More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3804 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3804  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  704    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0115718  normal  0.430416 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3334  hypothetical protein  56.67 
 
 		 339 aa  318  9e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1452  hypothetical protein  48.11 
 
 		 323 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3342  hypothetical protein  43.62 
 
 		 326 aa  281  9e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.019229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0154  hypothetical protein  46.94 
 
 		 326 aa  280  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1457  hypothetical protein  44.13 
 
 		 325 aa  276  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2581  hypothetical protein  43.88 
 
 		 323 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1363  hypothetical protein  44.22 
 
 		 325 aa  272  5.000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2898  tricarboxylic transport  40.74 
 
 		 325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2930  tricarboxylic transport  40.74 
 
 		 325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.181856 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3085  tricarboxylic transport  40.43 
 
 		 325 aa  269  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2982  tricarboxylic transport  40.43 
 
 		 325 aa  269  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.672552 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2965  tricarboxylic transport  40.43 
 
 		 325 aa  269  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443141 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3933  extra-cytoplasmic solute receptor  47.62 
 
 		 311 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4766  hypothetical protein  41.81 
 
 		 326 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4433  hypothetical protein  41.89 
 
 		 325 aa  259  5.0000000000000005e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1353  hypothetical protein  41.14 
 
 		 325 aa  256  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0759073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1058  hypothetical protein  41.14 
 
 		 326 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49490  Uncharacterized protein family UPF0065  45.64 
 
 		 325 aa  256  5e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00178438  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0726  hypothetical protein  43.05 
 
 		 329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1825  hypothetical protein  42.86 
 
 		 346 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3966  hypothetical protein  40.8 
 
 		 325 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.846302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05850  hypothetical protein  42.11 
 
 		 325 aa  253  5.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4232  TctC protein, putative  40.8 
 
 		 325 aa  252  6e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4393  hypothetical protein  40.47 
 
 		 326 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1418  tricarboxylate transport protein TctC, putative  40.47 
 
 		 326 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4303  hypothetical protein  40.47 
 
 		 326 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49460  tripartite tricarboxylate transporter periplasmic receptor protein  44.75 
 
 		 327 aa  250  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0378673  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54540  hypothetical protein  43.37 
 
 		 327 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000174239  normal  0.0908275 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1636  TctC protein  44.07 
 
 		 321 aa  248  2e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.777278  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0902  tricarboxylic transport  35.17 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.897753  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0734  hypothetical protein  34.56 
 
 		 322 aa  194  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0775704  decreased coverage  0.00137039 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  34.75 
 
 		 329 aa  193  4e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1252  hypothetical protein  34.58 
 
 		 334 aa  192  7e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.336107  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2824  hypothetical protein  34.23 
 
 		 321 aa  189  9e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0750754 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  31.99 
 
 		 330 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2897  hypothetical protein  31.86 
 
 		 325 aa  169  8e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3784  hypothetical protein  33.22 
 
 		 327 aa  150  4e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3856  hypothetical protein  26.14 
 
 		 331 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000269594 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  31.89 
 
 		 346 aa  136  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2741  hypothetical protein  32.85 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0278237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  29.36 
 
 		 330 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0861  hypothetical protein  31.72 
 
 		 322 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0855  hypothetical protein  31.38 
 
 		 322 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.769055  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0872  hypothetical protein  31.38 
 
 		 322 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  33.22 
 
 		 336 aa  123  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  30.24 
 
 		 319 aa  119  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3010  hypothetical protein  29.29 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  30.94 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  29.84 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2009  hypothetical protein  29.53 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1234  hypothetical protein  27.51 
 
 		 319 aa  109  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  29.92 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  32.65 
 
 		 314 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  29.93 
 
 		 322 aa  105  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  29.72 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  32.39 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37830  hypothetical protein  30.04 
 
 		 374 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2569  hypothetical protein  27.18 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0034025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8066  hypothetical protein  30.17 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0998  hypothetical protein  30.9 
 
 		 333 aa  103  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  32.91 
 
 		 313 aa  103  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  33.47 
 
 		 314 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2518  hypothetical protein  27.06 
 
 		 319 aa  102  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2078  hypothetical protein  30.36 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000784829  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  30.24 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2072  hypothetical protein  27.49 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1642  hypothetical protein  27.49 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274465  normal  0.0446405 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3313  hypothetical protein  28.43 
 
 		 314 aa  100  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00840  hypothetical protein  29.91 
 
 		 335 aa  99.8  6e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0173913  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003384  putative tricarboxylic transport TctC  28.63 
 
 		 323 aa  99.4  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  26.71 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2192  hypothetical protein  29.15 
 
 		 328 aa  98.2  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  27.66 
 
 		 308 aa  98.6  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2732  hypothetical protein  30.96 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  27.78 
 
 		 316 aa  97.4  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1873  hypothetical protein  29.84 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797689  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0241  twin-arginine translocation pathway signal  30.1 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.862974  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2148  hypothetical protein  32.78 
 
 		 330 aa  96.7  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3490  hypothetical protein  33.05 
 
 		 314 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  28.17 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3123  hypothetical protein  34.16 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0967  tricarboxylate-binding protein  25.95 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  32.2 
 
 		 314 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3004  hypothetical protein  27.15 
 
 		 332 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.033569 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02414  hypothetical protein  27.82 
 
 		 325 aa  93.2  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  31.44 
 
 		 328 aa  92.8  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  31.56 
 
 		 315 aa  92.4  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0871  putative lipoprotein  24.76 
 
 		 348 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0839  hypothetical protein  25.89 
 
 		 343 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00353012  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4344  putative lipoprotein  25.8 
 
 		 325 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0136809  hitchhiker  0.000000000438941 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1042  hypothetical protein  28.14 
 
 		 329 aa  91.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0925  putative lipoprotein  24.76 
 
 		 325 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1091  putative lipoprotein  25.26 
 
 		 325 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0361  hypothetical protein  30.04 
 
 		 323 aa  90.5  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.662417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3502  hypothetical protein  26.01 
 
 		 334 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.819446  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1011  putative lipoprotein  25.26 
 
 		 324 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.9236  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0482  hypothetical protein  25.08 
 
 		 337 aa  90.1  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3196  hypothetical protein  27.05 
 
 		 334 aa  89.7  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0435858  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  27.86 
 
 		 327 aa  89.7  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>