More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0726 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0726  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  668    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1457  hypothetical protein  56.01 
 
 		 325 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0154  hypothetical protein  54.28 
 
 		 326 aa  347  1e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1363  hypothetical protein  52.06 
 
 		 325 aa  345  5e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2930  tricarboxylic transport  52.58 
 
 		 325 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.181856 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2898  tricarboxylic transport  52.58 
 
 		 325 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3085  tricarboxylic transport  52.26 
 
 		 325 aa  342  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2982  tricarboxylic transport  52.26 
 
 		 325 aa  342  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.672552 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0902  tricarboxylic transport  50.16 
 
 		 325 aa  342  4e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.897753  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2965  tricarboxylic transport  52.26 
 
 		 325 aa  342  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443141 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2581  hypothetical protein  49.84 
 
 		 323 aa  339  4e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1353  hypothetical protein  51.22 
 
 		 325 aa  339  4e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0759073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4433  hypothetical protein  51.27 
 
 		 325 aa  335  5e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3342  hypothetical protein  51.53 
 
 		 326 aa  331  9e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.019229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3966  hypothetical protein  50.63 
 
 		 325 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.846302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1636  TctC protein  52.7 
 
 		 321 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.777278  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4232  TctC protein, putative  50.32 
 
 		 325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1058  hypothetical protein  50.78 
 
 		 326 aa  326  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1418  tricarboxylate transport protein TctC, putative  52.19 
 
 		 326 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4303  hypothetical protein  52.19 
 
 		 326 aa  325  5e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4393  hypothetical protein  51.85 
 
 		 326 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4766  hypothetical protein  52.32 
 
 		 326 aa  322  4e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1825  hypothetical protein  51.02 
 
 		 346 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49460  tripartite tricarboxylate transporter periplasmic receptor protein  51.15 
 
 		 327 aa  314  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0378673  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54540  hypothetical protein  53.54 
 
 		 327 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000174239  normal  0.0908275 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1452  hypothetical protein  45.71 
 
 		 323 aa  300  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05850  hypothetical protein  44.94 
 
 		 325 aa  293  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49490  Uncharacterized protein family UPF0065  45.33 
 
 		 325 aa  293  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00178438  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3933  extra-cytoplasmic solute receptor  46.58 
 
 		 311 aa  278  9e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0734  hypothetical protein  46.26 
 
 		 322 aa  278  1e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0775704  decreased coverage  0.00137039 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2824  hypothetical protein  46.13 
 
 		 321 aa  274  1.0000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0750754 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3334  hypothetical protein  45.48 
 
 		 339 aa  266  5e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  45.12 
 
 		 329 aa  256  4e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3804  hypothetical protein  43.05 
 
 		 349 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0115718  normal  0.430416 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1252  hypothetical protein  42.07 
 
 		 334 aa  253  5.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.336107  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  40.49 
 
 		 330 aa  249  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2897  hypothetical protein  41.47 
 
 		 325 aa  227  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3856  hypothetical protein  35.65 
 
 		 331 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000269594 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3784  hypothetical protein  36.88 
 
 		 327 aa  196  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  35.1 
 
 		 346 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  30.91 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  33.11 
 
 		 313 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  34.13 
 
 		 314 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3490  hypothetical protein  33.79 
 
 		 314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  31.45 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0066  hypothetical protein  33.56 
 
 		 345 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.909485 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3313  hypothetical protein  33.11 
 
 		 314 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  32.08 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  32.89 
 
 		 322 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  30.17 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37830  hypothetical protein  29.9 
 
 		 374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3004  hypothetical protein  32.19 
 
 		 332 aa  136  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.033569 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02414  hypothetical protein  27.67 
 
 		 325 aa  136  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  30.72 
 
 		 316 aa  135  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  31.86 
 
 		 314 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3248  hypothetical protein  31.25 
 
 		 328 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273356  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  32.08 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  31.86 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  30.89 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2192  hypothetical protein  28.12 
 
 		 328 aa  134  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3299  hypothetical protein  31.25 
 
 		 328 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0536538  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3237  hypothetical protein  31.25 
 
 		 328 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  29.87 
 
 		 311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003384  putative tricarboxylic transport TctC  27.67 
 
 		 323 aa  132  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8066  hypothetical protein  30.17 
 
 		 325 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0872  hypothetical protein  32.07 
 
 		 322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0861  hypothetical protein  32.07 
 
 		 322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0855  hypothetical protein  32.07 
 
 		 322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.769055  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2009  hypothetical protein  30.9 
 
 		 319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2148  hypothetical protein  30.17 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1873  hypothetical protein  27.89 
 
 		 326 aa  129  6e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797689  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3502  hypothetical protein  29.78 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.819446  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1642  hypothetical protein  28.38 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274465  normal  0.0446405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2741  hypothetical protein  31.39 
 
 		 321 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0278237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1234  hypothetical protein  31.97 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2072  hypothetical protein  28.38 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2569  hypothetical protein  30.79 
 
 		 319 aa  126  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0034025 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1829  hypothetical protein  27.18 
 
 		 329 aa  126  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  0.517051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4163  hypothetical protein  29.01 
 
 		 328 aa  125  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000721269  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  27.91 
 
 		 319 aa  125  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  30.14 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2078  hypothetical protein  30.16 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000784829  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2509  hypothetical protein  30.74 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0752263  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  30.23 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2518  hypothetical protein  27.36 
 
 		 319 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3010  hypothetical protein  27.55 
 
 		 319 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1042  hypothetical protein  30.1 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00840  hypothetical protein  28.18 
 
 		 335 aa  119  4.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0173913  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5905  hypothetical protein  28.18 
 
 		 325 aa  119  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.339531 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  26.42 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  33.33 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3489  hypothetical protein  29.29 
 
 		 324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0361  hypothetical protein  30.19 
 
 		 323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.662417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  30.74 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3625  hypothetical protein  28.48 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  30.03 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  30.03 
 
 		 324 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  30.03 
 
 		 324 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2026  hypothetical protein  26.71 
 
 		 337 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0845932  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  29.07 
 
 		 322 aa  116  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>