothetical protein  33.23 
 
 		 317 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0967  tricarboxylate-binding protein  28.18 
 
 		 323 aa  139  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3075  hypothetical protein  35.74 
 
 		 323 aa  139  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0361  hypothetical protein  31.42 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.662417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0935  hypothetical protein  31.82 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3625  hypothetical protein  30.67 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>