More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_54540 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_54540  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  663    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000174239  normal  0.0908275 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4766  hypothetical protein  96.63 
 
 
326 aa  614  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4232  TctC protein, putative  84 
 
 
325 aa  568  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3966  hypothetical protein  83.69 
 
 
325 aa  567  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.846302  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1353  hypothetical protein  84.92 
 
 
325 aa  566  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0759073  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1418  tricarboxylate transport protein TctC, putative  85.58 
 
 
326 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930091  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4393  hypothetical protein  85.58 
 
 
326 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4303  hypothetical protein  85.58 
 
 
326 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1058  hypothetical protein  85.28 
 
 
326 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49460  tripartite tricarboxylate transporter periplasmic receptor protein  78.55 
 
 
327 aa  499  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0378673  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1457  hypothetical protein  67.18 
 
 
325 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05850  hypothetical protein  65.03 
 
 
325 aa  447  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49490  Uncharacterized protein family UPF0065  68.21 
 
 
325 aa  446  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00178438  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1363  hypothetical protein  62.58 
 
 
325 aa  421  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2581  hypothetical protein  61.51 
 
 
323 aa  422  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2930  tricarboxylic transport  60.57 
 
 
325 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.181856 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2898  tricarboxylic transport  60.57 
 
 
325 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3342  hypothetical protein  62.05 
 
 
326 aa  412  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.019229  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2982  tricarboxylic transport  60.25 
 
 
325 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.672552 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3085  tricarboxylic transport  60.25 
 
 
325 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2965  tricarboxylic transport  60.25 
 
 
325 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443141 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0154  hypothetical protein  57.85 
 
 
326 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1825  hypothetical protein  58.47 
 
 
346 aa  382  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1636  TctC protein  56.44 
 
 
321 aa  373  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.777278  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0902  tricarboxylic transport  51.85 
 
 
325 aa  343  2e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.897753  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0726  hypothetical protein  52.81 
 
 
329 aa  330  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4433  hypothetical protein  47.55 
 
 
325 aa  318  9e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1452  hypothetical protein  50 
 
 
323 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3933  extra-cytoplasmic solute receptor  50.52 
 
 
311 aa  295  6e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3334  hypothetical protein  50 
 
 
339 aa  279  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3804  hypothetical protein  42.81 
 
 
349 aa  268  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0115718  normal  0.430416 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0734  hypothetical protein  42.86 
 
 
322 aa  252  6e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0775704  decreased coverage  0.00137039 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2824  hypothetical protein  42.07 
 
 
321 aa  250  3e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0750754 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1252  hypothetical protein  39.81 
 
 
334 aa  238  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.336107  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  40.3 
 
 
329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  38.37 
 
 
330 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2897  hypothetical protein  37.46 
 
 
325 aa  193  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3784  hypothetical protein  35.91 
 
 
327 aa  185  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3856  hypothetical protein  33.33 
 
 
331 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000269594 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  34.13 
 
 
330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0861  hypothetical protein  32.99 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0872  hypothetical protein  32.65 
 
 
322 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0855  hypothetical protein  32.65 
 
 
322 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.769055  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  30.98 
 
 
311 aa  142  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  32.46 
 
 
346 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  31.56 
 
 
315 aa  140  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2741  hypothetical protein  30.52 
 
 
321 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0278237  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  30.91 
 
 
323 aa  136  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  33.33 
 
 
332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  31.1 
 
 
313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  31.77 
 
 
314 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  32.37 
 
 
332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3502  hypothetical protein  30.58 
 
 
334 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.819446  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8066  hypothetical protein  32.57 
 
 
325 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003384  putative tricarboxylic transport TctC  29.32 
 
 
323 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1873  hypothetical protein  29.77 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797689  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  31.44 
 
 
314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3004  hypothetical protein  31.27 
 
 
332 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.033569 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  31.44 
 
 
314 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  31.44 
 
 
314 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37830  hypothetical protein  29.7 
 
 
374 aa  126  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  29.14 
 
 
324 aa  126  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3313  hypothetical protein  29.75 
 
 
314 aa  126  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  30.75 
 
 
316 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3490  hypothetical protein  30.77 
 
 
314 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970248  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02414  hypothetical protein  28.66 
 
 
325 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2192  hypothetical protein  28.61 
 
 
328 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1006  tricarboxylate-binding protein  27.74 
 
 
322 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0241  twin-arginine translocation pathway signal  30.58 
 
 
332 aa  124  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.862974  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1011  putative lipoprotein  27.12 
 
 
324 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.9236  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0967  tricarboxylate-binding protein  27.74 
 
 
323 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  29.25 
 
 
319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3428  hypothetical protein  28.31 
 
 
337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.10884 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0813  hypothetical protein  27.4 
 
 
322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0839  hypothetical protein  27.49 
 
 
343 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00353012  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3010  hypothetical protein  31.21 
 
 
319 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  30.3 
 
 
322 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2509  hypothetical protein  31 
 
 
317 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0752263  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  30.45 
 
 
308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2078  hypothetical protein  29.7 
 
 
341 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000784829  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2148  hypothetical protein  28.9 
 
 
330 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2569  hypothetical protein  28.88 
 
 
319 aa  119  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0034025 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1091  putative lipoprotein  27.34 
 
 
325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4344  putative lipoprotein  25.94 
 
 
325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0136809  hitchhiker  0.000000000438941 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0871  putative lipoprotein  26.64 
 
 
348 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0925  putative lipoprotein  26.64 
 
 
325 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2009  hypothetical protein  29.53 
 
 
319 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0066  hypothetical protein  29.53 
 
 
345 aa  117  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.909485 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1829  hypothetical protein  25.37 
 
 
329 aa  116  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  0.517051 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  35.32 
 
 
322 aa  116  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0596  hypothetical protein  29.19 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3248  hypothetical protein  28.02 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273356  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  28.43 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1234  hypothetical protein  30.13 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  29.63 
 
 
328 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2229  hypothetical protein  28.03 
 
 
349 aa  114  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2795  hypothetical protein  27.44 
 
 
341 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.687935  normal  0.0471733 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0998  hypothetical protein  29 
 
 
333 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4493  hypothetical protein  26.45 
 
 
341 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3299  hypothetical protein  27.73 
 
 
328 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0536538  normal  0.0349575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>