More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3784 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3784  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  655    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  42.59 
 
 
330 aa  288  6e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  44.38 
 
 
329 aa  268  8e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1252  hypothetical protein  42.81 
 
 
334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.336107  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2897  hypothetical protein  43.43 
 
 
325 aa  262  6e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3856  hypothetical protein  39.7 
 
 
331 aa  251  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000269594 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1457  hypothetical protein  36.53 
 
 
325 aa  199  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0726  hypothetical protein  36.88 
 
 
329 aa  196  5.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4433  hypothetical protein  33.66 
 
 
325 aa  193  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0734  hypothetical protein  35.35 
 
 
322 aa  192  5e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0775704  decreased coverage  0.00137039 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2824  hypothetical protein  36.03 
 
 
321 aa  189  7e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0750754 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3966  hypothetical protein  35.85 
 
 
325 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.846302  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0154  hypothetical protein  36.81 
 
 
326 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4232  TctC protein, putative  35.02 
 
 
325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3342  hypothetical protein  34.92 
 
 
326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.019229  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2581  hypothetical protein  33.44 
 
 
323 aa  182  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2898  tricarboxylic transport  34.77 
 
 
325 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2930  tricarboxylic transport  34.77 
 
 
325 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.181856 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2965  tricarboxylic transport  34.46 
 
 
325 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443141 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3085  tricarboxylic transport  34.46 
 
 
325 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2982  tricarboxylic transport  34.46 
 
 
325 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.672552 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1353  hypothetical protein  34.25 
 
 
325 aa  180  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0759073  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4766  hypothetical protein  35.57 
 
 
326 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1363  hypothetical protein  34.34 
 
 
325 aa  178  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4303  hypothetical protein  32.21 
 
 
326 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1418  tricarboxylate transport protein TctC, putative  32.21 
 
 
326 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930091  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4393  hypothetical protein  32.21 
 
 
326 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1058  hypothetical protein  31.9 
 
 
326 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  30.3 
 
 
330 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1636  TctC protein  32.11 
 
 
321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.777278  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54540  hypothetical protein  35.91 
 
 
327 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000174239  normal  0.0908275 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49460  tripartite tricarboxylate transporter periplasmic receptor protein  36.25 
 
 
327 aa  169  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0378673  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0902  tricarboxylic transport  29.81 
 
 
325 aa  167  2e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.897753  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  32.43 
 
 
346 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05850  hypothetical protein  32.92 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3933  extra-cytoplasmic solute receptor  36.82 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3804  hypothetical protein  32.62 
 
 
349 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0115718  normal  0.430416 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49490  Uncharacterized protein family UPF0065  33.55 
 
 
325 aa  155  8e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00178438  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1825  hypothetical protein  32.21 
 
 
346 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1452  hypothetical protein  32.09 
 
 
323 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  30.7 
 
 
323 aa  149  6e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003384  putative tricarboxylic transport TctC  27.78 
 
 
323 aa  145  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02414  hypothetical protein  28.21 
 
 
325 aa  142  8e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1873  hypothetical protein  30.3 
 
 
326 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797689  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  30.17 
 
 
328 aa  136  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  29.59 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3502  hypothetical protein  31.06 
 
 
334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.819446  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  30.95 
 
 
314 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2192  hypothetical protein  27.94 
 
 
328 aa  133  5e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3490  hypothetical protein  30.61 
 
 
314 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970248  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3004  hypothetical protein  30.38 
 
 
332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.033569 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  29.93 
 
 
314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  29.28 
 
 
314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  30.26 
 
 
314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37830  hypothetical protein  27.99 
 
 
374 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3123  hypothetical protein  29.47 
 
 
326 aa  129  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3248  hypothetical protein  31.06 
 
 
328 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273356  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  30.43 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3313  hypothetical protein  28.95 
 
 
314 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  28.3 
 
 
316 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3299  hypothetical protein  30.38 
 
 
328 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0536538  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3237  hypothetical protein  30.38 
 
 
328 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2732  hypothetical protein  29.57 
 
 
326 aa  124  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15224  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3334  hypothetical protein  30.36 
 
 
339 aa  122  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3099  hypothetical protein  28.52 
 
 
317 aa  122  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0873  hypothetical protein  28.52 
 
 
317 aa  122  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0066  hypothetical protein  30.85 
 
 
345 aa  122  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.909485 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0872  hypothetical protein  30.58 
 
 
322 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0855  hypothetical protein  30.58 
 
 
322 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.769055  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0901  hypothetical protein  28.52 
 
 
317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3435  hypothetical protein  28.52 
 
 
317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.636494  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3489  hypothetical protein  29.29 
 
 
324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  27.18 
 
 
324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0935  hypothetical protein  28.52 
 
 
317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0925  hypothetical protein  28.52 
 
 
317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.524752  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  27.6 
 
 
315 aa  120  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0596  hypothetical protein  27.89 
 
 
336 aa  119  7.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479944 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5905  hypothetical protein  28.67 
 
 
325 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.339531 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  28.29 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  29.55 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0361  hypothetical protein  30.41 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.662417  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0861  hypothetical protein  30.22 
 
 
322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2072  hypothetical protein  28.27 
 
 
319 aa  117  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1642  hypothetical protein  28.27 
 
 
319 aa  117  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274465  normal  0.0446405 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1829  hypothetical protein  27.95 
 
 
329 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  0.517051 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  27.97 
 
 
308 aa  116  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1395  hypothetical protein  27.21 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0574924  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3704  hypothetical protein  28.47 
 
 
328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2518  hypothetical protein  27.27 
 
 
319 aa  112  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106324  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8066  hypothetical protein  26.19 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3625  hypothetical protein  26.62 
 
 
339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3075  hypothetical protein  31.29 
 
 
323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2509  hypothetical protein  28.96 
 
 
317 aa  110  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0752263  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4344  putative lipoprotein  23.97 
 
 
325 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0136809  hitchhiker  0.000000000438941 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1091  putative lipoprotein  24.3 
 
 
325 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3010  hypothetical protein  26.87 
 
 
319 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2514  hypothetical protein  26.59 
 
 
325 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1234  hypothetical protein  28.33 
 
 
319 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  29.9 
 
 
322 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1042  hypothetical protein  28.62 
 
 
329 aa  105  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>