More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2732 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2732  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  656    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3123  hypothetical protein  78.12 
 
 		 326 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3489  hypothetical protein  73.75 
 
 		 324 aa  417  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2192  hypothetical protein  53.99 
 
 		 328 aa  353  2e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003384  putative tricarboxylic transport TctC  53.77 
 
 		 323 aa  350  3e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  53.02 
 
 		 323 aa  347  2e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02414  hypothetical protein  53.77 
 
 		 325 aa  346  3e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1873  hypothetical protein  56.08 
 
 		 326 aa  342  4e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797689  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3099  hypothetical protein  52.9 
 
 		 317 aa  288  9e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0873  hypothetical protein  52.9 
 
 		 317 aa  288  9e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0925  hypothetical protein  51.61 
 
 		 317 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.524752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0901  hypothetical protein  51.61 
 
 		 317 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3435  hypothetical protein  51.61 
 
 		 317 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.636494  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0935  hypothetical protein  52.56 
 
 		 317 aa  286  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  39.19 
 
 		 346 aa  209  5e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  34.66 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1829  hypothetical protein  35.24 
 
 		 329 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  0.517051 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37830  hypothetical protein  35.84 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3502  hypothetical protein  33.33 
 
 		 334 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.819446  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  31.99 
 
 		 330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5905  hypothetical protein  35.14 
 
 		 325 aa  182  9.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.339531 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  33.68 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  33.68 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3004  hypothetical protein  33.11 
 
 		 332 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.033569 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0361  hypothetical protein  32.61 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.662417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  33.9 
 
 		 324 aa  176  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2148  hypothetical protein  34.78 
 
 		 330 aa  176  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  32.92 
 
 		 328 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3625  hypothetical protein  33.22 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  34.57 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  32.9 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0066  hypothetical protein  32.66 
 
 		 345 aa  173  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.909485 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  32.3 
 
 		 314 aa  172  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  31.15 
 
 		 308 aa  172  9e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1252  hypothetical protein  31.02 
 
 		 334 aa  169  6e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.336107  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  31.13 
 
 		 319 aa  169  7e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3313  hypothetical protein  31.6 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  34.02 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2569  hypothetical protein  31.35 
 
 		 319 aa  168  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0034025 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3010  hypothetical protein  31.54 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  29.93 
 
 		 322 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  32.99 
 
 		 313 aa  166  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  31.27 
 
 		 314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0861  hypothetical protein  34.91 
 
 		 322 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00840  hypothetical protein  33.23 
 
 		 335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0173913  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3490  hypothetical protein  34.02 
 
 		 314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3248  hypothetical protein  33.89 
 
 		 328 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273356  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  32.19 
 
 		 316 aa  162  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0872  hypothetical protein  34.55 
 
 		 322 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0855  hypothetical protein  34.55 
 
 		 322 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.769055  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2897  hypothetical protein  33.56 
 
 		 325 aa  162  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3299  hypothetical protein  33.56 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0536538  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3237  hypothetical protein  33.56 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2072  hypothetical protein  31.34 
 
 		 319 aa  159  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1642  hypothetical protein  31.34 
 
 		 319 aa  159  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274465  normal  0.0446405 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1395  hypothetical protein  33.56 
 
 		 335 aa  159  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0574924  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0734  hypothetical protein  32.76 
 
 		 322 aa  159  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0775704  decreased coverage  0.00137039 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2741  hypothetical protein  34.57 
 
 		 321 aa  159  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0278237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  31.06 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8066  hypothetical protein  31.54 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1042  hypothetical protein  31.86 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4163  hypothetical protein  31.68 
 
 		 328 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000721269  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1234  hypothetical protein  31.02 
 
 		 319 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0596  hypothetical protein  31.77 
 
 		 336 aa  156  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479944 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2518  hypothetical protein  31.21 
 
 		 319 aa  156  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106324  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0998  hypothetical protein  33.33 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2009  hypothetical protein  31.05 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4344  putative lipoprotein  28.18 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0136809  hitchhiker  0.000000000438941 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0839  hypothetical protein  28.67 
 
 		 343 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00353012  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  29.21 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3011  hypothetical protein  30.11 
 
 		 319 aa  146  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655008 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2824  hypothetical protein  31.97 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0750754 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1006  tricarboxylate-binding protein  28.87 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  28.57 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3075  hypothetical protein  29.86 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3784  hypothetical protein  29.52 
 
 		 327 aa  142  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  27.64 
 
 		 332 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0871  putative lipoprotein  28.47 
 
 		 348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0967  tricarboxylate-binding protein  28.83 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1011  putative lipoprotein  27.49 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.9236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0925  putative lipoprotein  28.47 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3704  hypothetical protein  31.08 
 
 		 328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1091  putative lipoprotein  28.47 
 
 		 325 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0813  hypothetical protein  27.49 
 
 		 322 aa  139  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2509  hypothetical protein  31.63 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0752263  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1636  TctC protein  27.33 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.777278  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5058  hypothetical protein  28.31 
 
 		 358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.566129  normal  0.354156 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1755  hypothetical protein  28.97 
 
 		 325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191519  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2581  hypothetical protein  27.92 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3856  hypothetical protein  29.88 
 
 		 331 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000269594 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1237  hypothetical protein  28.83 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.462545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0323  hypothetical protein  29.85 
 
 		 331 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1853  hypothetical protein  28.91 
 
 		 337 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2012  twin-arginine translocation pathway signal  29.17 
 
 		 341 aa  126  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2795  hypothetical protein  29.45 
 
 		 341 aa  126  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.687935  normal  0.0471733 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1457  hypothetical protein  27.81 
 
 		 325 aa  126  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4958  hypothetical protein  30.85 
 
 		 319 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1825  hypothetical protein  27 
 
 		 346 aa  124  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3428  hypothetical protein  29.9 
 
 		 337 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.10884 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0154  hypothetical protein  28.86 
 
 		 326 aa  123  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>