More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3933 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3933  extra-cytoplasmic solute receptor  100 
 
 		 311 aa  631  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1363  hypothetical protein  52.22 
 
 		 325 aa  318  7.999999999999999e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3342  hypothetical protein  53.09 
 
 		 326 aa  316  3e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.019229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2898  tricarboxylic transport  50.51 
 
 		 325 aa  308  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2930  tricarboxylic transport  50.51 
 
 		 325 aa  308  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.181856 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2982  tricarboxylic transport  50.17 
 
 		 325 aa  308  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.672552 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2965  tricarboxylic transport  50.17 
 
 		 325 aa  308  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443141 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3085  tricarboxylic transport  50.17 
 
 		 325 aa  308  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2581  hypothetical protein  49.48 
 
 		 323 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1457  hypothetical protein  49.09 
 
 		 325 aa  292  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1452  hypothetical protein  52.04 
 
 		 323 aa  291  9e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0154  hypothetical protein  52.24 
 
 		 326 aa  290  3e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54540  hypothetical protein  50.91 
 
 		 327 aa  288  6e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000174239  normal  0.0908275 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4433  hypothetical protein  46.58 
 
 		 325 aa  286  4e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4766  hypothetical protein  50.18 
 
 		 326 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4393  hypothetical protein  48 
 
 		 326 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1418  tricarboxylate transport protein TctC, putative  47.64 
 
 		 326 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4303  hypothetical protein  47.64 
 
 		 326 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1058  hypothetical protein  47.27 
 
 		 326 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1353  hypothetical protein  46.13 
 
 		 325 aa  275  8e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0759073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3966  hypothetical protein  47.1 
 
 		 325 aa  275  9e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.846302  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4232  TctC protein, putative  47.1 
 
 		 325 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0726  hypothetical protein  47.62 
 
 		 329 aa  272  5.000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49460  tripartite tricarboxylate transporter periplasmic receptor protein  49.28 
 
 		 327 aa  270  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0378673  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3804  hypothetical protein  47.62 
 
 		 349 aa  263  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0115718  normal  0.430416 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1825  hypothetical protein  45.02 
 
 		 346 aa  261  6.999999999999999e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0902  tricarboxylic transport  44.68 
 
 		 325 aa  261  1e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.897753  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05850  hypothetical protein  45.08 
 
 		 325 aa  258  8e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1636  TctC protein  45.76 
 
 		 321 aa  257  2e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.777278  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49490  Uncharacterized protein family UPF0065  45.32 
 
 		 325 aa  243  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00178438  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3334  hypothetical protein  48.12 
 
 		 339 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1252  hypothetical protein  38.72 
 
 		 334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.336107  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0734  hypothetical protein  38.83 
 
 		 322 aa  195  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0775704  decreased coverage  0.00137039 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  38.95 
 
 		 329 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  36.33 
 
 		 330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2824  hypothetical protein  37.87 
 
 		 321 aa  183  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0750754 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2897  hypothetical protein  37.08 
 
 		 325 aa  177  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3784  hypothetical protein  36.82 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2741  hypothetical protein  32.88 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0278237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3856  hypothetical protein  32.59 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000269594 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  31.82 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  31.23 
 
 		 330 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0861  hypothetical protein  33.58 
 
 		 322 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0872  hypothetical protein  33.21 
 
 		 322 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0855  hypothetical protein  33.21 
 
 		 322 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.769055  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  30.8 
 
 		 332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  29.22 
 
 		 319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3502  hypothetical protein  31.03 
 
 		 334 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.819446  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3004  hypothetical protein  29.79 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.033569 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  30.86 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1642  hypothetical protein  29.47 
 
 		 319 aa  116  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274465  normal  0.0446405 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2072  hypothetical protein  29.47 
 
 		 319 aa  116  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3010  hypothetical protein  30.37 
 
 		 319 aa  115  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1234  hypothetical protein  31.11 
 
 		 319 aa  115  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2518  hypothetical protein  30 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2009  hypothetical protein  30.26 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8066  hypothetical protein  32.34 
 
 		 325 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  34.09 
 
 		 328 aa  113  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  32.12 
 
 		 336 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  31.93 
 
 		 322 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  31.36 
 
 		 322 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  32.58 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02414  hypothetical protein  26.57 
 
 		 325 aa  109  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3248  hypothetical protein  30.1 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273356  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  30.88 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  30.88 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003384  putative tricarboxylic transport TctC  25.87 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  29.25 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2569  hypothetical protein  30 
 
 		 319 aa  107  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0034025 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37830  hypothetical protein  31.2 
 
 		 374 aa  107  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3313  hypothetical protein  30.37 
 
 		 314 aa  106  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  31.38 
 
 		 315 aa  106  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  30.63 
 
 		 308 aa  106  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3299  hypothetical protein  29.76 
 
 		 328 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0536538  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3237  hypothetical protein  29.76 
 
 		 328 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3011  hypothetical protein  28.2 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655008 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  28.02 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  33.48 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0596  hypothetical protein  30.45 
 
 		 336 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479944 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  29.01 
 
 		 324 aa  102  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  30.97 
 
 		 314 aa  102  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  30.86 
 
 		 314 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2078  hypothetical protein  31.5 
 
 		 341 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000784829  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  29.78 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2148  hypothetical protein  30.04 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2192  hypothetical protein  25.89 
 
 		 328 aa  99.8  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0066  hypothetical protein  31.65 
 
 		 345 aa  99  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.909485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1395  hypothetical protein  30.19 
 
 		 335 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0574924  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1873  hypothetical protein  25.54 
 
 		 326 aa  97.4  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797689  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3490  hypothetical protein  30.11 
 
 		 314 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3196  hypothetical protein  29.01 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0435858  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0241  twin-arginine translocation pathway signal  27.53 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.862974  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3931  hypothetical protein  26.8 
 
 		 320 aa  97.4  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3123  hypothetical protein  28.71 
 
 		 326 aa  95.5  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2732  hypothetical protein  28.14 
 
 		 326 aa  95.5  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2509  hypothetical protein  31.51 
 
 		 317 aa  93.2  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0752263  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1829  hypothetical protein  30.8 
 
 		 329 aa  92.8  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  0.517051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4163  hypothetical protein  29.18 
 
 		 328 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000721269  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  29.31 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5905  hypothetical protein  27.82 
 
 		 325 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.339531 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>