More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3429 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  649    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  85.71 
 
 		 322 aa  531  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2009  hypothetical protein  60.69 
 
 		 319 aa  343  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  54.66 
 
 		 319 aa  341  9e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1234  hypothetical protein  58.06 
 
 		 319 aa  341  9e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1642  hypothetical protein  61.03 
 
 		 319 aa  341  1e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274465  normal  0.0446405 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2072  hypothetical protein  61.03 
 
 		 319 aa  341  1e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3010  hypothetical protein  59.66 
 
 		 319 aa  337  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2518  hypothetical protein  59.66 
 
 		 319 aa  334  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2569  hypothetical protein  56.77 
 
 		 319 aa  332  8e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0034025 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3011  hypothetical protein  57.59 
 
 		 319 aa  315  7e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655008 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  48 
 
 		 324 aa  301  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  50 
 
 		 308 aa  299  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  47.78 
 
 		 311 aa  281  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  48.25 
 
 		 314 aa  278  6e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  47.57 
 
 		 314 aa  275  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  48.29 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  48.22 
 
 		 314 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3313  hypothetical protein  46.03 
 
 		 314 aa  271  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  48.22 
 
 		 314 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  47.19 
 
 		 316 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  47.2 
 
 		 314 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  47.9 
 
 		 313 aa  264  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3490  hypothetical protein  46.85 
 
 		 314 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  46.76 
 
 		 315 aa  263  3e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8066  hypothetical protein  45.02 
 
 		 325 aa  252  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2012  twin-arginine translocation pathway signal  43.59 
 
 		 341 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0066  hypothetical protein  43.58 
 
 		 345 aa  246  4e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.909485 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5058  hypothetical protein  39.49 
 
 		 358 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.566129  normal  0.354156 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5905  hypothetical protein  41.19 
 
 		 325 aa  239  5.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.339531 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1237  hypothetical protein  40.66 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.462545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0361  hypothetical protein  43.3 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.662417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3704  hypothetical protein  43.05 
 
 		 328 aa  236  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4163  hypothetical protein  42.68 
 
 		 328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000721269  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2509  hypothetical protein  42.86 
 
 		 317 aa  232  5e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0752263  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3625  hypothetical protein  42.27 
 
 		 339 aa  225  7e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3075  hypothetical protein  40.51 
 
 		 323 aa  220  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1829  hypothetical protein  37.42 
 
 		 329 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  0.517051 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2148  hypothetical protein  41.67 
 
 		 330 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37830  hypothetical protein  40.41 
 
 		 374 aa  212  7.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4958  hypothetical protein  38.97 
 
 		 319 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3004  hypothetical protein  36.43 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.033569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3502  hypothetical protein  36.43 
 
 		 334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.819446  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3248  hypothetical protein  34.77 
 
 		 328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273356  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3299  hypothetical protein  34.77 
 
 		 328 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0536538  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3237  hypothetical protein  34.77 
 
 		 328 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3102  hypothetical protein  37.67 
 
 		 338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.571018 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0596  hypothetical protein  37.33 
 
 		 336 aa  189  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479944 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1395  hypothetical protein  37.33 
 
 		 335 aa  189  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0574924  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0323  hypothetical protein  34.65 
 
 		 331 aa  179  7e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1042  hypothetical protein  34.58 
 
 		 329 aa  178  9e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  34.95 
 
 		 346 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0998  hypothetical protein  31.62 
 
 		 333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02414  hypothetical protein  32.38 
 
 		 325 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00840  hypothetical protein  32.1 
 
 		 335 aa  169  7e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0173913  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003384  putative tricarboxylic transport TctC  32.7 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  33.73 
 
 		 330 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  31.31 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3489  hypothetical protein  33.45 
 
 		 324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2192  hypothetical protein  31.45 
 
 		 328 aa  163  5.0000000000000005e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1873  hypothetical protein  30.06 
 
 		 326 aa  160  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797689  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  35.43 
 
 		 336 aa  155  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3123  hypothetical protein  29.93 
 
 		 326 aa  152  7e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  32.73 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2732  hypothetical protein  30.17 
 
 		 326 aa  150  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2741  hypothetical protein  29.77 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0278237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  33.11 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0873  hypothetical protein  30.25 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3099  hypothetical protein  30.25 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0901  hypothetical protein  30.25 
 
 		 317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3435  hypothetical protein  30.25 
 
 		 317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.636494  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0925  hypothetical protein  30.25 
 
 		 317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.524752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0935  hypothetical protein  29.94 
 
 		 317 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6270  putative tricarboxylic transport membrane protein  30.07 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0141318 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5629  periplasmic tricarboxylate binding receptor (TctC)  29.39 
 
 		 333 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2117  hypothetical protein  34.45 
 
 		 320 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.820451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0726  hypothetical protein  32.89 
 
 		 329 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1825  hypothetical protein  33.56 
 
 		 346 aa  137  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0861  hypothetical protein  31.86 
 
 		 322 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1853  hypothetical protein  29.17 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2026  hypothetical protein  28.87 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0845932  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3856  hypothetical protein  30.32 
 
 		 331 aa  132  7.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000269594 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0734  hypothetical protein  31.62 
 
 		 322 aa  132  9e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0775704  decreased coverage  0.00137039 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  31.87 
 
 		 329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3428  hypothetical protein  29.46 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.10884 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2040  hypothetical protein  34.48 
 
 		 332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0456371 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  30.2 
 
 		 322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1058  hypothetical protein  30.82 
 
 		 326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  29.5 
 
 		 330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0241  twin-arginine translocation pathway signal  29.24 
 
 		 332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.862974  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  33.46 
 
 		 336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0872  hypothetical protein  31.19 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0855  hypothetical protein  31.19 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.769055  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5726  hypothetical protein  27.49 
 
 		 328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00555624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1252  hypothetical protein  30.16 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.336107  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  32.61 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1353  hypothetical protein  29.09 
 
 		 325 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0759073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1636  TctC protein  31.49 
 
 		 321 aa  126  5e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.777278  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4493  hypothetical protein  30.56 
 
 		 341 aa  126  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2824  hypothetical protein  30.58 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0750754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>